More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0599 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  45.62 
 
 
797 aa  639    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5873  ATP-dependent protease La  66.83 
 
 
785 aa  964    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2802  ATP-dependent protease La  71.8 
 
 
783 aa  1081    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289517  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2169  ATP-dependent protease La  47.91 
 
 
821 aa  666    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000197845  unclonable  0.00000000135432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3246  Endopeptidase La  65.29 
 
 
789 aa  975    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171847  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5508  ATP-dependent protease La  61.67 
 
 
835 aa  929    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2249  ATP-dependent protease La  68.15 
 
 
778 aa  1013    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.622317  normal  0.359605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3336  ATP-dependent protease La  71.83 
 
 
780 aa  1085    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594281  normal  0.0410698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  45.58 
 
 
840 aa  649    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  43.81 
 
 
810 aa  643    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  46.63 
 
 
828 aa  641    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  48.21 
 
 
812 aa  694    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1818  ATP-dependent protease La  66.88 
 
 
798 aa  1010    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000643095  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0599  ATP-dependent protease La  100 
 
 
804 aa  1575    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737999  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2775  ATP-dependent protease La  71.93 
 
 
783 aa  1083    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.560852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1469  ATP-dependent protease La  47.56 
 
 
823 aa  659    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00898612  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2928  ATP-dependent protease La  53.34 
 
 
760 aa  766    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0257746  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  58.72 
 
 
854 aa  900    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3988  ATP-dependent protease La  71.34 
 
 
769 aa  1100    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.180349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2819  ATP-dependent protease La  71.93 
 
 
783 aa  1083    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246765  normal  0.027393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3064  ATP-dependent protease La  71.12 
 
 
776 aa  1065    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.870237  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4272  ATP-dependent protease La  71.79 
 
 
775 aa  1066    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41949  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  45.34 
 
 
819 aa  635  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  44.35 
 
 
797 aa  634  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  44.29 
 
 
816 aa  632  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  43.91 
 
 
817 aa  632  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  43.98 
 
 
817 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  46.53 
 
 
843 aa  631  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  46.41 
 
 
835 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  44.86 
 
 
804 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  47.64 
 
 
788 aa  630  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  44.86 
 
 
804 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  44.18 
 
 
823 aa  630  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  45.47 
 
 
785 aa  625  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  44.26 
 
 
776 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.26 
 
 
776 aa  626  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  44.82 
 
 
823 aa  628  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  44.26 
 
 
773 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  45.34 
 
 
785 aa  625  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  44.71 
 
 
785 aa  628  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  45.66 
 
 
793 aa  626  1e-178  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  44.26 
 
 
776 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  46.41 
 
 
835 aa  628  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  43.78 
 
 
846 aa  627  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  45.47 
 
 
785 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  44.91 
 
 
806 aa  622  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  44.14 
 
 
773 aa  625  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  45.21 
 
 
785 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.14 
 
 
776 aa  625  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  44.14 
 
 
776 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  44.14 
 
 
776 aa  623  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  45.47 
 
 
785 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  44.14 
 
 
776 aa  624  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  45.4 
 
 
784 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  43.4 
 
 
817 aa  625  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  43.85 
 
 
806 aa  623  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  45.09 
 
 
785 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  45.09 
 
 
785 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  42.66 
 
 
794 aa  622  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  44.38 
 
 
806 aa  622  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  44.04 
 
 
768 aa  622  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  42.66 
 
 
794 aa  621  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000293647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  44.88 
 
 
783 aa  620  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  43.76 
 
 
773 aa  622  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  45.21 
 
 
785 aa  621  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  45.48 
 
 
812 aa  620  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.52 
 
 
787 aa  617  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  44.08 
 
 
806 aa  617  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  43.77 
 
 
816 aa  615  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  44.21 
 
 
809 aa  617  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  43.52 
 
 
785 aa  617  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  44.19 
 
 
781 aa  618  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  43.47 
 
 
880 aa  617  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  45.04 
 
 
802 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  44.51 
 
 
816 aa  617  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.88 
 
 
784 aa  618  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0923  ATP-dependent protease La  44.74 
 
 
768 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.469198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  43.77 
 
 
805 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  42.93 
 
 
824 aa  613  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  43.77 
 
 
837 aa  614  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  43.81 
 
 
773 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  44.79 
 
 
802 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  43.85 
 
 
807 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  43.95 
 
 
785 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  43.83 
 
 
806 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  47.05 
 
 
802 aa  614  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.16 
 
 
786 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.09 
 
 
793 aa  610  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  44.7 
 
 
772 aa  609  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  43.71 
 
 
806 aa  612  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  42.91 
 
 
825 aa  609  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  42.98 
 
 
806 aa  610  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4987  ATP-dependent protease La  43.85 
 
 
824 aa  611  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00166311  normal  0.674678 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  44.26 
 
 
783 aa  612  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.96 
 
 
793 aa  608  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  43.71 
 
 
806 aa  612  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  42.68 
 
 
812 aa  612  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  43.16 
 
 
771 aa  609  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  46.07 
 
 
803 aa  609  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  44.44 
 
 
785 aa  609  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>