More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2586 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  100 
 
 		 556 aa  1128    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  73.2 
 
 		 557 aa  839    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  73.02 
 
 		 556 aa  839    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  73.38 
 
 		 557 aa  841    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  73.38 
 
 		 557 aa  841    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  68.45 
 
 		 575 aa  742    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  73.38 
 
 		 557 aa  841    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  73.2 
 
 		 557 aa  839    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  63.37 
 
 		 560 aa  689    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  69.33 
 
 		 571 aa  750    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  87.61 
 
 		 557 aa  974    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  73.38 
 
 		 557 aa  841    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  66.73 
 
 		 558 aa  727    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  63.36 
 
 		 572 aa  676    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  73.38 
 
 		 556 aa  844    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  74.67 
 
 		 556 aa  825    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  64.26 
 
 		 558 aa  682    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  64.89 
 
 		 579 aa  713    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  62.69 
 
 		 537 aa  696    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  64.58 
 
 		 558 aa  701    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  60.56 
 
 		 570 aa  651    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  60.37 
 
 		 570 aa  649    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  73.38 
 
 		 557 aa  841    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  58.33 
 
 		 566 aa  659    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  63.4 
 
 		 563 aa  687    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  73.2 
 
 		 556 aa  839    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0492  Sigma 54 interacting domain protein  64.78 
 
 		 557 aa  700    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.335445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  46.65 
 
 		 648 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  44.58 
 
 		 650 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  43.94 
 
 		 639 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  41.67 
 
 		 670 aa  399  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  44.29 
 
 		 652 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  46.43 
 
 		 655 aa  378  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  45.21 
 
 		 619 aa  372  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  45.21 
 
 		 619 aa  372  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  29.52 
 
 		 731 aa  140  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  31.29 
 
 		 631 aa  140  7.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  31.47 
 
 		 698 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  31.49 
 
 		 637 aa  137  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  30.2 
 
 		 765 aa  137  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  32.6 
 
 		 635 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  28.54 
 
 		 645 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  29.09 
 
 		 638 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  28.18 
 
 		 778 aa  130  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  27.62 
 
 		 632 aa  127  7e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  28.22 
 
 		 711 aa  126  9e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  29.17 
 
 		 793 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  29.41 
 
 		 680 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  29.72 
 
 		 662 aa  124  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  29.64 
 
 		 815 aa  123  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  26.97 
 
 		 807 aa  123  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  27.68 
 
 		 817 aa  120  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  27.75 
 
 		 693 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  29.36 
 
 		 811 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  28.29 
 
 		 806 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  30.37 
 
 		 768 aa  118  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  27.88 
 
 		 807 aa  117  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  27.84 
 
 		 806 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  27.88 
 
 		 815 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  28.48 
 
 		 806 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  28.7 
 
 		 812 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  27.84 
 
 		 806 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  27.46 
 
 		 783 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  28.83 
 
 		 775 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  27.89 
 
 		 786 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  27.52 
 
 		 804 aa  113  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  26.25 
 
 		 808 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  28.07 
 
 		 808 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2563  ATP-dependent protease La  26.86 
 
 		 807 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  26.98 
 
 		 812 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.39 
 
 		 799 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.39 
 
 		 784 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  26.8 
 
 		 815 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  29.38 
 
 		 774 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.39 
 
 		 784 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  27.39 
 
 		 784 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  27.39 
 
 		 784 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.39 
 
 		 784 aa  111  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  28.2 
 
 		 805 aa  111  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.39 
 
 		 784 aa  111  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  28.27 
 
 		 793 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  27.41 
 
 		 812 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 796 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 811 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.39 
 
 		 784 aa  111  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.39 
 
 		 784 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  30.6 
 
 		 797 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2302  ATP-dependent protease La  27.25 
 
 		 798 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235792  hitchhiker  0.000494744 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1904  ATP-dependent protease La  27.25 
 
 		 798 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798335  hitchhiker  0.000618765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1744  ATP-dependent protease La  27.04 
 
 		 798 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484284  hitchhiker  0.00114156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  27.71 
 
 		 812 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  28.63 
 
 		 812 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.18 
 
 		 784 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.18 
 
 		 784 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4987  ATP-dependent protease La  38.38 
 
 		 824 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00166311  normal  0.674678 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.18 
 
 		 784 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.18 
 
 		 784 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.18 
 
 		 784 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  37.75 
 
 		 800 aa  110  8.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl404  class III heat shock DNA-binding ATP dependent Lon protease  28.57 
 
 		 787 aa  110  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>