More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0433 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0404  Lon-B peptidase  93.64 
 
 
692 aa  1299    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.175581  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1487  peptidase S16, Lon-like protease  93.94 
 
 
693 aa  1280    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0502  peptidase S16, Lon-like protease  84.54 
 
 
685 aa  1181    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.85369  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1350  peptidase S16, Lon-like protease  64.12 
 
 
703 aa  899    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.966121  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0433  peptidase S16, Lon-like protease  100 
 
 
692 aa  1394    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.317598  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  31.91 
 
 
632 aa  301  2e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  31.25 
 
 
635 aa  299  9e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  31.21 
 
 
711 aa  292  1e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  29.32 
 
 
778 aa  268  4e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  27.99 
 
 
631 aa  258  3e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  29.72 
 
 
693 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  33.42 
 
 
637 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1394  AAA ATPase central domain protein  32.82 
 
 
496 aa  209  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  32.27 
 
 
638 aa  207  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  33.33 
 
 
731 aa  206  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  33.33 
 
 
645 aa  205  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  32.25 
 
 
698 aa  204  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  33.67 
 
 
680 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  32.43 
 
 
765 aa  200  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  31.96 
 
 
662 aa  190  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0220  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.09 
 
 
790 aa  105  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.229141  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  23.67 
 
 
798 aa  101  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  23.94 
 
 
810 aa  97.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  22.9 
 
 
808 aa  95.1  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  26.31 
 
 
787 aa  93.6  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  33.33 
 
 
648 aa  90.9  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  33.66 
 
 
815 aa  90.9  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  32.8 
 
 
650 aa  90.1  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  20.97 
 
 
813 aa  89.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  31.28 
 
 
619 aa  89.4  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  31.28 
 
 
619 aa  89.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3407  peptidase S16 lon domain protein  22.59 
 
 
806 aa  87.8  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025789  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2302  ATP-dependent protease La  26.02 
 
 
798 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235792  hitchhiker  0.000494744 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1904  ATP-dependent protease La  26.02 
 
 
798 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798335  hitchhiker  0.000618765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  23.05 
 
 
803 aa  86.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  31.05 
 
 
793 aa  85.9  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  31.19 
 
 
793 aa  85.5  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1744  ATP-dependent protease La  27.46 
 
 
798 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484284  hitchhiker  0.00114156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3467  ATP-dependent protease La  26.02 
 
 
798 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.895403  hitchhiker  0.000510926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23590  Peptidase S16, ATP-dependent protease  30.28 
 
 
797 aa  85.9  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  30.17 
 
 
783 aa  85.1  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  30.17 
 
 
783 aa  84.3  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  29.06 
 
 
804 aa  84.3  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  31.34 
 
 
810 aa  84  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1749  peptidase S16, ATP-dependent protease La  28.9 
 
 
798 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0163826 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  29.77 
 
 
816 aa  82.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2052  ATP-dependent protease La  28.44 
 
 
798 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155836  normal  0.0687597 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1060  ATP-dependent protease La  30.7 
 
 
798 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  29.38 
 
 
799 aa  82.4  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2264  putative ATP-dependent protease  54.88 
 
 
827 aa  82.4  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.412132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3724  ATP-dependent protease La  28.44 
 
 
798 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.639562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  28.73 
 
 
803 aa  81.6  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.4 
 
 
807 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  22.89 
 
 
813 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  30.28 
 
 
785 aa  81.6  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1838  ATP-dependent protease La  27.39 
 
 
805 aa  81.6  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203387  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3783  ATP-dependent protease La  29.61 
 
 
782 aa  81.3  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417007  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  30.19 
 
 
803 aa  80.5  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  27.19 
 
 
819 aa  80.5  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  27.85 
 
 
821 aa  80.5  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  45.79 
 
 
805 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  30.97 
 
 
856 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  30.7 
 
 
785 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  45.79 
 
 
806 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1725  ATP-dependent protease La  31.96 
 
 
814 aa  80.1  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000125978  decreased coverage  0.00323118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  29.28 
 
 
808 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  30.7 
 
 
785 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3695  Lon-A peptidase  28.31 
 
 
798 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2542  ATP-dependent protease La  29.6 
 
 
805 aa  80.1  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  30.7 
 
 
785 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0925  ATP-dependent protease  28.5 
 
 
786 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.819231  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  28.57 
 
 
798 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  45.79 
 
 
805 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3494  Lon protease  28.57 
 
 
798 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935461  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  28.17 
 
 
810 aa  79.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.3 
 
 
786 aa  79.7  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  30.57 
 
 
810 aa  79.3  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1607  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.1 
 
 
815 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.3 
 
 
787 aa  79.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  30.73 
 
 
785 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.71 
 
 
805 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  30.73 
 
 
785 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  30.81 
 
 
652 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  30.73 
 
 
785 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  30.1 
 
 
823 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  27.7 
 
 
805 aa  79  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  28.84 
 
 
832 aa  79  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  36.61 
 
 
805 aa  79  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  36.94 
 
 
811 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.02 
 
 
810 aa  79  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  28.17 
 
 
867 aa  78.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  30.52 
 
 
784 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  28.64 
 
 
806 aa  79  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  27.36 
 
 
816 aa  79  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  27.43 
 
 
812 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  38.79 
 
 
791 aa  79  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2513  ATP-dependent protease La  30.09 
 
 
813 aa  78.2  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  29.61 
 
 
807 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  27.12 
 
 
806 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  27.55 
 
 
670 aa  78.6  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>