More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4223 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  667    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  46.8 
 
 		 337 aa  288  7e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  47.27 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  41.55 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  41.55 
 
 		 359 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.8 
 
 		 342 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  40.8 
 
 		 345 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.8 
 
 		 342 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  43.24 
 
 		 381 aa  242  6e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.87 
 
 		 348 aa  242  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  44.05 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  40.7 
 
 		 348 aa  238  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  42.41 
 
 		 350 aa  236  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  41.33 
 
 		 340 aa  236  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  41.74 
 
 		 348 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  44.14 
 
 		 386 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.88 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  43.41 
 
 		 338 aa  219  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  41.79 
 
 		 342 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  41.79 
 
 		 387 aa  209  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  37.69 
 
 		 358 aa  209  8e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  42.65 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  38.95 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40.35 
 
 		 441 aa  200  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  38.25 
 
 		 383 aa  199  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  36.66 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.59 
 
 		 354 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  40.17 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.48 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  39.17 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  39.94 
 
 		 355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  33.33 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  38.64 
 
 		 353 aa  166  5.9999999999999996e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  38.02 
 
 		 353 aa  166  8e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40.99 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  36.04 
 
 		 374 aa  143  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  30.09 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  29.8 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.92 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  29.8 
 
 		 340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  29.8 
 
 		 340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  29.8 
 
 		 340 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  29.8 
 
 		 340 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  29.8 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.3 
 
 		 341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  28.81 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  29.1 
 
 		 347 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.37 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.09 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.58 
 
 		 337 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  50.91 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  27.88 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  48.62 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  28.12 
 
 		 358 aa  100  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  26.04 
 
 		 364 aa  97.8  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  28.78 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  27.4 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  27.8 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  37.61 
 
 		 336 aa  69.3  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 		 817 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  38.89 
 
 		 812 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  39.18 
 
 		 810 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0899  ATP-dependent protease La  37.89 
 
 		 802 aa  58.5  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.303958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  37.74 
 
 		 843 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  39.18 
 
 		 783 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  41.89 
 
 		 810 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  40.43 
 
 		 786 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  36.79 
 
 		 835 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0204  Lon-A peptidase  36.84 
 
 		 801 aa  55.5  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  41.84 
 
 		 811 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  36.79 
 
 		 835 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  41.84 
 
 		 796 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0764  ATP-dependent protease La  25.97 
 
 		 774 aa  55.5  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  41.89 
 
 		 1104 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  29.52 
 
 		 558 aa  53.9  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  38.3 
 
 		 818 aa  53.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1883  Lon-A peptidase  35.19 
 
 		 803 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1908  ATP-dependent protease La  36.08 
 
 		 807 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1230  ATP-dependent protease La  38 
 
 		 805 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2363  ATP-dependent protease La  38 
 
 		 805 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1463  ATP-dependent protease La  38 
 
 		 805 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114197  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1979  ATP-dependent protease La  37.76 
 
 		 859 aa  52.8  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205373 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2479  ATP-dependent protease La  38 
 
 		 805 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.71727  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2321  ATP-dependent protease La  38 
 
 		 805 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00784653  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2122  ATP-dependent protease La  38 
 
 		 806 aa  53.1  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1013  ATP-dependent protease La  35.05 
 
 		 805 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952108  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3350  ATP-dependent protease La  38 
 
 		 805 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464678  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1955  ATP-dependent protease La  38 
 
 		 805 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  41.89 
 
 		 806 aa  52.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2293  Lon-A peptidase  41.89 
 
 		 807 aa  52.8  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.441771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  37.39 
 
 		 828 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0384  hypothetical protein  25.44 
 
 		 606 aa  52  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0784776  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1839  ATP-dependent protease La  36.11 
 
 		 807 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419381  normal  0.0156461 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 		 821 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  35.19 
 
 		 804 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  34.23 
 
 		 816 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  32.29 
 
 		 835 aa  52.8  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  35.19 
 
 		 804 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  35.34 
 
 		 803 aa  52.8  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>