More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2249 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5873  ATP-dependent protease La  67.78 
 
 		 785 aa  953    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  46.99 
 
 		 797 aa  638    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  62.32 
 
 		 854 aa  941    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2928  ATP-dependent protease La  57.42 
 
 		 760 aa  811    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0257746  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2249  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 778 aa  1512    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.622317  normal  0.359605 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  49.43 
 
 		 812 aa  674    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3336  ATP-dependent protease La  68.11 
 
 		 780 aa  997    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594281  normal  0.0410698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1818  ATP-dependent protease La  67.81 
 
 		 798 aa  1016    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000643095  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1469  ATP-dependent protease La  49.22 
 
 		 823 aa  657    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00898612  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5508  ATP-dependent protease La  64.94 
 
 		 835 aa  957    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2775  ATP-dependent protease La  68.23 
 
 		 783 aa  985    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.560852  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4272  ATP-dependent protease La  68.24 
 
 		 775 aa  994    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3246  Endopeptidase La  69.41 
 
 		 789 aa  996    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171847  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2169  ATP-dependent protease La  47.87 
 
 		 821 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000197845  unclonable  0.00000000135432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0599  ATP-dependent protease La  68.02 
 
 		 804 aa  999    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3988  ATP-dependent protease La  69.22 
 
 		 769 aa  1022    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.180349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2819  ATP-dependent protease La  68.23 
 
 		 783 aa  985    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246765  normal  0.027393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3064  ATP-dependent protease La  67.27 
 
 		 776 aa  978    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.870237  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2802  ATP-dependent protease La  68.23 
 
 		 783 aa  984    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  46.08 
 
 		 819 aa  633  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  43.22 
 
 		 810 aa  632  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  43.57 
 
 		 817 aa  629  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  45.54 
 
 		 817 aa  628  1e-178  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  44.9 
 
 		 880 aa  626  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.17 
 
 		 786 aa  624  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  44.85 
 
 		 783 aa  623  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.93 
 
 		 784 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.8 
 
 		 784 aa  619  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  43.92 
 
 		 778 aa  619  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.72 
 
 		 793 aa  619  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.18 
 
 		 787 aa  621  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  44.4 
 
 		 815 aa  618  1e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  44.63 
 
 		 823 aa  616  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  44.74 
 
 		 840 aa  618  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  44.7 
 
 		 797 aa  617  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.93 
 
 		 784 aa  618  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6716  ATP-dependent protease La  47.4 
 
 		 798 aa  616  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.902322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.8 
 
 		 784 aa  617  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  44.81 
 
 		 785 aa  616  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  44.6 
 
 		 785 aa  616  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.48 
 
 		 784 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  43.48 
 
 		 784 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.48 
 
 		 784 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.48 
 
 		 784 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  44.77 
 
 		 785 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.48 
 
 		 784 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.48 
 
 		 784 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.48 
 
 		 784 aa  613  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.48 
 
 		 784 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  43.48 
 
 		 784 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.39 
 
 		 793 aa  615  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.48 
 
 		 784 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  44.77 
 
 		 785 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.48 
 
 		 784 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  44.22 
 
 		 783 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  43.25 
 
 		 812 aa  615  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.48 
 
 		 784 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.48 
 
 		 784 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.15 
 
 		 784 aa  613  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  42.5 
 
 		 806 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4987  ATP-dependent protease La  44.36 
 
 		 824 aa  611  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00166311  normal  0.674678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  45 
 
 		 784 aa  612  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  43.96 
 
 		 776 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  43.96 
 
 		 776 aa  609  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  43.74 
 
 		 786 aa  609  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  44.39 
 
 		 785 aa  610  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  45.78 
 
 		 796 aa  608  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  43.96 
 
 		 773 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  44.63 
 
 		 783 aa  610  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  44.77 
 
 		 785 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  45.78 
 
 		 811 aa  610  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.35 
 
 		 799 aa  611  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  43.95 
 
 		 813 aa  611  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  45.08 
 
 		 828 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  44.67 
 
 		 817 aa  612  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  44.52 
 
 		 785 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  44.52 
 
 		 785 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  44.67 
 
 		 816 aa  609  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  43.52 
 
 		 817 aa  609  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  44.64 
 
 		 785 aa  609  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  44.37 
 
 		 823 aa  610  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  43.33 
 
 		 773 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  43.59 
 
 		 776 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  43.7 
 
 		 773 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3783  ATP-dependent protease La  42.95 
 
 		 782 aa  607  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417007  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  44.63 
 
 		 785 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  43.83 
 
 		 776 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1827  hypothetical protein  43.73 
 
 		 816 aa  607  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1823  hypothetical protein  43.73 
 
 		 816 aa  606  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  43.46 
 
 		 776 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  43.76 
 
 		 809 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  43.59 
 
 		 776 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0821  ATP-dependent protease LA  43.59 
 
 		 787 aa  606  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0118017  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  46.17 
 
 		 803 aa  608  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  42.03 
 
 		 803 aa  607  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  43.83 
 
 		 776 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  43.73 
 
 		 783 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  44.77 
 
 		 781 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  45.98 
 
 		 780 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0263  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.13 
 
 		 784 aa  603  1.0000000000000001e-171  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>