48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4373 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  54.16 
 
 		 812 aa  690    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  74.59 
 
 		 838 aa  1050    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  68.63 
 
 		 844 aa  1066    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  100 
 
 		 825 aa  1639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  68.63 
 
 		 847 aa  1066    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  50.19 
 
 		 824 aa  721    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  68.63 
 
 		 847 aa  1066    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  39.44 
 
 		 497 aa  259  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  41.69 
 
 		 761 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  22.54 
 
 		 413 aa  111  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  36.67 
 
 		 719 aa  77.8  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  30.59 
 
 		 707 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  37.12 
 
 		 701 aa  76.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  36.36 
 
 		 702 aa  75.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  29.58 
 
 		 741 aa  75.5  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  32.05 
 
 		 714 aa  73.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  36.09 
 
 		 698 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  28.78 
 
 		 720 aa  72.8  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  37.31 
 
 		 697 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3231  sterol-regulatory element binding protein  24.65 
 
 		 235 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.329955  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  31.72 
 
 		 699 aa  71.2  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  30 
 
 		 688 aa  70.5  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  35.88 
 
 		 701 aa  70.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  31.85 
 
 		 736 aa  69.7  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  31.36 
 
 		 696 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  26.77 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  27.93 
 
 		 715 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  27.18 
 
 		 715 aa  67.8  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  35.61 
 
 		 703 aa  68.2  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  31.03 
 
 		 709 aa  67.8  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  24.73 
 
 		 715 aa  63.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  32.56 
 
 		 709 aa  62  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  31.01 
 
 		 709 aa  62.4  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  32.5 
 
 		 701 aa  61.6  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  24.52 
 
 		 714 aa  60.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  30.58 
 
 		 720 aa  59.7  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  28.47 
 
 		 720 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  30 
 
 		 721 aa  58.2  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  25.23 
 
 		 1177 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  33.81 
 
 		 398 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  24.18 
 
 		 1124 aa  54.3  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  29.05 
 
 		 715 aa  53.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  29.02 
 
 		 367 aa  51.6  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  27.19 
 
 		 948 aa  51.2  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  26.85 
 
 		 1171 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  25.2 
 
 		 350 aa  48.1  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  26.47 
 
 		 711 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  46.6  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>