184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1762 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  100 
 
 
360 aa  725    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  69.17 
 
 
360 aa  501  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05816  hypothetical protein  71.11 
 
 
382 aa  478  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000182  Zn-dependent protease  69.17 
 
 
360 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.273834  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0595  peptidase M50  64.17 
 
 
374 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4142  peptidase M50  64.81 
 
 
380 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.452732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3980  peptidase M50  64.64 
 
 
390 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0823  hypothetical protein  63.98 
 
 
374 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3275  peptidase M50  64.52 
 
 
374 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.01208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3453  peptidase M50  64.52 
 
 
374 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.444039  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0672  peptidase M50  63.71 
 
 
389 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0458569 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3232  peptidase M50  65.93 
 
 
392 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0537  peptidase M50  62.17 
 
 
378 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3167  peptidase M50  63.17 
 
 
378 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0566  hypothetical protein  61.81 
 
 
370 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3533  peptidase M50  62.57 
 
 
380 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0103941  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0803  peptidase M50  62.57 
 
 
380 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0828  peptidase M50  62.57 
 
 
380 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000017367 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0835  peptidase M50  62.57 
 
 
380 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2980  peptidase M50  60.91 
 
 
393 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0270746  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0686  peptidase M50  60.11 
 
 
390 aa  411  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.393797  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0786  M50 family peptidase  57.68 
 
 
344 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0883958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3312  gamma-glutamyl phosphate reductase GPR  34.91 
 
 
364 aa  200  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3701  peptidase M50  37.39 
 
 
484 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3580  peptidase M50  35.09 
 
 
489 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3720  peptidase M50  36.63 
 
 
485 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3646  peptidase M50  36.76 
 
 
485 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.415625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  29 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  28.29 
 
 
293 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1355  hypothetical protein  35.29 
 
 
365 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1329  membrane metalloprotease  35.29 
 
 
365 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1465  hypothetical protein  35.29 
 
 
365 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1608  hypothetical protein  33.17 
 
 
365 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1538  hypothetical protein  35.29 
 
 
365 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000573699 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1570  hypothetical protein  34.91 
 
 
365 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0569959  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3843  hypothetical protein  35.29 
 
 
365 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0912094  hitchhiker  0.00000000235959 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1166  peptidase M50  32.62 
 
 
366 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1502  hypothetical protein  35.29 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1328  membrane metalloprotease  32.67 
 
 
365 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.826194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1370  peptidase M50  34.12 
 
 
365 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00911747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4579  peptidase M50  35.2 
 
 
305 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  33.76 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  33.58 
 
 
375 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  32.32 
 
 
364 aa  77  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  32.84 
 
 
368 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  33.78 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  35.44 
 
 
375 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0558  peptidase M50  34.82 
 
 
372 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463996  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  40.91 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  31.33 
 
 
376 aa  69.3  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49052  predicted protein  24.89 
 
 
386 aa  69.3  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.735615  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  30.07 
 
 
362 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  30.19 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  30.88 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  33.6 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2595  peptidase M50  29.84 
 
 
337 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  30.95 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  31.72 
 
 
374 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  33.33 
 
 
415 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2396  peptidase M50  30.16 
 
 
239 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311276  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  34.38 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4945  peptidase M50  30.71 
 
 
241 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365281  normal  0.0922667 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  32 
 
 
380 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3043  peptidase M50  30.71 
 
 
241 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5323  peptidase M50  30.71 
 
 
241 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  29.61 
 
 
372 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  32 
 
 
380 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  31.62 
 
 
361 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  33.33 
 
 
373 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2524  hypothetical protein  29.92 
 
 
241 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445127  hitchhiker  0.00571488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  30.06 
 
 
413 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0669  stage IV sporulation protein FB  28.57 
 
 
286 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000475668  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  34.15 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  31.25 
 
 
366 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  28.4 
 
 
337 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  29.03 
 
 
390 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  30.72 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0326  peptidase M50  30 
 
 
241 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264818  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  25.16 
 
 
379 aa  62  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  29.23 
 
 
379 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  31.67 
 
 
386 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  28.4 
 
 
342 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4292  peptidase M50  31.02 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  36.11 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  36.04 
 
 
380 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  28.99 
 
 
338 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  30.63 
 
 
343 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  34.96 
 
 
393 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  30.83 
 
 
383 aa  60.1  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4681  peptidase M50  29.29 
 
 
241 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314846  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5208  peptidase M50  29.29 
 
 
241 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.125374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  28.76 
 
 
258 aa  59.7  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  28.07 
 
 
336 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  28.48 
 
 
293 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  31.11 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  28.49 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  33.56 
 
 
370 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  29.47 
 
 
417 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  29.47 
 
 
417 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  34.18 
 
 
396 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>