More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2694 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  61.67 
 
 		 778 aa  739    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  78.66 
 
 		 645 aa  1002    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  60.68 
 
 		 731 aa  759    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  67.5 
 
 		 698 aa  832    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  80.17 
 
 		 662 aa  994    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  75.08 
 
 		 680 aa  928    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  64.47 
 
 		 765 aa  788    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  72.28 
 
 		 632 aa  920    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  60.71 
 
 		 711 aa  778    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  66.83 
 
 		 637 aa  844    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  100 
 
 		 638 aa  1298    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  63.9 
 
 		 693 aa  768    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  57.93 
 
 		 631 aa  705    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  66.4 
 
 		 635 aa  832    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1350  peptidase S16, Lon-like protease  31.94 
 
 		 703 aa  209  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.966121  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1394  AAA ATPase central domain protein  46.37 
 
 		 496 aa  209  1e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0433  peptidase S16, Lon-like protease  31.72 
 
 		 692 aa  206  9e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.317598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1487  peptidase S16, Lon-like protease  32.23 
 
 		 693 aa  205  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0404  Lon-B peptidase  31.38 
 
 		 692 aa  205  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.175581  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0502  peptidase S16, Lon-like protease  31.14 
 
 		 685 aa  201  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.85369  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  31.76 
 
 		 648 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  29.82 
 
 		 571 aa  150  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  29.09 
 
 		 575 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  30.56 
 
 		 558 aa  146  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  29.21 
 
 		 639 aa  144  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.51 
 
 		 807 aa  144  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0928  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.03 
 
 		 794 aa  139  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  28.38 
 
 		 819 aa  137  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  28.24 
 
 		 810 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  30.09 
 
 		 558 aa  137  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  28.12 
 
 		 810 aa  137  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  27.93 
 
 		 819 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  30.04 
 
 		 570 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  30.26 
 
 		 570 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.08 
 
 		 802 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0950  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.37 
 
 		 794 aa  134  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  30.3 
 
 		 650 aa  134  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  25.88 
 
 		 660 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  28.66 
 
 		 652 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  28.88 
 
 		 803 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  28.67 
 
 		 566 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  30.75 
 
 		 558 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  26.56 
 
 		 825 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  29.45 
 
 		 803 aa  128  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  28.86 
 
 		 786 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  27.68 
 
 		 670 aa  127  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.67 
 
 		 563 aa  126  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  27.29 
 
 		 821 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  27.4 
 
 		 831 aa  126  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000165888  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2793  ATP-dependent protease, putative  29.71 
 
 		 814 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2309  peptidase S16 lon domain protein  27.04 
 
 		 817 aa  124  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  39.59 
 
 		 819 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  28.57 
 
 		 786 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  40.62 
 
 		 812 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.11 
 
 		 810 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  28.38 
 
 		 798 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  30.96 
 
 		 655 aa  122  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  40.1 
 
 		 812 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.52 
 
 		 816 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.12 
 
 		 805 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  27.11 
 
 		 560 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  29.66 
 
 		 844 aa  120  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  26.23 
 
 		 814 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  28.87 
 
 		 537 aa  120  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  28.19 
 
 		 809 aa  120  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.97 
 
 		 806 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.347497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0312  peptidase S16 lon domain protein  28.51 
 
 		 873 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345035 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  27.62 
 
 		 800 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000551631  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  29.17 
 
 		 572 aa  119  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  32.76 
 
 		 810 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  27.78 
 
 		 818 aa  118  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  26.39 
 
 		 823 aa  118  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  27.01 
 
 		 786 aa  118  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0802  peptidase S16, lon-like protein  24.57 
 
 		 801 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  27.02 
 
 		 813 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.65 
 
 		 805 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.29 
 
 		 843 aa  116  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  38.07 
 
 		 810 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  27.97 
 
 		 619 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  27.97 
 
 		 619 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  26.93 
 
 		 805 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.93 
 
 		 805 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  26.93 
 
 		 805 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1543  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.81 
 
 		 865 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  26.65 
 
 		 805 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.65 
 
 		 805 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  27.05 
 
 		 806 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0220  peptidase S16 lon domain-containing protein  23.69 
 
 		 790 aa  116  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.229141  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  27.85 
 
 		 795 aa  115  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4987  ATP-dependent protease La  41.24 
 
 		 824 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00166311  normal  0.674678 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  37.13 
 
 		 813 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2746  peptidase S16, lon-like  25.55 
 
 		 811 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000135674  normal  0.815417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  26.98 
 
 		 807 aa  114  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  37.63 
 
 		 802 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  37.63 
 
 		 802 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  25.96 
 
 		 777 aa  114  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  28.15 
 
 		 791 aa  114  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1955  ATP-dependent protease La  38.65 
 
 		 805 aa  114  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2479  ATP-dependent protease La  38.65 
 
 		 805 aa  114  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.71727  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2122  ATP-dependent protease La  38.65 
 
 		 806 aa  114  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>