More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3988 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5873  ATP-dependent protease La  64.55 
 
 		 785 aa  912    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5508  ATP-dependent protease La  60.17 
 
 		 835 aa  889    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  48.84 
 
 		 812 aa  667    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2928  ATP-dependent protease La  53.9 
 
 		 760 aa  764    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0257746  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4272  ATP-dependent protease La  73.88 
 
 		 775 aa  1088    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3246  Endopeptidase La  65.04 
 
 		 789 aa  954    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171847  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1469  ATP-dependent protease La  47.79 
 
 		 823 aa  644    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00898612  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2802  ATP-dependent protease La  72.34 
 
 		 783 aa  1074    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2249  ATP-dependent protease La  68.82 
 
 		 778 aa  1014    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.622317  normal  0.359605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0599  ATP-dependent protease La  71.21 
 
 		 804 aa  1081    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  61.22 
 
 		 854 aa  931    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2775  ATP-dependent protease La  72.34 
 
 		 783 aa  1075    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.560852  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1818  ATP-dependent protease La  64.99 
 
 		 798 aa  964    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000643095  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3336  ATP-dependent protease La  73.65 
 
 		 780 aa  1085    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594281  normal  0.0410698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3988  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 769 aa  1501    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.180349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2819  ATP-dependent protease La  72.34 
 
 		 783 aa  1075    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246765  normal  0.027393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3064  ATP-dependent protease La  72.41 
 
 		 776 aa  1073    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.870237  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2169  ATP-dependent protease La  47 
 
 		 821 aa  634  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000197845  unclonable  0.00000000135432 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  44.44 
 
 		 823 aa  625  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  44.1 
 
 		 793 aa  616  1e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  43.57 
 
 		 817 aa  618  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  44.9 
 
 		 773 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  44.3 
 
 		 809 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  45.84 
 
 		 819 aa  610  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.64 
 
 		 776 aa  611  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.64 
 
 		 776 aa  610  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  45.05 
 
 		 840 aa  610  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  44.44 
 
 		 776 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  44.64 
 
 		 776 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  44.53 
 
 		 793 aa  605  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  44.39 
 
 		 776 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  43.86 
 
 		 773 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  44.39 
 
 		 773 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  44.94 
 
 		 797 aa  608  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  45.76 
 
 		 837 aa  606  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  44.36 
 
 		 813 aa  607  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  44.32 
 
 		 776 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  44.2 
 
 		 774 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  44.57 
 
 		 773 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  42.62 
 
 		 810 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  46.32 
 
 		 805 aa  603  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  44.4 
 
 		 816 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  43.33 
 
 		 806 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  44.01 
 
 		 776 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  44.81 
 
 		 804 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  44.65 
 
 		 784 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  43.74 
 
 		 817 aa  601  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  44.81 
 
 		 804 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  44.8 
 
 		 785 aa  600  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  44.29 
 
 		 816 aa  600  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  44.05 
 
 		 817 aa  602  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  43.67 
 
 		 792 aa  597  1e-169  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  45.02 
 
 		 802 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  43.92 
 
 		 823 aa  595  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  44.13 
 
 		 813 aa  595  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  44.8 
 
 		 785 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  45.88 
 
 		 797 aa  596  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  44.59 
 
 		 775 aa  598  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  44.8 
 
 		 785 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  43.45 
 
 		 797 aa  595  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  43.6 
 
 		 805 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  44.43 
 
 		 806 aa  593  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  44.29 
 
 		 785 aa  593  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  44.18 
 
 		 880 aa  595  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  43.13 
 
 		 783 aa  593  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  44.17 
 
 		 768 aa  594  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  43.04 
 
 		 798 aa  594  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  44.03 
 
 		 785 aa  594  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.41 
 
 		 784 aa  592  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  43.77 
 
 		 783 aa  592  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  44.67 
 
 		 785 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  43.98 
 
 		 805 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.89 
 
 		 784 aa  591  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0821  ATP-dependent protease LA  43.52 
 
 		 787 aa  590  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0118017  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  43.48 
 
 		 802 aa  590  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.89 
 
 		 784 aa  591  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  43.93 
 
 		 835 aa  590  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.41 
 
 		 793 aa  590  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  44.5 
 
 		 802 aa  591  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  43.87 
 
 		 806 aa  590  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.89 
 
 		 784 aa  591  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.71 
 
 		 784 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.44 
 
 		 793 aa  592  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  44.13 
 
 		 804 aa  591  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  43.9 
 
 		 785 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  43.9 
 
 		 785 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  44.17 
 
 		 836 aa  592  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.71 
 
 		 784 aa  589  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  44.03 
 
 		 785 aa  589  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  43.48 
 
 		 898 aa  589  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3752  ATP-dependent protease La  44.73 
 
 		 803 aa  589  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.728517  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.65 
 
 		 786 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  42.71 
 
 		 784 aa  588  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  42.53 
 
 		 809 aa  587  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  44.31 
 
 		 828 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.21 
 
 		 786 aa  588  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  42.71 
 
 		 784 aa  588  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0263  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.33 
 
 		 784 aa  586  1e-166  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  42.88 
 
 		 785 aa  587  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.58 
 
 		 784 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>