More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4930 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  62.82 
 
 		 648 aa  814    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 		 652 aa  1323    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  63 
 
 		 655 aa  776    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  53.14 
 
 		 639 aa  688    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  61.03 
 
 		 650 aa  795    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  54.37 
 
 		 670 aa  709    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  51.29 
 
 		 619 aa  619  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  51.29 
 
 		 619 aa  619  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  44.57 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  45.45 
 
 		 575 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  45 
 
 		 558 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  43.8 
 
 		 558 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  44.13 
 
 		 570 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  44.33 
 
 		 570 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  44.93 
 
 		 579 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0492  Sigma 54 interacting domain protein  45 
 
 		 557 aa  396  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.335445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  46.23 
 
 		 572 aa  399  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  44.71 
 
 		 558 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  44.22 
 
 		 556 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  44.14 
 
 		 557 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  44.29 
 
 		 556 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  43.29 
 
 		 566 aa  391  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  42.91 
 
 		 537 aa  392  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  43.33 
 
 		 560 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  43.2 
 
 		 556 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.71 
 
 		 563 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  43.4 
 
 		 556 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  43 
 
 		 557 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  43 
 
 		 557 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  43 
 
 		 557 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  43 
 
 		 557 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  43 
 
 		 557 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  43 
 
 		 557 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  43 
 
 		 556 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  43 
 
 		 557 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  31.76 
 
 		 698 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  30.58 
 
 		 680 aa  150  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  32.11 
 
 		 635 aa  147  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  29.88 
 
 		 662 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  30.94 
 
 		 637 aa  145  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  29.02 
 
 		 645 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  28.66 
 
 		 638 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  30.07 
 
 		 631 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  28.76 
 
 		 693 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  29.41 
 
 		 632 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  27.74 
 
 		 711 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  28.73 
 
 		 731 aa  130  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  28.29 
 
 		 778 aa  128  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  27.81 
 
 		 802 aa  126  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  38.81 
 
 		 799 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  27 
 
 		 811 aa  124  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  34.39 
 
 		 808 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  28.1 
 
 		 765 aa  121  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  27.46 
 
 		 802 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  27.49 
 
 		 787 aa  120  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  27.11 
 
 		 802 aa  120  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  27.11 
 
 		 802 aa  120  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  27.03 
 
 		 816 aa  120  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 756 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  26.98 
 
 		 816 aa  120  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  37.17 
 
 		 809 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  35.68 
 
 		 804 aa  119  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  26.91 
 
 		 805 aa  119  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  27.47 
 
 		 806 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02475  ATP-dependent protease La  27.49 
 
 		 823 aa  118  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  26.28 
 
 		 804 aa  118  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1979  ATP-dependent protease La  23.77 
 
 		 859 aa  117  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205373 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  27.64 
 
 		 804 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  27.64 
 
 		 804 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  29.49 
 
 		 793 aa  117  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  27.68 
 
 		 821 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  36.13 
 
 		 816 aa  116  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  26.84 
 
 		 802 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1659  Lon-A peptidase  27.64 
 
 		 875 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.241054  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  37.24 
 
 		 819 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2032  Lon-A peptidase  36.36 
 
 		 809 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.914021  decreased coverage  0.00112725 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  26.72 
 
 		 810 aa  115  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2518  Lon-A peptidase  36.02 
 
 		 799 aa  115  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571942  normal  0.381839 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1899  ATP-dependent protease La  27.64 
 
 		 874 aa  115  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67239  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  26.41 
 
 		 816 aa  115  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2542  ATP-dependent protease La  37.17 
 
 		 805 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  26.16 
 
 		 806 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  36.65 
 
 		 806 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 		 812 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  27.31 
 
 		 813 aa  114  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  26.19 
 
 		 810 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  36.65 
 
 		 806 aa  114  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  37.7 
 
 		 812 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  34.38 
 
 		 818 aa  113  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  36.96 
 
 		 802 aa  113  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  36.46 
 
 		 807 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  36.46 
 
 		 806 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  36.46 
 
 		 806 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  26.77 
 
 		 785 aa  113  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  26.44 
 
 		 785 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  27.18 
 
 		 812 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.02 
 
 		 787 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  26.02 
 
 		 815 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  25.25 
 
 		 805 aa  112  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  27.05 
 
 		 867 aa  112  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>