More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2463 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2463  protease  100 
 
 		 343 aa  692    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  49 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  51.26 
 
 		 358 aa  315  8e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  45.51 
 
 		 336 aa  275  6e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  42.99 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  44.64 
 
 		 340 aa  256  5e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  44.35 
 
 		 340 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  44.35 
 
 		 340 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  44.35 
 
 		 340 aa  255  6e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  44.35 
 
 		 340 aa  255  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  44.35 
 
 		 340 aa  255  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  44.35 
 
 		 340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  43.75 
 
 		 345 aa  253  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  43.75 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  43.38 
 
 		 350 aa  252  7e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.05 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.96 
 
 		 341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  39.82 
 
 		 364 aa  239  5.999999999999999e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.26 
 
 		 338 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.46 
 
 		 339 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.88 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.44 
 
 		 337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  28.24 
 
 		 357 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.82 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.95 
 
 		 348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.1 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  27.81 
 
 		 347 aa  109  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  36.28 
 
 		 374 aa  107  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.91 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.9 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  28.45 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  27.43 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  28.35 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  29.01 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  28.14 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.45 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  27.83 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  27.16 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  30.2 
 
 		 340 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  29.51 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.4 
 
 		 441 aa  98.6  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.91 
 
 		 353 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  26.49 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.15 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.15 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  31.15 
 
 		 345 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  31.07 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  28.02 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  25.97 
 
 		 383 aa  94  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  26.71 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  27.57 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  31.33 
 
 		 387 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  30.54 
 
 		 345 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  34.7 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  26.15 
 
 		 358 aa  87.8  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  29.47 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  26.72 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.94 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  50.67 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  40.17 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  46.58 
 
 		 628 aa  65.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0873  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.96 
 
 		 550 aa  62.8  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  31.68 
 
 		 810 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0794  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.46 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000691143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  31.68 
 
 		 783 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  32.41 
 
 		 826 aa  57  0.0000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  31.68 
 
 		 786 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  30.48 
 
 		 558 aa  55.8  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  32.43 
 
 		 652 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  32.76 
 
 		 816 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  31.16 
 
 		 772 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  33.91 
 
 		 787 aa  55.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  33.91 
 
 		 756 aa  55.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0384  hypothetical protein  31.48 
 
 		 606 aa  53.9  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0784776  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1374  hypothetical protein  37.5 
 
 		 632 aa  53.9  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00571338  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.95 
 
 		 784 aa  53.5  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.95 
 
 		 784 aa  53.5  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0963  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.73 
 
 		 640 aa  53.1  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  36.08 
 
 		 309 aa  52.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.95 
 
 		 784 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1716  Lon-A peptidase  31.78 
 
 		 804 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.390297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2542  ATP-dependent protease La  32.35 
 
 		 805 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142906 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1960  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.63 
 
 		 557 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  32.67 
 
 		 808 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1908  ATP-dependent protease La  34.29 
 
 		 807 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  33.05 
 
 		 816 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2032  Lon-A peptidase  35.92 
 
 		 809 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.914021  decreased coverage  0.00112725 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  30.06 
 
 		 816 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  30 
 
 		 824 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1013  ATP-dependent protease La  34.29 
 
 		 805 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952108  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1838  ATP-dependent protease La  32.03 
 
 		 805 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203387  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1463  ATP-dependent protease La  33.01 
 
 		 805 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2479  ATP-dependent protease La  33.01 
 
 		 805 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.71727  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2363  ATP-dependent protease La  33.01 
 
 		 805 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1230  ATP-dependent protease La  33.01 
 
 		 805 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2122  ATP-dependent protease La  33.01 
 
 		 806 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  31.36 
 
 		 799 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2293  Lon-A peptidase  33.33 
 
 		 807 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.441771 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1955  ATP-dependent protease La  33.01 
 
 		 805 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3350  ATP-dependent protease La  33.01 
 
 		 805 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>