More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3199 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  79.44 
 
 
778 aa  1053    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  100 
 
 
693 aa  1392    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  63.78 
 
 
632 aa  814    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  80.15 
 
 
731 aa  1085    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  64.23 
 
 
662 aa  773    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  61.12 
 
 
698 aa  811    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  57.61 
 
 
631 aa  709    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  64.6 
 
 
645 aa  806    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  62.5 
 
 
680 aa  785    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  64.33 
 
 
638 aa  808    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  63.27 
 
 
637 aa  793    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  78.56 
 
 
765 aa  1078    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  64.15 
 
 
635 aa  818    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  85.85 
 
 
711 aa  1123    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0433  peptidase S16, Lon-like protease  29.06 
 
 
692 aa  274  3e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.317598  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1487  peptidase S16, Lon-like protease  28.76 
 
 
693 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1350  peptidase S16, Lon-like protease  33.67 
 
 
703 aa  207  7e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.966121  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0404  Lon-B peptidase  32.32 
 
 
692 aa  201  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.175581  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0502  peptidase S16, Lon-like protease  32.83 
 
 
685 aa  201  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.85369  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1394  AAA ATPase central domain protein  47.23 
 
 
496 aa  201  5e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  30.15 
 
 
571 aa  154  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  28.83 
 
 
575 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  31.1 
 
 
558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.12 
 
 
563 aa  140  7.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  29.81 
 
 
579 aa  140  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  28.67 
 
 
558 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  30.17 
 
 
648 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  30.07 
 
 
537 aa  136  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  31.14 
 
 
803 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0319  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.97 
 
 
783 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  28.81 
 
 
803 aa  135  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  25.66 
 
 
810 aa  134  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  28.76 
 
 
652 aa  134  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  28.17 
 
 
819 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  31.85 
 
 
556 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  28.17 
 
 
819 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  29.05 
 
 
570 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  29.08 
 
 
570 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  27.25 
 
 
823 aa  132  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  27.75 
 
 
639 aa  132  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.47 
 
 
788 aa  130  8.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  26.92 
 
 
786 aa  127  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  29.26 
 
 
566 aa  127  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  27.41 
 
 
777 aa  127  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  27.01 
 
 
660 aa  127  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  26.86 
 
 
560 aa  127  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.37 
 
 
807 aa  126  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  34.8 
 
 
811 aa  126  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  27.54 
 
 
786 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  38.54 
 
 
816 aa  125  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  37.27 
 
 
810 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  30.26 
 
 
844 aa  124  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  36.73 
 
 
816 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  29.56 
 
 
558 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0928  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.89 
 
 
794 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182033  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.8 
 
 
805 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  25.8 
 
 
805 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  36.73 
 
 
817 aa  120  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  36.61 
 
 
821 aa  120  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  25.57 
 
 
805 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  25.11 
 
 
806 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.9 
 
 
805 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2347  peptidase S16, lon domain-containing protein  28 
 
 
805 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3407  peptidase S16 lon domain protein  30 
 
 
806 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2793  ATP-dependent protease, putative  28.16 
 
 
814 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281078  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  34.8 
 
 
811 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  33.22 
 
 
802 aa  118  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  36 
 
 
816 aa  118  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  28.77 
 
 
619 aa  119  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  28.77 
 
 
619 aa  119  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  27.59 
 
 
670 aa  118  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2309  peptidase S16 lon domain protein  26.78 
 
 
817 aa  118  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  25.45 
 
 
787 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  28.63 
 
 
821 aa  117  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  25.8 
 
 
786 aa  117  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1361  Lon-A peptidase  35.82 
 
 
803 aa  118  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0950  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.43 
 
 
794 aa  117  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0390  ATP-dependent protease La  38.57 
 
 
800 aa  117  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.754053  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1838  ATP-dependent protease La  34.94 
 
 
805 aa  117  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  34.43 
 
 
812 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  27.94 
 
 
825 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  38 
 
 
804 aa  117  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  38 
 
 
804 aa  117  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  38.46 
 
 
806 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.89 
 
 
810 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 
810 aa  117  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  34.43 
 
 
812 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  36.1 
 
 
803 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  27.4 
 
 
650 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2542  ATP-dependent protease La  31.18 
 
 
805 aa  116  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142906 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  29.24 
 
 
556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  29.24 
 
 
556 aa  115  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4987  ATP-dependent protease La  33.22 
 
 
824 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00166311  normal  0.674678 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  33.69 
 
 
819 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2122  ATP-dependent protease La  38.69 
 
 
806 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1908  ATP-dependent protease La  38.69 
 
 
807 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261934  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1463  ATP-dependent protease La  38.69 
 
 
805 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2479  ATP-dependent protease La  38.69 
 
 
805 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.71727  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2293  Lon-A peptidase  38.19 
 
 
807 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.441771 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3350  ATP-dependent protease La  38.69 
 
 
805 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>