127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0642 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  100 
 
 		 350 aa  718    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  53.94 
 
 		 363 aa  360  1e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  44.26 
 
 		 364 aa  294  1e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  43.44 
 
 		 358 aa  259  4e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  42.9 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  41.82 
 
 		 357 aa  250  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40.23 
 
 		 338 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  39.48 
 
 		 336 aa  225  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.5 
 
 		 339 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  36.98 
 
 		 340 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  36.98 
 
 		 340 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  36.98 
 
 		 340 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  36.69 
 
 		 340 aa  198  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  36.69 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  36.69 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  36.98 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.69 
 
 		 341 aa  192  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  35.5 
 
 		 345 aa  192  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  34.91 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.5 
 
 		 341 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.03 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.65 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  32.45 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  32.58 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  29.94 
 
 		 354 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  26.42 
 
 		 383 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  35.03 
 
 		 374 aa  106  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  28.41 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  28.81 
 
 		 316 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  29.38 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  32.06 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.33 
 
 		 348 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.6 
 
 		 356 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  29.96 
 
 		 357 aa  96.3  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.56 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  25.76 
 
 		 337 aa  94  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  27.22 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  32.43 
 
 		 342 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.82 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.76 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.76 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  31.19 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  35.76 
 
 		 345 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  26.71 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  36.97 
 
 		 345 aa  87  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.7 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  29.82 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  29.23 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  25.17 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  29.05 
 
 		 353 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  36.42 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  24.62 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  32 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  36.51 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  27.08 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.13 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.21 
 
 		 376 aa  69.3  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  45.33 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  30 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  37.09 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.28 
 
 		 628 aa  56.6  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  29.57 
 
 		 786 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  29.82 
 
 		 783 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  42.86 
 
 		 453 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1374  hypothetical protein  36.11 
 
 		 632 aa  53.1  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00571338  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  28.44 
 
 		 756 aa  49.7  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  28.44 
 
 		 787 aa  49.7  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  27.78 
 
 		 810 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  38.1 
 
 		 806 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  30.56 
 
 		 837 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  26.67 
 
 		 489 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  41.27 
 
 		 779 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  31.63 
 
 		 836 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  41.27 
 
 		 772 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  39.44 
 
 		 511 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  38.1 
 
 		 815 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  38.1 
 
 		 797 aa  46.6  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  38.36 
 
 		 817 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  41.27 
 
 		 771 aa  46.2  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  30.61 
 
 		 835 aa  46.2  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  36.51 
 
 		 854 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  29.52 
 
 		 796 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  38.1 
 
 		 570 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3246  Endopeptidase La  36.51 
 
 		 789 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171847  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  27.78 
 
 		 824 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0923  ATP-dependent protease La  41.27 
 
 		 768 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.469198  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0620  ATP-dependent protease La  28.37 
 
 		 810 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  25.69 
 
 		 801 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  38.46 
 
 		 774 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  38.1 
 
 		 570 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  38.1 
 
 		 810 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  39.68 
 
 		 772 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0873  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.41 
 
 		 550 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  36.71 
 
 		 794 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  25.83 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  36.71 
 
 		 794 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000293647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1658  ATP-dependent protease La  32.2 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1532  ATP-dependent protease La  38.1 
 
 		 797 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.801288  normal  0.268359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  27.43 
 
 		 799 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  29.37 
 
 		 835 aa  44.7  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>