More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0266 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0266  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0254  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.53 
 
 		 417 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  48.79 
 
 		 417 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  41.46 
 
 		 407 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  42.86 
 
 		 405 aa  144  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0820  secretion protein HlyD family protein  43.35 
 
 		 342 aa  142  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.495738  hitchhiker  0.000581546 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1756  acriflavin resistance protein  47.83 
 
 		 363 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0637221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  35.41 
 
 		 402 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  34.3 
 
 		 407 aa  102  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  40 
 
 		 450 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.40893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  32.56 
 
 		 406 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0231  RND family efflux transporter MFP subunit  41.18 
 
 		 401 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  36.65 
 
 		 404 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0631  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.74 
 
 		 432 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0223  RND family efflux transporter MFP subunit  41.18 
 
 		 401 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0207  RND family efflux transporter MFP subunit  41.18 
 
 		 400 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000100142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3403  HlyD family secretion protein  41.18 
 
 		 401 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00376035  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  36 
 
 		 404 aa  95.9  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5856  secretion protein HlyD  34.27 
 
 		 425 aa  95.9  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249167  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  40.34 
 
 		 401 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  hitchhiker  0.000000766037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2802  secretion protein HlyD  40.34 
 
 		 401 aa  95.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0304  RND family efflux transporter MFP subunit  40.34 
 
 		 401 aa  95.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.58 
 
 		 404 aa  92.4  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  36.65 
 
 		 416 aa  91.3  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.58 
 
 		 405 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2020  secretion protein HlyD family protein  34.39 
 
 		 357 aa  89.4  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.519564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  35.37 
 
 		 405 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  28.72 
 
 		 471 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.13 
 
 		 432 aa  65.5  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  28.26 
 
 		 380 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.01 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.72 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.72 
 
 		 504 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  25.69 
 
 		 408 aa  62  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.33 
 
 		 379 aa  62  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  26.06 
 
 		 461 aa  62  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  27.15 
 
 		 369 aa  61.6  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2261  secretion protein HlyD family protein  27.32 
 
 		 408 aa  61.6  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0232169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  25.69 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  27.07 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  27.21 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  25.82 
 
 		 417 aa  59.3  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6178  RND family efflux transporter MFP subunit  27.67 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 453 aa  58.9  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  28.95 
 
 		 363 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1596  secretion protein HlyD family protein  27.23 
 
 		 420 aa  58.9  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  26.4 
 
 		 364 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  27.39 
 
 		 500 aa  58.2  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.85 
 
 		 432 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0236  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.94922  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  29.29 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  26.53 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  26.53 
 
 		 373 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  26.53 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  26.29 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.57 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  30.63 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2583  secretion protein HlyD family protein  27.89 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.860708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.26 
 
 		 512 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  26.89 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  26.06 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.84 
 
 		 426 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.07 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  30.14 
 
 		 424 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  29.56 
 
 		 621 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.93 
 
 		 421 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.93 
 
 		 421 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.03 
 
 		 377 aa  55.5  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  29.81 
 
 		 402 aa  55.5  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2439  RND family efflux transporter MFP subunit  27.62 
 
 		 338 aa  55.1  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000111994  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1423  RND family efflux transporter MFP subunit  26.15 
 
 		 401 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  28.18 
 
 		 403 aa  55.1  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1666  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.95 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2754  RND efflux transporter  26.15 
 
 		 401 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226253  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  29.41 
 
 		 388 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.33 
 
 		 388 aa  54.7  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  25.17 
 
 		 372 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.67 
 
 		 460 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.64 
 
 		 399 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003356  multidrug resistance efflux pump  33.07 
 
 		 271 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000276837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4033  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.95 
 
 		 396 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  27.61 
 
 		 393 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.33 
 
 		 427 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.64 
 
 		 398 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  25.6 
 
 		 399 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  25.81 
 
 		 427 aa  53.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1312  RND efflux transporter  26.15 
 
 		 401 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130358  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0664  RND family efflux transporter MFP subunit  26.26 
 
 		 342 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.295272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  23.44 
 
 		 354 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 		 375 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  25.18 
 
 		 405 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  28.93 
 
 		 421 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  29.13 
 
 		 489 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.62 
 
 		 368 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.73 
 
 		 490 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 345 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  29.06 
 
 		 401 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  30.14 
 
 		 394 aa  52.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  28.07 
 
 		 397 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.14 
 
 		 400 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>