87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1506 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1506  peptidase M50  100 
 
 
375 aa  750    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1169  peptidase M50  92.8 
 
 
375 aa  704    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0781  peptidase M50  94.13 
 
 
375 aa  710    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1174  peptidase M50  77.87 
 
 
375 aa  587  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1380  peptidase M50  56.41 
 
 
388 aa  413  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.338907  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0845  peptidase M50  28.41 
 
 
418 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.450162  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0864  peptidase M50  26.32 
 
 
380 aa  94  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1066  peptidase M50  29.1 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0314  peptidase M50  26.84 
 
 
512 aa  70.1  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0964  peptidase M50  25.67 
 
 
459 aa  69.7  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0503  peptidase M50  32.52 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3114  sterol-regulatory element-binding protein intramembrane protease  24.15 
 
 
598 aa  62.8  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.896096  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0248  peptidase M50  25.13 
 
 
584 aa  59.7  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000540477  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0107  peptidase M50  25.76 
 
 
398 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000498394 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0172  peptidase M50  30.13 
 
 
518 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1487  hypothetical protein  26.32 
 
 
441 aa  57.8  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000349158  normal  0.0156065 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3477  peptidase M50  25.33 
 
 
607 aa  57.4  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  22.83 
 
 
337 aa  56.6  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  22.42 
 
 
345 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1683  peptidase M50  28.57 
 
 
623 aa  53.9  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.200321  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  27.6 
 
 
354 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  29.85 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0260  peptidase M50  32.28 
 
 
496 aa  52.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  23.55 
 
 
418 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  30.71 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30 
 
 
355 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  30 
 
 
354 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1215  peptidase M50  20.39 
 
 
430 aa  50.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.285104  normal  0.0156035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  28.86 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.55 
 
 
418 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  28.86 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  27.43 
 
 
428 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  28.57 
 
 
353 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1942  peptidase M50  25.95 
 
 
432 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.718786 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.14 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  27.35 
 
 
438 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  32.86 
 
 
1124 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0717  peptidase M50  37.62 
 
 
497 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.44 
 
 
354 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  24.18 
 
 
348 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0618  peptidase M50  34.21 
 
 
502 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1973  peptidase M50  29.71 
 
 
603 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.246801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  23.14 
 
 
420 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.14 
 
 
418 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.14 
 
 
418 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  23.14 
 
 
420 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  23.14 
 
 
420 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16631  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  28 
 
 
361 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.24545  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  23.14 
 
 
420 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  23.14 
 
 
420 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1696  peptidase M50  38.1 
 
 
509 aa  47  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.156328 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0808  hypothetical protein  29.07 
 
 
361 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.52114  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  27.43 
 
 
342 aa  47  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1351  peptidase M50  22.81 
 
 
416 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  27.81 
 
 
355 aa  46.6  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  27.12 
 
 
383 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2238  peptidase M50  35.19 
 
 
502 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.577346  normal  0.574396 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  24.38 
 
 
356 aa  46.6  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.44 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  27.07 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  31.43 
 
 
353 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  22.01 
 
 
348 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1303  peptidase M50  21.49 
 
 
416 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  34.92 
 
 
696 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.85 
 
 
375 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  27.27 
 
 
430 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1797  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.9 
 
 
479 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.88903  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.89 
 
 
343 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  30.3 
 
 
358 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.08 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1508  peptidase M50  44.19 
 
 
612 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1444  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.2 
 
 
379 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  26.42 
 
 
337 aa  43.9  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0083  peptidase M50  28.19 
 
 
616 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  25.87 
 
 
377 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  26.21 
 
 
448 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  30.05 
 
 
461 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1279  putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.15 
 
 
456 aa  43.9  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.253686  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  25.87 
 
 
375 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.19 
 
 
355 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  23.5 
 
 
370 aa  43.5  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4430  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.88 
 
 
338 aa  43.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.23 
 
 
366 aa  43.1  0.008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  36 
 
 
286 aa  42.7  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  29.58 
 
 
395 aa  43.1  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.41 
 
 
444 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  25 
 
 
374 aa  42.7  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>