More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3354 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  63.58 
 
 		 558 aa  693    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  62.09 
 
 		 557 aa  695    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  63.36 
 
 		 537 aa  725    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  64.29 
 
 		 557 aa  695    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  68.45 
 
 		 556 aa  723    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  64.29 
 
 		 557 aa  695    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  63.53 
 
 		 556 aa  689    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  64.29 
 
 		 557 aa  695    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  69.98 
 
 		 579 aa  771    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  64.29 
 
 		 557 aa  695    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0492  Sigma 54 interacting domain protein  66.6 
 
 		 557 aa  737    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.335445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  64.47 
 
 		 556 aa  697    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  67.1 
 
 		 563 aa  746    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  64.29 
 
 		 557 aa  695    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  69.38 
 
 		 572 aa  756    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  67.98 
 
 		 558 aa  765    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  64.27 
 
 		 560 aa  704    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  65.35 
 
 		 558 aa  723    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 		 575 aa  1160    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  64.47 
 
 		 556 aa  695    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  56.11 
 
 		 570 aa  653    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  55.93 
 
 		 570 aa  649    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  68.06 
 
 		 557 aa  723    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  61.47 
 
 		 566 aa  685    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  64.66 
 
 		 556 aa  698    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  63.93 
 
 		 557 aa  695    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  69.57 
 
 		 571 aa  822    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  47.04 
 
 		 648 aa  432  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  44.66 
 
 		 639 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  45.33 
 
 		 650 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  45.45 
 
 		 652 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  45.34 
 
 		 619 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  45.34 
 
 		 619 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  43.06 
 
 		 670 aa  393  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  46.07 
 
 		 655 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  30.53 
 
 		 645 aa  159  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  31.97 
 
 		 631 aa  155  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  30 
 
 		 637 aa  154  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  31.05 
 
 		 680 aa  150  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  29.09 
 
 		 638 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  29.44 
 
 		 662 aa  141  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  29.19 
 
 		 778 aa  140  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  29.57 
 
 		 731 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  29.81 
 
 		 698 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  30.26 
 
 		 632 aa  139  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  29.36 
 
 		 693 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  29.18 
 
 		 711 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  30.04 
 
 		 635 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  29.86 
 
 		 765 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  39.6 
 
 		 804 aa  113  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  37.99 
 
 		 793 aa  113  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  41.03 
 
 		 808 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  34.15 
 
 		 804 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  32.73 
 
 		 806 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  37.75 
 
 		 805 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  32.99 
 
 		 806 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  32.99 
 
 		 806 aa  110  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  38.43 
 
 		 813 aa  110  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  38.69 
 
 		 807 aa  110  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  39.3 
 
 		 805 aa  109  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  35.1 
 
 		 812 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  39.2 
 
 		 807 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  35.1 
 
 		 812 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  37.25 
 
 		 805 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  40.5 
 
 		 806 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  40.41 
 
 		 812 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  31.73 
 
 		 805 aa  108  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  39.2 
 
 		 806 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  35.14 
 
 		 867 aa  107  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  39.9 
 
 		 812 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  27.87 
 
 		 774 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  37.19 
 
 		 807 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  35.64 
 
 		 810 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  30.06 
 
 		 806 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  37.81 
 
 		 818 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 812 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  37.69 
 
 		 819 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  30.06 
 
 		 806 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  33.92 
 
 		 812 aa  105  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  37.19 
 
 		 808 aa  105  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  37.27 
 
 		 816 aa  105  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  38.6 
 
 		 793 aa  105  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  33.08 
 
 		 813 aa  104  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  32.81 
 
 		 815 aa  104  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  38.12 
 
 		 816 aa  104  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  34.28 
 
 		 812 aa  103  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  27.31 
 
 		 816 aa  103  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  35.68 
 
 		 823 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  34.82 
 
 		 815 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  34.93 
 
 		 808 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  32.59 
 
 		 808 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 806 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  35.75 
 
 		 799 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 806 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  39.8 
 
 		 802 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  37.81 
 
 		 812 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  37.06 
 
 		 810 aa  101  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  28.34 
 
 		 815 aa  102  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4987  ATP-dependent protease La  38.02 
 
 		 824 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00166311  normal  0.674678 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  37.82 
 
 		 810 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>