More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3583 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  100 
 
 		 660 aa  1300    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0831  ATP-dependent protease, putative  52.29 
 
 		 811 aa  485  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.726223  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  52.95 
 
 		 844 aa  481  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  52.25 
 
 		 803 aa  480  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  50.92 
 
 		 803 aa  481  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2793  ATP-dependent protease, putative  50.93 
 
 		 814 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  49.59 
 
 		 808 aa  477  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.46 
 
 		 843 aa  475  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  49.08 
 
 		 809 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  53.14 
 
 		 832 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  52.46 
 
 		 813 aa  466  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  48.46 
 
 		 818 aa  462  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  50.88 
 
 		 813 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1717  peptidase S16, lon domain-containing protein  50.3 
 
 		 801 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2449  peptidase S16 lon domain protein  52.32 
 
 		 809 aa  458  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849825  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1447  ATP-dependent protease, putative  50.56 
 
 		 806 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  46.18 
 
 		 819 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0298  ATP-dependent protease, putative  49.5 
 
 		 799 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  45.99 
 
 		 819 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  48.13 
 
 		 861 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  45.98 
 
 		 814 aa  452  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  45.71 
 
 		 821 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.45 
 
 		 805 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  47.84 
 
 		 803 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  45.91 
 
 		 798 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2746  peptidase S16, lon-like  44.11 
 
 		 811 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000135674  normal  0.815417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2107  peptidase S16 lon domain-containing protein  49.69 
 
 		 806 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.801534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1417  peptidase S16 lon domain protein  50.7 
 
 		 819 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185581  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0802  peptidase S16, lon-like protein  44.42 
 
 		 801 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3006  ATP-dependent protease-like protein  48.67 
 
 		 815 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  46.77 
 
 		 825 aa  435  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3069  ATP-dependent protease, putative  45.27 
 
 		 813 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2347  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.81 
 
 		 805 aa  429  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.98 
 
 		 802 aa  422  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2264  putative ATP-dependent protease  45.93 
 
 		 827 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.412132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  44.09 
 
 		 823 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.03 
 
 		 807 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1322  hypothetical protein  43.15 
 
 		 951 aa  404  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5216  putative ATP-dependent protease  44.17 
 
 		 817 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0128241  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4505  ATP-dependent protease  44.26 
 
 		 812 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60550  putative ATP-dependent protease  44.38 
 
 		 817 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190138  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0680  ATP-dependent protease, putative  44.05 
 
 		 812 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0697551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1200  ATP-dependent protease-like protein  44.05 
 
 		 829 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000280038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0712  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.05 
 
 		 812 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  44.02 
 
 		 786 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2309  peptidase S16 lon domain protein  43.03 
 
 		 817 aa  402  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1056  peptidase S16, lon-like  43.15 
 
 		 975 aa  402  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  43.8 
 
 		 786 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40850  ATP-dependent protease  43.99 
 
 		 806 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.887392  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0711  ATP-dependent protease-like protein  44.05 
 
 		 812 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.807483  normal  0.0469717 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  42.83 
 
 		 831 aa  398  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000165888  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1543  peptidase S16, lon domain-containing protein  46.72 
 
 		 865 aa  399  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  39.74 
 
 		 810 aa  396  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01670  putative ATP-dependent protease  42.2 
 
 		 798 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4869  ATP-dependent protease, putative  43.39 
 
 		 812 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1567  peptidase S16, lon-like  42.92 
 
 		 795 aa  395  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  42.83 
 
 		 786 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0928  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.43 
 
 		 794 aa  392  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182033  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0925  ATP-dependent protease  38.76 
 
 		 786 aa  391  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.819231  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0950  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.99 
 
 		 794 aa  392  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  41.55 
 
 		 800 aa  389  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000551631  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4585  ATP-dependent protease, putative  42.8 
 
 		 811 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4259  ATP-dependent protease, putative  42.8 
 
 		 811 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2007  ATP-dependent protease, putative  42.89 
 
 		 829 aa  389  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.303021  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.68 
 
 		 805 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  43.46 
 
 		 805 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.15 
 
 		 805 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3407  peptidase S16 lon domain protein  42.47 
 
 		 806 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025789  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  43.52 
 
 		 805 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  40.68 
 
 		 810 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  42.48 
 
 		 777 aa  382  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  39.96 
 
 		 805 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.96 
 
 		 805 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  40.09 
 
 		 787 aa  382  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  42.64 
 
 		 806 aa  378  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.92 
 
 		 810 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.83 
 
 		 816 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1250  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.59 
 
 		 805 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1297  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.16 
 
 		 786 aa  378  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000625582  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1724  putative ATP-dependent protease LA  40.79 
 
 		 802 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  41.05 
 
 		 807 aa  375  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  40.65 
 
 		 795 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.58 
 
 		 788 aa  373  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  43.92 
 
 		 791 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1607  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.92 
 
 		 815 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0319  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.77 
 
 		 783 aa  370  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0312  peptidase S16 lon domain protein  41.37 
 
 		 873 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345035 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0955  ATP-dependent protease, putative  38.34 
 
 		 797 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.099615  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.21 
 
 		 806 aa  355  1e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.347497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0590  ATP-dependent protease, putative  39.92 
 
 		 811 aa  355  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0118699 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2600  ATP-dependent protease, putative  43.62 
 
 		 784 aa  349  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2626  ATP-dependent protease, putative  41.62 
 
 		 803 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000239913  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1399  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.22 
 
 		 810 aa  347  4e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000669789  hitchhiker  0.00375305 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1288  peptidase S16 lon domain protein  40.53 
 
 		 811 aa  336  9e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2798  peptidase S16 lon domain protein  40.08 
 
 		 811 aa  334  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00224654  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1037  peptidase S16 lon domain protein  36.94 
 
 		 774 aa  331  2e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.350098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0220  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.28 
 
 		 790 aa  310  4e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.229141  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2860  hypothetical protein  43.58 
 
 		 589 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000072938  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2551  hypothetical protein  43.34 
 
 		 589 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000314257  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0676  putative ATP-dependent protease LA, putative  39.13 
 
 		 810 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>