17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3230 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3230  sterol-regulatory element binding protein  100 
 
 
171 aa  349  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  98.83 
 
 
413 aa  348  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  30.53 
 
 
719 aa  54.7  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  39.29 
 
 
697 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  38.89 
 
 
709 aa  50.8  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  50 
 
 
688 aa  50.8  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  43.48 
 
 
720 aa  48.5  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  47.83 
 
 
714 aa  48.1  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  35.48 
 
 
703 aa  48.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  27.88 
 
 
699 aa  47.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  29.57 
 
 
715 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  37.93 
 
 
720 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  22.12 
 
 
698 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  23.76 
 
 
696 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  36.73 
 
 
701 aa  42  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  41.67 
 
 
474 aa  42  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  23.93 
 
 
720 aa  41.6  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0961426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>