More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1003 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 338 aa  690    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  72.4 
 
 		 339 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  52.38 
 
 		 347 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.82 
 
 		 341 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  52.38 
 
 		 345 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.23 
 
 		 341 aa  354  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  51.63 
 
 		 340 aa  353  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  51.34 
 
 		 340 aa  353  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  51.93 
 
 		 340 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  51.34 
 
 		 340 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  51.34 
 
 		 340 aa  352  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  51.04 
 
 		 340 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  51.04 
 
 		 340 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  40.3 
 
 		 350 aa  223  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  37.89 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  39.26 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  36.2 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  37.13 
 
 		 336 aa  202  7e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  39.13 
 
 		 358 aa  202  8e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40.63 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  32.77 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.73 
 
 		 332 aa  172  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  31.82 
 
 		 348 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.49 
 
 		 356 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.43 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  33.81 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  32.14 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  31.82 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  30.99 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.56 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.01 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  30.77 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  31.18 
 
 		 357 aa  135  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  30.77 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  32.53 
 
 		 374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  29.81 
 
 		 358 aa  125  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  30.55 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.66 
 
 		 386 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.86 
 
 		 441 aa  119  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  30.12 
 
 		 348 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  30.9 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  30.77 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  30.16 
 
 		 395 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.49 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.58 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  30.84 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  30.84 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  30.36 
 
 		 353 aa  113  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  34.39 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  32.26 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  30.49 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  31.56 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  26.97 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  28.95 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  32.24 
 
 		 387 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.57 
 
 		 376 aa  87  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  27.64 
 
 		 340 aa  87  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  40.35 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  36.94 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 805 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  31.93 
 
 		 652 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  42.86 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 812 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 819 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  33.33 
 
 		 558 aa  60.1  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  43.48 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  35 
 
 		 812 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  36 
 
 		 810 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  31.78 
 
 		 812 aa  59.7  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  36.84 
 
 		 570 aa  59.7  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  29.29 
 
 		 810 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  25.81 
 
 		 783 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  34 
 
 		 803 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  29.25 
 
 		 835 aa  58.9  0.0000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  25.16 
 
 		 786 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  39.76 
 
 		 570 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 788 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  34.34 
 
 		 807 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  27.91 
 
 		 797 aa  57  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  34.34 
 
 		 823 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  35.35 
 
 		 807 aa  56.6  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  35.35 
 
 		 808 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  33.33 
 
 		 816 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  34.19 
 
 		 571 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  30.3 
 
 		 824 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  32.71 
 
 		 817 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  29.38 
 
 		 808 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  32.56 
 
 		 817 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  32.67 
 
 		 799 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  33 
 
 		 816 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  34.65 
 
 		 804 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  31.68 
 
 		 818 aa  53.9  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  33 
 
 		 798 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  29.69 
 
 		 579 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  38.1 
 
 		 575 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  31.68 
 
 		 791 aa  53.5  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  39.39 
 
 		 810 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  28.68 
 
 		 785 aa  53.1  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  35.05 
 
 		 821 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>