More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1383 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  60.3 
 
 		 557 aa  652    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  60.11 
 
 		 557 aa  648    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0492  Sigma 54 interacting domain protein  57.82 
 
 		 557 aa  648    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.335445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  58.29 
 
 		 560 aa  645    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  60.3 
 
 		 557 aa  652    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  60.3 
 
 		 557 aa  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  60.3 
 
 		 557 aa  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  58.26 
 
 		 579 aa  648    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  60.3 
 
 		 557 aa  650    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  59 
 
 		 571 aa  694    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  58.64 
 
 		 558 aa  665    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  60.3 
 
 		 557 aa  652    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  59.63 
 
 		 556 aa  649    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  59.67 
 
 		 557 aa  653    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  58.19 
 
 		 563 aa  640    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  60.37 
 
 		 556 aa  648    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  58.35 
 
 		 558 aa  652    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  59.85 
 
 		 556 aa  649    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  98.77 
 
 		 570 aa  1133    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  59.48 
 
 		 556 aa  647    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  100 
 
 		 570 aa  1145    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  55.93 
 
 		 575 aa  667    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  61.21 
 
 		 558 aa  655    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  59.11 
 
 		 556 aa  645    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  55.7 
 
 		 537 aa  642    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  56.98 
 
 		 566 aa  631  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  57.2 
 
 		 572 aa  621  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  46.52 
 
 		 648 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  45.22 
 
 		 639 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  44.71 
 
 		 650 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  46.06 
 
 		 619 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  46.06 
 
 		 619 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  44.09 
 
 		 652 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  46.56 
 
 		 655 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  41.23 
 
 		 670 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  30.46 
 
 		 680 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  28.86 
 
 		 631 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  31.45 
 
 		 813 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  30.26 
 
 		 638 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  29.75 
 
 		 645 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  28.7 
 
 		 778 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  31.1 
 
 		 816 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  28.83 
 
 		 731 aa  130  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  29.91 
 
 		 637 aa  128  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  30.04 
 
 		 807 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  28.73 
 
 		 632 aa  126  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  28.86 
 
 		 693 aa  126  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  29.53 
 
 		 698 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  30.74 
 
 		 778 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  28.26 
 
 		 813 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  29.57 
 
 		 817 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  27.68 
 
 		 711 aa  123  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  30.14 
 
 		 792 aa  123  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  28.51 
 
 		 774 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  28.73 
 
 		 765 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  29.47 
 
 		 823 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  41.33 
 
 		 815 aa  121  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  28.93 
 
 		 635 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  29.16 
 
 		 816 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0390  ATP-dependent protease La  34.35 
 
 		 800 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.754053  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  29.3 
 
 		 768 aa  119  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  28.11 
 
 		 823 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  28.81 
 
 		 811 aa  117  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  29.18 
 
 		 775 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  28.89 
 
 		 817 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0470  hypothetical protein  28.54 
 
 		 827 aa  116  8.999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  29.32 
 
 		 806 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  28.07 
 
 		 780 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  39.47 
 
 		 810 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  28.94 
 
 		 812 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  38.42 
 
 		 810 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  29.49 
 
 		 806 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  39.25 
 
 		 793 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  37.89 
 
 		 806 aa  114  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  28.85 
 
 		 817 aa  114  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  27.54 
 
 		 806 aa  114  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  27.54 
 
 		 806 aa  114  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  41.05 
 
 		 816 aa  114  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  28.84 
 
 		 788 aa  114  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  38.69 
 
 		 800 aa  113  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  39.13 
 
 		 819 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  29.75 
 
 		 810 aa  114  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  38 
 
 		 815 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  33.11 
 
 		 807 aa  113  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0112  ATP-dependent protease La  39.59 
 
 		 820 aa  113  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.187598 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  39.9 
 
 		 785 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  39.9 
 
 		 784 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  37.89 
 
 		 805 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1732  ATP-dependent protease La  39.5 
 
 		 821 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.594571  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  36.7 
 
 		 793 aa  113  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  39.9 
 
 		 785 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  27.71 
 
 		 802 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  27.91 
 
 		 802 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  39.9 
 
 		 785 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  27.83 
 
 		 815 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  37.95 
 
 		 798 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  33.56 
 
 		 804 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  29.35 
 
 		 803 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  37.37 
 
 		 804 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  33 
 
 		 802 aa  112  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0924778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>