More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1654 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  58.44 
 
 		 557 aa  635    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  58.41 
 
 		 557 aa  637    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  58.33 
 
 		 556 aa  639    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  58.44 
 
 		 557 aa  635    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  58.44 
 
 		 557 aa  635    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  58.23 
 
 		 557 aa  635    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  58.44 
 
 		 557 aa  635    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  58.23 
 
 		 557 aa  635    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  61.16 
 
 		 571 aa  692    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  58.44 
 
 		 557 aa  635    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  61.25 
 
 		 572 aa  652    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  59.89 
 
 		 563 aa  653    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  57.95 
 
 		 537 aa  660    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0492  Sigma 54 interacting domain protein  59.52 
 
 		 557 aa  654    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.335445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  61.47 
 
 		 575 aa  685    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  59.09 
 
 		 558 aa  650    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  100 
 
 		 566 aa  1152    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  62.79 
 
 		 558 aa  694    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  59.48 
 
 		 556 aa  635    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  59.16 
 
 		 579 aa  675    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  58.8 
 
 		 558 aa  641    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  58.36 
 
 		 556 aa  634  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  58.6 
 
 		 560 aa  634  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  58.36 
 
 		 556 aa  633  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  58.36 
 
 		 556 aa  634  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  56.96 
 
 		 570 aa  621  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  56.98 
 
 		 570 aa  619  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  42.83 
 
 		 639 aa  413  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  42.66 
 
 		 650 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  43.15 
 
 		 648 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  44.81 
 
 		 619 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  44.81 
 
 		 619 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  40.72 
 
 		 670 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  43.29 
 
 		 652 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  43.65 
 
 		 655 aa  365  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  29.83 
 
 		 631 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  29.23 
 
 		 637 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  30.08 
 
 		 680 aa  136  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  29 
 
 		 698 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  31.12 
 
 		 765 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  28.67 
 
 		 638 aa  130  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  28.9 
 
 		 731 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  28.66 
 
 		 645 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  29.22 
 
 		 662 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  28.38 
 
 		 632 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  26.83 
 
 		 778 aa  127  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  39.59 
 
 		 801 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  29.91 
 
 		 635 aa  124  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  29.9 
 
 		 693 aa  123  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  28.64 
 
 		 711 aa  121  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  30.3 
 
 		 768 aa  121  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  29.96 
 
 		 772 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  29.86 
 
 		 808 aa  117  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  36.96 
 
 		 800 aa  115  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  28.13 
 
 		 817 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  30.04 
 
 		 816 aa  114  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  29.88 
 
 		 797 aa  114  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  29.33 
 
 		 817 aa  114  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0599  ATP-dependent protease La  31.74 
 
 		 804 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  27.75 
 
 		 816 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl404  class III heat shock DNA-binding ATP dependent Lon protease  28.07 
 
 		 787 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  29.3 
 
 		 815 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  28.09 
 
 		 812 aa  111  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 787 aa  110  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  29.39 
 
 		 811 aa  110  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  39.52 
 
 		 756 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.36 
 
 		 786 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2310  ATP-dependent protease La  36.65 
 
 		 769 aa  109  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  35.04 
 
 		 805 aa  109  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.97 
 
 		 793 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.15 
 
 		 787 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3640  Lon-A peptidase  28.27 
 
 		 812 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0005782  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2169  ATP-dependent protease La  29.45 
 
 		 821 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000197845  unclonable  0.00000000135432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.15 
 
 		 784 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  27.33 
 
 		 812 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  27.73 
 
 		 775 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  27.86 
 
 		 786 aa  107  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  36.44 
 
 		 783 aa  107  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  27.96 
 
 		 806 aa  107  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  28.27 
 
 		 805 aa  107  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.15 
 
 		 784 aa  106  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.15 
 
 		 784 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  28.15 
 
 		 784 aa  106  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  37.61 
 
 		 807 aa  106  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.15 
 
 		 784 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.15 
 
 		 799 aa  106  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  38.07 
 
 		 806 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.15 
 
 		 784 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.15 
 
 		 784 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  27.52 
 
 		 815 aa  106  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  38.07 
 
 		 806 aa  106  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.15 
 
 		 784 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.15 
 
 		 784 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.15 
 
 		 784 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.15 
 
 		 784 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.42 
 
 		 784 aa  106  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  28.15 
 
 		 784 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.15 
 
 		 784 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0485  ATP-dependent protease La  25.96 
 
 		 830 aa  105  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0185488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3246  Endopeptidase La  41.03 
 
 		 789 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171847  normal  0.924213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>