More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0723 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  716    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  52.54 
 
 		 395 aa  360  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  49.72 
 
 		 441 aa  335  5e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  52.51 
 
 		 373 aa  330  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  50.29 
 
 		 353 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  42.01 
 
 		 348 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  43.49 
 
 		 342 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  42.74 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.83 
 
 		 348 aa  249  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  39.31 
 
 		 347 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  39.39 
 
 		 383 aa  239  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  38.64 
 
 		 350 aa  239  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  41.62 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.76 
 
 		 376 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.83 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  40.17 
 
 		 357 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.75 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  38.84 
 
 		 316 aa  206  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.18 
 
 		 353 aa  205  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  39.48 
 
 		 345 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  38.9 
 
 		 381 aa  199  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.47 
 
 		 394 aa  199  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  37.42 
 
 		 353 aa  196  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  35.8 
 
 		 345 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  38.46 
 
 		 374 aa  196  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  36.05 
 
 		 342 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  36.05 
 
 		 342 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  37.69 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  35.69 
 
 		 340 aa  189  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.21 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  36.76 
 
 		 338 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  34.21 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  38.04 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  32.76 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  32.45 
 
 		 355 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  32.58 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  41.8 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  51.01 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.92 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.74 
 
 		 338 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.69 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  28.41 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  28.65 
 
 		 347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  28.9 
 
 		 340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  28.09 
 
 		 345 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.05 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  28.33 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  28.05 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  27.76 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  28.05 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  27.76 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.87 
 
 		 339 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.14 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  32.18 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  28.23 
 
 		 357 aa  95.9  9e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  28.43 
 
 		 336 aa  94.4  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  27.07 
 
 		 343 aa  90.1  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  32.16 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  25.76 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  28.65 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  34.91 
 
 		 579 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  30.82 
 
 		 812 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  37.36 
 
 		 619 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  37.36 
 
 		 619 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  32.45 
 
 		 807 aa  54.3  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  36.46 
 
 		 802 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  37.36 
 
 		 809 aa  53.9  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  33.79 
 
 		 815 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  29.68 
 
 		 825 aa  53.1  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  35.87 
 
 		 791 aa  53.1  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  35.87 
 
 		 791 aa  53.1  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  33.68 
 
 		 791 aa  52.8  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  35.92 
 
 		 652 aa  52.8  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  32.67 
 
 		 804 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  34.38 
 
 		 802 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  30.91 
 
 		 815 aa  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  30.82 
 
 		 775 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  43.75 
 
 		 451 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  43.75 
 
 		 455 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  43.75 
 
 		 455 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  43.75 
 
 		 455 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  34.62 
 
 		 932 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  30.82 
 
 		 835 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0204  Lon-A peptidase  32.65 
 
 		 801 aa  50.8  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  43.75 
 
 		 455 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  34.07 
 
 		 788 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0899  ATP-dependent protease La  32.63 
 
 		 802 aa  50.4  0.00005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.303958  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0404  Lon-B peptidase  40.68 
 
 		 692 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.175581  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  43.06 
 
 		 455 aa  50.1  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  33.56 
 
 		 814 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  37.5 
 
 		 457 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  37.5 
 
 		 457 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  37.5 
 
 		 463 aa  49.7  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  39.68 
 
 		 456 aa  49.7  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  37.63 
 
 		 571 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  38.04 
 
 		 802 aa  49.7  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  33.63 
 
 		 566 aa  49.3  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  34.78 
 
 		 803 aa  48.9  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3020  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  32.91 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  31.58 
 
 		 800 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>