More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4272 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.57 
 
 		 784 aa  637    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  45.57 
 
 		 784 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  47.09 
 
 		 812 aa  672    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.78 
 
 		 784 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.9 
 
 		 784 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.78 
 
 		 784 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  45.63 
 
 		 840 aa  644    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5873  ATP-dependent protease La  63.12 
 
 		 785 aa  914    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3336  ATP-dependent protease La  80.86 
 
 		 780 aa  1218    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594281  normal  0.0410698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3246  Endopeptidase La  64.5 
 
 		 789 aa  956    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171847  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  65.59 
 
 		 854 aa  721    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.2 
 
 		 787 aa  639    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.57 
 
 		 784 aa  637    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.57 
 
 		 784 aa  637    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.19 
 
 		 784 aa  637    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2802  ATP-dependent protease La  80.15 
 
 		 783 aa  1208    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.71 
 
 		 784 aa  636    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.78 
 
 		 784 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.44 
 
 		 793 aa  637    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2169  ATP-dependent protease La  46.62 
 
 		 821 aa  649    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000197845  unclonable  0.00000000135432 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.84 
 
 		 786 aa  643    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5508  ATP-dependent protease La  59.98 
 
 		 835 aa  900    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0599  ATP-dependent protease La  71.59 
 
 		 804 aa  1091    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2249  ATP-dependent protease La  68.28 
 
 		 778 aa  1026    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.622317  normal  0.359605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2775  ATP-dependent protease La  80.15 
 
 		 783 aa  1209    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.560852  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2928  ATP-dependent protease La  54.16 
 
 		 760 aa  781    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0257746  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.57 
 
 		 784 aa  637    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4272  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 775 aa  1543    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1469  ATP-dependent protease La  47.24 
 
 		 823 aa  663    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00898612  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1818  ATP-dependent protease La  64.16 
 
 		 798 aa  974    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000643095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.57 
 
 		 784 aa  637    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.78 
 
 		 784 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.57 
 
 		 784 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3988  ATP-dependent protease La  73.34 
 
 		 769 aa  1129    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.180349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2819  ATP-dependent protease La  80.15 
 
 		 783 aa  1209    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246765  normal  0.027393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3064  ATP-dependent protease La  80.08 
 
 		 776 aa  1200    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.870237  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.44 
 
 		 799 aa  637    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  45.57 
 
 		 784 aa  637    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.89 
 
 		 784 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.24 
 
 		 793 aa  633  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  45.98 
 
 		 837 aa  629  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.89 
 
 		 784 aa  631  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.89 
 
 		 784 aa  630  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  45.13 
 
 		 785 aa  627  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0821  ATP-dependent protease LA  45.14 
 
 		 787 aa  627  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0118017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  45.56 
 
 		 785 aa  627  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  44.03 
 
 		 786 aa  625  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  45.1 
 
 		 785 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  45.1 
 
 		 785 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  44.54 
 
 		 783 aa  628  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  45.23 
 
 		 785 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  45.23 
 
 		 785 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  44.6 
 
 		 809 aa  625  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  45.29 
 
 		 785 aa  624  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  45.23 
 
 		 785 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  45.1 
 
 		 785 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  45.83 
 
 		 828 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  45.16 
 
 		 784 aa  621  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  44.89 
 
 		 806 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  44.52 
 
 		 817 aa  619  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0263  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.36 
 
 		 784 aa  620  1e-176  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  45.39 
 
 		 797 aa  619  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  45.23 
 
 		 774 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  44.27 
 
 		 823 aa  622  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  44.69 
 
 		 819 aa  618  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  43.9 
 
 		 783 aa  618  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  43.81 
 
 		 817 aa  615  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  43.95 
 
 		 823 aa  616  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  44.33 
 
 		 816 aa  616  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  45.05 
 
 		 783 aa  616  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  44.42 
 
 		 773 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3783  ATP-dependent protease La  43.64 
 
 		 782 aa  614  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  41.74 
 
 		 810 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.42 
 
 		 776 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.54 
 
 		 776 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  43.26 
 
 		 778 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  44.1 
 
 		 806 aa  614  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  44.02 
 
 		 768 aa  613  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  45.35 
 
 		 785 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  44.42 
 
 		 776 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  44.54 
 
 		 776 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  44.65 
 
 		 797 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  44.86 
 
 		 785 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  43.62 
 
 		 817 aa  612  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  44.16 
 
 		 776 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  44.16 
 
 		 773 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  45.33 
 
 		 806 aa  611  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  43.06 
 
 		 802 aa  610  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  44.49 
 
 		 817 aa  608  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  44.97 
 
 		 775 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  43.82 
 
 		 785 aa  610  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  44.03 
 
 		 776 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  44.37 
 
 		 781 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  44.03 
 
 		 773 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  44.68 
 
 		 843 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  44.46 
 
 		 785 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  45.09 
 
 		 783 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  44.16 
 
 		 776 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  43.24 
 
 		 880 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  44.56 
 
 		 835 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>