More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1038 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  63.74 
 
 
645 aa  788    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  64.14 
 
 
632 aa  796    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  63 
 
 
698 aa  783    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  76.63 
 
 
731 aa  1099    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  63.87 
 
 
638 aa  794    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  100 
 
 
765 aa  1532    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  63.7 
 
 
680 aa  769    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  74.89 
 
 
711 aa  1047    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  62.56 
 
 
637 aa  785    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  70.96 
 
 
778 aa  1059    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  82.11 
 
 
693 aa  1036    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  62.83 
 
 
635 aa  800    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  54.78 
 
 
631 aa  676    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  63.62 
 
 
662 aa  759    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0502  peptidase S16, Lon-like protease  32.84 
 
 
685 aa  205  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.85369  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1350  peptidase S16, Lon-like protease  30.77 
 
 
703 aa  204  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.966121  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0404  Lon-B peptidase  32.09 
 
 
692 aa  202  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.175581  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1487  peptidase S16, Lon-like protease  32.91 
 
 
693 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0433  peptidase S16, Lon-like protease  32.51 
 
 
692 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.317598  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1394  AAA ATPase central domain protein  45.38 
 
 
496 aa  196  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  31.4 
 
 
571 aa  156  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  30.62 
 
 
579 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  30.37 
 
 
803 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  28.67 
 
 
819 aa  134  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  28.9 
 
 
819 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  29.3 
 
 
670 aa  133  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  30.02 
 
 
648 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  31.08 
 
 
537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  29.24 
 
 
558 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  29.86 
 
 
575 aa  132  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  29.57 
 
 
558 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.74 
 
 
563 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0928  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.86 
 
 
794 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182033  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  31.12 
 
 
566 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  25.42 
 
 
810 aa  127  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0950  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.72 
 
 
794 aa  126  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  28.24 
 
 
639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  26.37 
 
 
823 aa  123  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  31.09 
 
 
556 aa  122  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  28.73 
 
 
570 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  28.51 
 
 
570 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  25.85 
 
 
787 aa  121  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.51 
 
 
807 aa  120  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2347  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.64 
 
 
805 aa  120  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  25.43 
 
 
660 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  30.2 
 
 
556 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  25.23 
 
 
777 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  30.44 
 
 
558 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  28.1 
 
 
652 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 
811 aa  117  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  32.65 
 
 
817 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  27.62 
 
 
821 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  30.02 
 
 
557 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  27.79 
 
 
560 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0319  peptidase S16, lon domain-containing protein  25 
 
 
783 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  26.74 
 
 
831 aa  115  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000165888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.51 
 
 
805 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  32.99 
 
 
807 aa  114  5e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  32.06 
 
 
816 aa  114  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  28.91 
 
 
556 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2518  Lon-A peptidase  31.4 
 
 
799 aa  113  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571942  normal  0.381839 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  25.93 
 
 
786 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  29.53 
 
 
556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  31.46 
 
 
805 aa  113  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  34.17 
 
 
811 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  28.91 
 
 
619 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  28.91 
 
 
619 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  34.84 
 
 
810 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  35.35 
 
 
816 aa  112  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  27.72 
 
 
825 aa  112  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.88 
 
 
788 aa  112  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  28.15 
 
 
803 aa  112  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1955  ATP-dependent protease La  30.45 
 
 
805 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1463  ATP-dependent protease La  30.45 
 
 
805 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2479  ATP-dependent protease La  30.45 
 
 
805 aa  111  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.71727  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1230  ATP-dependent protease La  30.45 
 
 
805 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3350  ATP-dependent protease La  30.45 
 
 
805 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2321  ATP-dependent protease La  30.45 
 
 
805 aa  111  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00784653  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2363  ATP-dependent protease La  30.45 
 
 
805 aa  111  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  39.78 
 
 
816 aa  111  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0390  ATP-dependent protease La  37.75 
 
 
800 aa  111  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.754053  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  29.72 
 
 
557 aa  111  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  32.31 
 
 
833 aa  111  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3407  peptidase S16 lon domain protein  28.51 
 
 
806 aa  111  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025789  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  32.65 
 
 
802 aa  111  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  25.46 
 
 
786 aa  110  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  29.41 
 
 
817 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4987  ATP-dependent protease La  40.33 
 
 
824 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00166311  normal  0.674678 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  29.53 
 
 
557 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  29.53 
 
 
557 aa  110  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  29.53 
 
 
557 aa  110  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  29.53 
 
 
557 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  29.53 
 
 
557 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1013  ATP-dependent protease La  29.85 
 
 
805 aa  109  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952108  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2122  ATP-dependent protease La  30.15 
 
 
806 aa  109  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2293  Lon-A peptidase  30.15 
 
 
807 aa  109  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.441771 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  34.69 
 
 
792 aa  109  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  28.7 
 
 
556 aa  109  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1908  ATP-dependent protease La  30.45 
 
 
807 aa  109  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261934  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0516  ATP-dependent protease La  30.92 
 
 
779 aa  108  3e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>