66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0172 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0172  peptidase M50  100 
 
 
518 aa  1030    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0248  peptidase M50  36.45 
 
 
584 aa  351  2e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000540477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3114  sterol-regulatory element-binding protein intramembrane protease  36.43 
 
 
598 aa  331  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.896096  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1508  peptidase M50  29.41 
 
 
612 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3477  peptidase M50  27.24 
 
 
607 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1973  peptidase M50  30.24 
 
 
603 aa  173  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.246801  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1683  peptidase M50  28.74 
 
 
623 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.200321  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1292  peptidase M50  27.53 
 
 
587 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.894825  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0964  peptidase M50  28.86 
 
 
459 aa  154  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1487  hypothetical protein  26.95 
 
 
441 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000349158  normal  0.0156065 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0314  peptidase M50  26.3 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1215  peptidase M50  28.85 
 
 
430 aa  127  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.285104  normal  0.0156035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1942  peptidase M50  35.79 
 
 
432 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.718786 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0083  peptidase M50  34.68 
 
 
616 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0503  peptidase M50  37.64 
 
 
443 aa  101  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0864  peptidase M50  28.12 
 
 
380 aa  76.6  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0781  peptidase M50  29.73 
 
 
375 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1506  peptidase M50  30.13 
 
 
375 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1066  peptidase M50  30 
 
 
364 aa  62.4  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1169  peptidase M50  29.09 
 
 
375 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0845  peptidase M50  34.81 
 
 
418 aa  58.9  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.450162  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0107  peptidase M50  21.01 
 
 
398 aa  59.3  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000498394 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2238  peptidase M50  24.01 
 
 
502 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.577346  normal  0.574396 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1174  peptidase M50  27.38 
 
 
375 aa  57  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2160  peptidase M50  27.56 
 
 
362 aa  55.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000514306 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1380  peptidase M50  31.1 
 
 
388 aa  55.1  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.338907  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2728  membrane-associated zinc metalloprotease  26.2 
 
 
362 aa  54.7  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  21.97 
 
 
452 aa  53.5  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  27.68 
 
 
376 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  23.52 
 
 
454 aa  52  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0717  peptidase M50  34.65 
 
 
497 aa  51.6  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1696  peptidase M50  33.63 
 
 
509 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.156328 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.49 
 
 
441 aa  50.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  21.9 
 
 
466 aa  50.1  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  24.42 
 
 
450 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  31.15 
 
 
701 aa  48.5  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  31.15 
 
 
707 aa  47.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.95 
 
 
450 aa  47  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  26.96 
 
 
394 aa  47  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1073  zinc metallopeptidase RseP  23.33 
 
 
451 aa  47  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00125076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1020  zinc metallopeptidase RseP  23.33 
 
 
451 aa  47  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  19.67 
 
 
439 aa  47  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0618  peptidase M50  33.01 
 
 
502 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  22.73 
 
 
337 aa  45.8  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3428  zinc metallopeptidase RseP  23.09 
 
 
451 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000803412  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  21.49 
 
 
452 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  21.49 
 
 
452 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  22.87 
 
 
463 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  20.32 
 
 
456 aa  45.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  24.2 
 
 
451 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  22.64 
 
 
444 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.06 
 
 
456 aa  45.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  30.33 
 
 
701 aa  44.3  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  22.57 
 
 
458 aa  44.3  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  25.99 
 
 
474 aa  43.9  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2050  peptidase M50  23.04 
 
 
444 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0906941  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  20.14 
 
 
456 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  20.92 
 
 
456 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  23.49 
 
 
451 aa  43.5  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  22.63 
 
 
373 aa  43.5  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  22.79 
 
 
450 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  22.79 
 
 
450 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  22.79 
 
 
450 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  22.79 
 
 
450 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.44 
 
 
558 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  32.53 
 
 
702 aa  43.5  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>