More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3302 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  57.66 
 
 		 639 aa  722    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  65.74 
 
 		 655 aa  815    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  62.82 
 
 		 652 aa  798    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  100 
 
 		 648 aa  1302    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  55.9 
 
 		 619 aa  675    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  55.9 
 
 		 619 aa  675    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  56.54 
 
 		 670 aa  769    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  69.73 
 
 		 650 aa  948    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  46.85 
 
 		 558 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  47.04 
 
 		 575 aa  432  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  46.79 
 
 		 570 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  46.79 
 
 		 570 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  45.29 
 
 		 558 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  42.94 
 
 		 571 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  46.64 
 
 		 579 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  46.11 
 
 		 572 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  45.54 
 
 		 558 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  46.65 
 
 		 556 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  46.23 
 
 		 557 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  45.31 
 
 		 556 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  44.02 
 
 		 537 aa  404  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  45.33 
 
 		 556 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  45.53 
 
 		 556 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0492  Sigma 54 interacting domain protein  45.6 
 
 		 557 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.335445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  44.86 
 
 		 560 aa  399  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  45.33 
 
 		 557 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  45.33 
 
 		 557 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  45.33 
 
 		 557 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  45.33 
 
 		 557 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  45.13 
 
 		 556 aa  396  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  45.33 
 
 		 557 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  45.33 
 
 		 557 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  45.13 
 
 		 557 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  43.15 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.16 
 
 		 563 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  31.52 
 
 		 680 aa  162  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  30.93 
 
 		 635 aa  157  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  29.93 
 
 		 631 aa  155  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  30.32 
 
 		 645 aa  154  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  31.76 
 
 		 638 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  30.56 
 
 		 662 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  31.04 
 
 		 637 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  30.13 
 
 		 698 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  29.64 
 
 		 632 aa  139  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  31.55 
 
 		 731 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  30.63 
 
 		 778 aa  135  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  30.17 
 
 		 693 aa  135  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  30.02 
 
 		 765 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  28.05 
 
 		 793 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  26.9 
 
 		 808 aa  127  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  26.45 
 
 		 791 aa  127  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  26.91 
 
 		 809 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  29.85 
 
 		 812 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.58 
 
 		 787 aa  126  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  27.86 
 
 		 802 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  26.28 
 
 		 791 aa  125  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  26.28 
 
 		 791 aa  125  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.58 
 
 		 786 aa  124  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  26.49 
 
 		 806 aa  124  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  27.01 
 
 		 784 aa  124  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  28.12 
 
 		 711 aa  123  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  26.49 
 
 		 806 aa  123  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  26.94 
 
 		 804 aa  123  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  27.01 
 
 		 785 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  27.47 
 
 		 783 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  27.01 
 
 		 785 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  29.01 
 
 		 802 aa  123  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  27.01 
 
 		 785 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  28.05 
 
 		 802 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  28.05 
 
 		 802 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.24 
 
 		 793 aa  122  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  26.63 
 
 		 785 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0376  ATP-dependent protease La  25.54 
 
 		 776 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  27.47 
 
 		 807 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  25.93 
 
 		 816 aa  120  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  28.02 
 
 		 783 aa  120  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  28.05 
 
 		 802 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.94 
 
 		 784 aa  120  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.91 
 
 		 793 aa  120  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  26.44 
 
 		 785 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.14 
 
 		 784 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  27.14 
 
 		 784 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.14 
 
 		 784 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.14 
 
 		 784 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.97 
 
 		 799 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  27.14 
 
 		 799 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  27.14 
 
 		 784 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  26.78 
 
 		 785 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  26.78 
 
 		 785 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.14 
 
 		 784 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.14 
 
 		 784 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1744  ATP-dependent protease La  26.43 
 
 		 798 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484284  hitchhiker  0.00114156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  26.44 
 
 		 785 aa  118  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  27.5 
 
 		 785 aa  118  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  27.73 
 
 		 778 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1659  Lon-A peptidase  28.19 
 
 		 875 aa  118  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.241054  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.14 
 
 		 784 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  27.98 
 
 		 804 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.14 
 
 		 784 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.14 
 
 		 784 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>