More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0492 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  70.04 
 
 
563 aa  766    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  61.11 
 
 
557 aa  681    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  64.78 
 
 
556 aa  702    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  65.54 
 
 
579 aa  716    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  61.3 
 
 
557 aa  684    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  61.3 
 
 
557 aa  684    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  61.3 
 
 
557 aa  684    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  62.97 
 
 
558 aa  690    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  61.82 
 
 
556 aa  684    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  61.3 
 
 
557 aa  682    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  61.3 
 
 
557 aa  684    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  66.92 
 
 
572 aa  707    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  65.01 
 
 
571 aa  766    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  64.85 
 
 
558 aa  702    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  62.01 
 
 
556 aa  681    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  60.11 
 
 
560 aa  678    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0492  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 
557 aa  1118    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.335445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  66.6 
 
 
575 aa  764    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  63.47 
 
 
558 aa  722    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  57.44 
 
 
570 aa  656    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  57.82 
 
 
570 aa  656    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  61.45 
 
 
556 aa  684    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  59.52 
 
 
566 aa  676    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  61.27 
 
 
556 aa  682    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  61.3 
 
 
557 aa  684    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  63.47 
 
 
537 aa  734    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  65.47 
 
 
557 aa  703    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  45.6 
 
 
648 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  44.66 
 
 
639 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  45.08 
 
 
650 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  44.72 
 
 
619 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  44.72 
 
 
619 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  45 
 
 
652 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  42.22 
 
 
670 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  45.71 
 
 
655 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  29.69 
 
 
631 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  30.75 
 
 
680 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  28.57 
 
 
698 aa  130  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  27.87 
 
 
645 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  27.35 
 
 
774 aa  126  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  29.12 
 
 
776 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  29.12 
 
 
773 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  29.12 
 
 
773 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  28.77 
 
 
776 aa  125  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  28.77 
 
 
776 aa  125  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  28.92 
 
 
776 aa  125  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  28.92 
 
 
776 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  30 
 
 
731 aa  124  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  28.57 
 
 
776 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  28.57 
 
 
773 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  30.44 
 
 
797 aa  123  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0485  ATP-dependent protease La  29.72 
 
 
830 aa  122  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0185488  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  28.57 
 
 
776 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  29.66 
 
 
807 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  28.64 
 
 
662 aa  121  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  28.6 
 
 
817 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  28.99 
 
 
823 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  27.42 
 
 
812 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  28.23 
 
 
638 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  30.32 
 
 
793 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  28.89 
 
 
773 aa  120  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  27.59 
 
 
806 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  29.33 
 
 
802 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  27.73 
 
 
778 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  31.59 
 
 
806 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  29.47 
 
 
811 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  29.12 
 
 
802 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  31.39 
 
 
806 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  28.26 
 
 
801 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  27.71 
 
 
804 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  27.79 
 
 
815 aa  118  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  29.45 
 
 
765 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  27.57 
 
 
812 aa  117  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  28.89 
 
 
806 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  26.81 
 
 
806 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  37.88 
 
 
819 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  34.65 
 
 
783 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  30.1 
 
 
805 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  29.07 
 
 
802 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  26.95 
 
 
807 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  28.54 
 
 
632 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  27.81 
 
 
808 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  26.39 
 
 
637 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  28.46 
 
 
812 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  26.61 
 
 
815 aa  115  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  40 
 
 
812 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  29.34 
 
 
816 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  26.95 
 
 
808 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  30.72 
 
 
799 aa  114  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  29.12 
 
 
768 aa  114  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  39 
 
 
812 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  28.32 
 
 
693 aa  114  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  27.54 
 
 
805 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  28.02 
 
 
880 aa  113  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  26.81 
 
 
807 aa  113  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  28.02 
 
 
775 aa  113  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  25.91 
 
 
779 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  28.91 
 
 
820 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  27.73 
 
 
797 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  27.95 
 
 
803 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>