More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5873 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3246  Endopeptidase La  75.09 
 
 		 789 aa  1105    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171847  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2928  ATP-dependent protease La  56.53 
 
 		 760 aa  787    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0257746  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4272  ATP-dependent protease La  63.81 
 
 		 775 aa  914    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41949  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3336  ATP-dependent protease La  67.14 
 
 		 780 aa  952    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594281  normal  0.0410698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5508  ATP-dependent protease La  71.43 
 
 		 835 aa  1058    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5873  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 785 aa  1508    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  48.11 
 
 		 812 aa  651    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0599  ATP-dependent protease La  67.04 
 
 		 804 aa  995    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2775  ATP-dependent protease La  64.97 
 
 		 783 aa  929    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.560852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  68.53 
 
 		 854 aa  1038    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1818  ATP-dependent protease La  73.74 
 
 		 798 aa  1099    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000643095  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3988  ATP-dependent protease La  65.3 
 
 		 769 aa  947    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.180349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2819  ATP-dependent protease La  64.97 
 
 		 783 aa  929    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246765  normal  0.027393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3064  ATP-dependent protease La  65.04 
 
 		 776 aa  938    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.870237  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2802  ATP-dependent protease La  64.85 
 
 		 783 aa  928    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2249  ATP-dependent protease La  68.04 
 
 		 778 aa  979    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.622317  normal  0.359605 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  46.92 
 
 		 793 aa  632  1e-180  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  47.31 
 
 		 840 aa  634  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1469  ATP-dependent protease La  47.34 
 
 		 823 aa  633  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00898612  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  46.64 
 
 		 797 aa  624  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  45.09 
 
 		 804 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  43.7 
 
 		 792 aa  619  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  45.09 
 
 		 804 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2169  ATP-dependent protease La  46.51 
 
 		 821 aa  620  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000197845  unclonable  0.00000000135432 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  43.36 
 
 		 817 aa  615  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.94 
 
 		 793 aa  616  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  48.28 
 
 		 803 aa  613  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.45 
 
 		 787 aa  614  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  44.39 
 
 		 797 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.99 
 
 		 786 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  46.3 
 
 		 805 aa  614  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.74 
 
 		 793 aa  610  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.83 
 
 		 784 aa  609  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.83 
 
 		 784 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  43.83 
 
 		 784 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  44.36 
 
 		 796 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  44.59 
 
 		 819 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  44.77 
 
 		 806 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.83 
 
 		 784 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  44.36 
 
 		 811 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  44.72 
 
 		 785 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.58 
 
 		 784 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  44.72 
 
 		 785 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.7 
 
 		 799 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.83 
 
 		 784 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.98 
 
 		 784 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.62 
 
 		 784 aa  608  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  45.01 
 
 		 784 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.58 
 
 		 784 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.83 
 
 		 784 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  43.83 
 
 		 784 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.83 
 
 		 784 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  46.48 
 
 		 793 aa  606  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.98 
 
 		 784 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.58 
 
 		 784 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.58 
 
 		 784 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  44.6 
 
 		 785 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.58 
 
 		 784 aa  603  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.45 
 
 		 784 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  44.6 
 
 		 785 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  42.64 
 
 		 815 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.86 
 
 		 784 aa  605  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  43.34 
 
 		 778 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  43.69 
 
 		 815 aa  602  1.0000000000000001e-171  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1883  Lon-A peptidase  44.87 
 
 		 803 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  42.46 
 
 		 803 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  44.42 
 
 		 783 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  43.38 
 
 		 783 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0923  ATP-dependent protease La  45.56 
 
 		 768 aa  601  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.469198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  44.23 
 
 		 809 aa  600  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  44.44 
 
 		 785 aa  601  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  43.82 
 
 		 776 aa  598  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  43.89 
 
 		 794 aa  602  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000293647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  43.99 
 
 		 781 aa  600  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  43.71 
 
 		 806 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1013  ATP-dependent protease La  44.53 
 
 		 805 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952108  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  46.09 
 
 		 797 aa  600  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  44.25 
 
 		 785 aa  600  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  42.89 
 
 		 810 aa  602  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  43.38 
 
 		 812 aa  600  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  43.77 
 
 		 794 aa  600  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  43.95 
 
 		 776 aa  599  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  44.32 
 
 		 785 aa  599  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  45.36 
 
 		 785 aa  600  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  43.56 
 
 		 846 aa  601  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  43.82 
 
 		 773 aa  598  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  43.82 
 
 		 776 aa  598  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  43.82 
 
 		 776 aa  597  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1827  hypothetical protein  42.93 
 
 		 816 aa  596  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  43.82 
 
 		 776 aa  598  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  44.19 
 
 		 785 aa  598  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  43.82 
 
 		 773 aa  598  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  45.52 
 
 		 806 aa  597  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  44.01 
 
 		 768 aa  596  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  43.25 
 
 		 786 aa  598  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  43.95 
 
 		 776 aa  597  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  44.04 
 
 		 783 aa  596  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  43.35 
 
 		 774 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  44.07 
 
 		 785 aa  598  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  44.07 
 
 		 785 aa  598  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>