163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0539 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  100 
 
 		 347 aa  695    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  56.3 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  49.86 
 
 		 348 aa  341  8e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  48.13 
 
 		 348 aa  316  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  45.27 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  42.28 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  42.17 
 
 		 356 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  40.29 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  41.83 
 
 		 381 aa  235  9e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  39.31 
 
 		 358 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  38.66 
 
 		 342 aa  232  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.46 
 
 		 348 aa  232  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  39.49 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  42.07 
 
 		 353 aa  228  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  38.68 
 
 		 373 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  38.9 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  40.29 
 
 		 387 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  40.86 
 
 		 345 aa  223  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.44 
 
 		 441 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  38.22 
 
 		 353 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  39.08 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.78 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.78 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  36.62 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  37.71 
 
 		 345 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.07 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  35.61 
 
 		 359 aa  203  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.57 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  37.71 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.89 
 
 		 376 aa  190  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  36.13 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  39.45 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  37.69 
 
 		 353 aa  186  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  35.59 
 
 		 355 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  36.36 
 
 		 348 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  35.67 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  32.35 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  32.65 
 
 		 340 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  32.06 
 
 		 340 aa  152  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  32.06 
 
 		 340 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  32.65 
 
 		 340 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  32.35 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  32.35 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.16 
 
 		 341 aa  146  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  31.18 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  31.18 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.21 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.16 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.99 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.29 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.17 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  46.72 
 
 		 293 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  43.18 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  27.51 
 
 		 343 aa  106  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  25.95 
 
 		 357 aa  90.9  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  29.56 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  27.55 
 
 		 350 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  27.78 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  28.57 
 
 		 363 aa  75.9  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  30.97 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  39.05 
 
 		 511 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.46 
 
 		 486 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1873  secreted protein containing a PDZ domain  25.89 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.78 
 
 		 506 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.29 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  37.5 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1153  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.62 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.33 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  39.13 
 
 		 597 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 503 aa  50.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.86 
 
 		 471 aa  49.7  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  35.62 
 
 		 504 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1435  peptidase S1C, Do  40.54 
 
 		 545 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.600827 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  38.75 
 
 		 459 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  36.49 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  38.36 
 
 		 459 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  33.73 
 
 		 456 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1380  peptidase M50  25.19 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.338907  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.97 
 
 		 545 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.86 
 
 		 558 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  39.19 
 
 		 515 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.5 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  35.16 
 
 		 504 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  36.23 
 
 		 514 aa  47  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  32.11 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  44.83 
 
 		 450 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  38.89 
 
 		 493 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  38.89 
 
 		 506 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  36 
 
 		 489 aa  46.2  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3371  peptidase M50  34.41 
 
 		 397 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2002  trypsin-like serine protease  35.09 
 
 		 411 aa  45.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.172847  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  36.67 
 
 		 539 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2644  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.94 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1942  peptidase M50  29.87 
 
 		 432 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.718786 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  40.43 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  30.3 
 
 		 491 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  37.04 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  38.36 
 
 		 502 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  31.18 
 
 		 494 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  36.99 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>