More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4369 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  67.02 
 
 		 571 aa  785    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  64.26 
 
 		 557 aa  699    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  64.44 
 
 		 557 aa  701    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  64.44 
 
 		 557 aa  701    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  64.44 
 
 		 557 aa  701    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0492  Sigma 54 interacting domain protein  65.54 
 
 		 557 aa  696    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.335445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  64.44 
 
 		 557 aa  701    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  61.75 
 
 		 558 aa  675    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  64.44 
 
 		 557 aa  701    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  68.35 
 
 		 572 aa  752    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  64.89 
 
 		 556 aa  692    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  67.17 
 
 		 558 aa  728    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  64.36 
 
 		 556 aa  700    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 		 579 aa  1175    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  62.71 
 
 		 560 aa  698    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  66.85 
 
 		 563 aa  739    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  63.01 
 
 		 537 aa  719    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  64.73 
 
 		 556 aa  699    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  59.16 
 
 		 566 aa  675    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  65.92 
 
 		 558 aa  740    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  64.91 
 
 		 556 aa  702    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  64.25 
 
 		 557 aa  691    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  63.82 
 
 		 556 aa  689    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  69.98 
 
 		 575 aa  771    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  64.26 
 
 		 557 aa  698    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  57.88 
 
 		 570 aa  631  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  58.26 
 
 		 570 aa  631  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  46.64 
 
 		 648 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  44.93 
 
 		 650 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  43.92 
 
 		 639 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  44.49 
 
 		 652 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  41.57 
 
 		 670 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  45.17 
 
 		 655 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  44.17 
 
 		 619 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  44.17 
 
 		 619 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  30.87 
 
 		 637 aa  154  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  32.47 
 
 		 631 aa  153  7e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  29.42 
 
 		 698 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  30.42 
 
 		 731 aa  146  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  29.3 
 
 		 778 aa  144  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  30.63 
 
 		 765 aa  143  9e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  30.41 
 
 		 680 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  28.92 
 
 		 645 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  29.86 
 
 		 662 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  29.39 
 
 		 711 aa  134  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  29.4 
 
 		 632 aa  131  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  29.81 
 
 		 693 aa  131  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  29.3 
 
 		 635 aa  125  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  28.23 
 
 		 774 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  28.66 
 
 		 793 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  28.89 
 
 		 811 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  29.48 
 
 		 812 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2559  ATP-dependent protease La  31.04 
 
 		 794 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  37.57 
 
 		 788 aa  114  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  36.04 
 
 		 638 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  26.82 
 
 		 817 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  37.17 
 
 		 793 aa  113  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  40.61 
 
 		 812 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  27.11 
 
 		 797 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  27.22 
 
 		 807 aa  112  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  27.16 
 
 		 815 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  27.2 
 
 		 808 aa  112  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  30.22 
 
 		 813 aa  111  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  28.07 
 
 		 775 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  40.1 
 
 		 812 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  28.19 
 
 		 812 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.76 
 
 		 784 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.76 
 
 		 784 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.76 
 
 		 784 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.76 
 
 		 784 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.76 
 
 		 784 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.46 
 
 		 784 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  27.46 
 
 		 784 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.46 
 
 		 799 aa  110  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0407  ATP-dependent protease La  30.91 
 
 		 810 aa  109  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.61 
 
 		 784 aa  109  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.46 
 
 		 784 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.46 
 
 		 784 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.46 
 
 		 784 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.46 
 
 		 784 aa  109  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  27.46 
 
 		 784 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  27.27 
 
 		 823 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  37.95 
 
 		 786 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  36.95 
 
 		 819 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.34 
 
 		 784 aa  108  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2695  ATP-dependent protease La  28.33 
 
 		 811 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  27.65 
 
 		 802 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  27.77 
 
 		 817 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  26.39 
 
 		 810 aa  108  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  38.78 
 
 		 809 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  36.06 
 
 		 810 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 784 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 784 aa  107  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  26.82 
 
 		 816 aa  107  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  38.1 
 
 		 801 aa  107  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  25.38 
 
 		 815 aa  107  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.16 
 
 		 784 aa  107  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  27.13 
 
 		 815 aa  107  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  27.94 
 
 		 806 aa  107  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl404  class III heat shock DNA-binding ATP dependent Lon protease  27.69 
 
 		 787 aa  107  8e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>