More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1487 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0433  peptidase S16, Lon-like protease  93.94 
 
 		 692 aa  1288    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.317598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0404  Lon-B peptidase  95.67 
 
 		 692 aa  1315    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.175581  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1487  peptidase S16, Lon-like protease  100 
 
 		 693 aa  1393    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0502  peptidase S16, Lon-like protease  84.54 
 
 		 685 aa  1179    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.85369  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1350  peptidase S16, Lon-like protease  64.14 
 
 		 703 aa  895    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.966121  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  31.54 
 
 		 635 aa  294  3e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  31.07 
 
 		 711 aa  288  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  29.9 
 
 		 638 aa  280  7e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  29.52 
 
 		 680 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  28.95 
 
 		 693 aa  246  8e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  33.56 
 
 		 631 aa  236  8e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  33.41 
 
 		 632 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  32.18 
 
 		 637 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1394  AAA ATPase central domain protein  33.18 
 
 		 496 aa  211  3e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  34.59 
 
 		 731 aa  211  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  31.68 
 
 		 698 aa  207  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  33.94 
 
 		 645 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  32.83 
 
 		 765 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  32.01 
 
 		 778 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  31.96 
 
 		 662 aa  190  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0220  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.15 
 
 		 790 aa  100  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.229141  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  24.84 
 
 		 798 aa  100  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  24.03 
 
 		 810 aa  95.1  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  31.63 
 
 		 648 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  31.75 
 
 		 650 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  25.28 
 
 		 787 aa  88.6  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  24 
 
 		 808 aa  88.2  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  32.37 
 
 		 619 aa  87.4  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  32.37 
 
 		 619 aa  87.4  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3407  peptidase S16 lon domain protein  23.03 
 
 		 806 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025789  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  33.5 
 
 		 815 aa  85.1  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  29.47 
 
 		 799 aa  84.3  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  27.84 
 
 		 670 aa  83.2  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23590  Peptidase S16, ATP-dependent protease  30.96 
 
 		 797 aa  81.6  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  29.57 
 
 		 804 aa  81.6  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3467  ATP-dependent protease La  26.1 
 
 		 798 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.895403  hitchhiker  0.000510926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1904  ATP-dependent protease La  26.1 
 
 		 798 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798335  hitchhiker  0.000618765 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  29.95 
 
 		 810 aa  80.9  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  29.89 
 
 		 803 aa  80.9  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  38.33 
 
 		 791 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2302  ATP-dependent protease La  26.1 
 
 		 798 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235792  hitchhiker  0.000494744 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2264  putative ATP-dependent protease  53.66 
 
 		 827 aa  80.5  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.412132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1744  ATP-dependent protease La  29.9 
 
 		 798 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484284  hitchhiker  0.00114156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1749  peptidase S16, ATP-dependent protease La  30.57 
 
 		 798 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0163826 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1607  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.29 
 
 		 815 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  29.63 
 
 		 652 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0925  ATP-dependent protease  30 
 
 		 786 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.819231  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.27 
 
 		 807 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  29.31 
 
 		 783 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  45.16 
 
 		 806 aa  79  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3724  ATP-dependent protease La  29.38 
 
 		 798 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.639562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  29.49 
 
 		 558 aa  79  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1838  ATP-dependent protease La  27.1 
 
 		 805 aa  79  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203387  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2052  ATP-dependent protease La  29.65 
 
 		 798 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155836  normal  0.0687597 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  28.45 
 
 		 783 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  30.9 
 
 		 660 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  45.16 
 
 		 805 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.16 
 
 		 805 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  45.16 
 
 		 805 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  28.63 
 
 		 802 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2007  ATP-dependent protease, putative  31.72 
 
 		 829 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.303021  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0204  Lon-A peptidase  29.95 
 
 		 801 aa  77.8  0.0000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0899  ATP-dependent protease La  29.95 
 
 		 802 aa  77.8  0.0000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.303958  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3494  Lon protease  29.47 
 
 		 798 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3695  Lon-A peptidase  28.87 
 
 		 798 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  29.47 
 
 		 798 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  29 
 
 		 639 aa  76.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  29.3 
 
 		 832 aa  77  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  29.07 
 
 		 802 aa  77  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  29.7 
 
 		 808 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  29.21 
 
 		 806 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.09 
 
 		 810 aa  77  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  28 
 
 		 813 aa  76.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2107  peptidase S16 lon domain-containing protein  22.81 
 
 		 806 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.801534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  26.98 
 
 		 816 aa  77  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  29.21 
 
 		 806 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 		 785 aa  77  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  29.44 
 
 		 810 aa  76.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.36 
 
 		 793 aa  76.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3783  ATP-dependent protease La  27.53 
 
 		 782 aa  76.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417007  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.36 
 
 		 793 aa  76.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  29.44 
 
 		 808 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  30.73 
 
 		 803 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  28.17 
 
 		 806 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  28.04 
 
 		 810 aa  76.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3006  ATP-dependent protease-like protein  22.25 
 
 		 815 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  28.17 
 
 		 806 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  28.71 
 
 		 807 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  27.81 
 
 		 821 aa  76.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  26.29 
 
 		 806 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1297  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.87 
 
 		 786 aa  75.9  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000625582  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0312  peptidase S16 lon domain protein  29.03 
 
 		 873 aa  75.5  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345035 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  29.21 
 
 		 807 aa  75.5  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1979  ATP-dependent protease La  27.54 
 
 		 859 aa  75.9  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205373 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  30.29 
 
 		 805 aa  75.1  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  28.71 
 
 		 809 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  38.38 
 
 		 861 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 805 aa  75.1  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  30.2 
 
 		 785 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  30.69 
 
 		 785 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>