268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0792 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 		 353 aa  682    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  57.59 
 
 		 395 aa  366  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  54.96 
 
 		 373 aa  340  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  52.87 
 
 		 441 aa  325  8.000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  51.06 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  45.73 
 
 		 342 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  46.44 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  42.31 
 
 		 348 aa  250  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  45.3 
 
 		 383 aa  249  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40.92 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  40.06 
 
 		 348 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  43.53 
 
 		 357 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  38.33 
 
 		 350 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  38.22 
 
 		 347 aa  222  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.86 
 
 		 348 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.81 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  42.77 
 
 		 353 aa  212  9e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  41.95 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.62 
 
 		 354 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  41.05 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.13 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  41.4 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  37.75 
 
 		 381 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  39.88 
 
 		 342 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  39.88 
 
 		 342 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  39.88 
 
 		 345 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  39.24 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.91 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.57 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  38.27 
 
 		 340 aa  179  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  36.7 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  39.38 
 
 		 338 aa  173  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  35.35 
 
 		 359 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  36.63 
 
 		 355 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  35.58 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  37.69 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  59.23 
 
 		 293 aa  153  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  57.5 
 
 		 295 aa  145  9e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.35 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.38 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  30.03 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  30.31 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  30.03 
 
 		 340 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  29.75 
 
 		 340 aa  132  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  30.03 
 
 		 340 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  29.75 
 
 		 340 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.83 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  30.31 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  29.86 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  29.86 
 
 		 347 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.28 
 
 		 341 aa  126  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.06 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.36 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  30.05 
 
 		 358 aa  87.4  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  27.9 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  26.74 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  27.33 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  29.05 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  25.51 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  24.91 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  42.27 
 
 		 799 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1838  ATP-dependent protease La  31.03 
 
 		 805 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203387  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  41.84 
 
 		 804 aa  57  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 805 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  32.73 
 
 		 670 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 797 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  38.95 
 
 		 805 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  38.24 
 
 		 812 aa  53.9  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  30.47 
 
 		 806 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0204  Lon-A peptidase  37.76 
 
 		 801 aa  53.9  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  39.18 
 
 		 812 aa  53.1  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  34.68 
 
 		 803 aa  53.5  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0899  ATP-dependent protease La  37.89 
 
 		 802 aa  53.1  0.000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.303958  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  40.2 
 
 		 867 aa  53.1  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  38.14 
 
 		 806 aa  52.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  30.63 
 
 		 650 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  39.8 
 
 		 808 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  41.24 
 
 		 807 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  27.38 
 
 		 558 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  39.18 
 
 		 802 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  37.96 
 
 		 815 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  32.43 
 
 		 801 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  37.11 
 
 		 772 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  38.14 
 
 		 805 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  38.71 
 
 		 807 aa  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  32.8 
 
 		 816 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  39.18 
 
 		 805 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  38.14 
 
 		 812 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1361  Lon-A peptidase  38.98 
 
 		 803 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  39.18 
 
 		 806 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  39.18 
 
 		 806 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  38.14 
 
 		 802 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  32.48 
 
 		 809 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0390  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 800 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.754053  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0798  ATP-dependent protease La  38.14 
 
 		 798 aa  50.8  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.595986  normal  0.028237 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  38.14 
 
 		 802 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  34.82 
 
 		 800 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  38.14 
 
 		 818 aa  50.4  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  34.69 
 
 		 826 aa  50.4  0.00005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  33.7 
 
 		 579 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>