More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0812 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  61.16 
 
 		 557 aa  668    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 		 560 aa  1141    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  61.16 
 
 		 557 aa  668    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  60.98 
 
 		 556 aa  667    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  61.16 
 
 		 557 aa  668    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  61.16 
 
 		 557 aa  668    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  60.98 
 
 		 557 aa  666    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  61.16 
 
 		 557 aa  668    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  61.83 
 
 		 558 aa  707    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  73.84 
 
 		 558 aa  846    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  69.14 
 
 		 571 aa  761    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  60.98 
 
 		 556 aa  667    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  58.95 
 
 		 563 aa  682    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  63.28 
 
 		 558 aa  697    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  61.16 
 
 		 557 aa  668    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  63.4 
 
 		 572 aa  687    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  63.37 
 
 		 556 aa  683    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  62.71 
 
 		 579 aa  713    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  62.1 
 
 		 556 aa  666    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  61.83 
 
 		 557 aa  671    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  64.27 
 
 		 575 aa  718    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  62.48 
 
 		 556 aa  667    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  58.29 
 
 		 570 aa  642    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  58.29 
 
 		 570 aa  640    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  61.17 
 
 		 537 aa  694    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  58.6 
 
 		 566 aa  651    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0492  Sigma 54 interacting domain protein  60.11 
 
 		 557 aa  671    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.335445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  44.86 
 
 		 648 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  44.71 
 
 		 650 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  42.26 
 
 		 639 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  41.13 
 
 		 670 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  45.88 
 
 		 619 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  45.88 
 
 		 619 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  43.33 
 
 		 652 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  43.23 
 
 		 655 aa  355  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  30.7 
 
 		 631 aa  146  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  28.67 
 
 		 778 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  30.5 
 
 		 680 aa  140  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  28.91 
 
 		 645 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  28.6 
 
 		 637 aa  136  9e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  28.15 
 
 		 731 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  29.61 
 
 		 662 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  29.52 
 
 		 698 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  27.11 
 
 		 638 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  30.14 
 
 		 635 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  27.21 
 
 		 711 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  26.47 
 
 		 693 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  27.79 
 
 		 765 aa  128  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  25.74 
 
 		 632 aa  128  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  39.17 
 
 		 800 aa  118  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  28.04 
 
 		 813 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  37.82 
 
 		 768 aa  115  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  28.31 
 
 		 783 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  26.45 
 
 		 778 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  27.63 
 
 		 786 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 805 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  34.35 
 
 		 793 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 805 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  28.63 
 
 		 813 aa  110  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  27.23 
 
 		 867 aa  110  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl404  class III heat shock DNA-binding ATP dependent Lon protease  27.16 
 
 		 787 aa  109  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  40.1 
 
 		 798 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  35.53 
 
 		 812 aa  109  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  35.35 
 
 		 812 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  26.27 
 
 		 816 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02475  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 823 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  27.37 
 
 		 815 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  27.25 
 
 		 806 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  26.72 
 
 		 793 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  26.77 
 
 		 813 aa  108  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  34.88 
 
 		 819 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  34.88 
 
 		 812 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  36.02 
 
 		 807 aa  107  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0549  ATP-dependent protease La  26.69 
 
 		 792 aa  107  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.56565  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  27.75 
 
 		 837 aa  107  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1725  ATP-dependent protease La  34.72 
 
 		 814 aa  106  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000125978  decreased coverage  0.00323118 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  37 
 
 		 783 aa  106  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  25.69 
 
 		 812 aa  106  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2563  ATP-dependent protease La  25.52 
 
 		 807 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  25.79 
 
 		 804 aa  106  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  37 
 
 		 815 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  25.21 
 
 		 823 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  26.79 
 
 		 786 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  26.46 
 
 		 835 aa  105  2e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  33.8 
 
 		 810 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  25.11 
 
 		 817 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0531  endopeptidase La  26.19 
 
 		 823 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  26.3 
 
 		 806 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  26.26 
 
 		 816 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  26.3 
 
 		 806 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  25.65 
 
 		 812 aa  105  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  26.11 
 
 		 812 aa  104  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  34.84 
 
 		 805 aa  104  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2542  ATP-dependent protease La  26.5 
 
 		 805 aa  104  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  25.92 
 
 		 806 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0469  ATP-dependent protease La  26.39 
 
 		 823 aa  104  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  34.84 
 
 		 803 aa  104  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  25.89 
 
 		 817 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1060  ATP-dependent protease La  32.38 
 
 		 798 aa  103  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2032  Lon-A peptidase  25.89 
 
 		 809 aa  103  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.914021  decreased coverage  0.00112725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>