More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2088 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  65.51 
 
 		 808 aa  1116    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  42.46 
 
 		 825 aa  669    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  43.56 
 
 		 821 aa  663    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  44.44 
 
 		 814 aa  684    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  51.26 
 
 		 844 aa  818    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  42.49 
 
 		 786 aa  637    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  49.06 
 
 		 813 aa  783    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  50.68 
 
 		 832 aa  816    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  44.99 
 
 		 798 aa  692    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.68 
 
 		 802 aa  639    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.08 
 
 		 807 aa  654    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  48.43 
 
 		 843 aa  785    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1543  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.61 
 
 		 865 aa  680    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  42.33 
 
 		 803 aa  664    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0298  ATP-dependent protease, putative  68.31 
 
 		 799 aa  1124    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2746  peptidase S16, lon-like  42.95 
 
 		 811 aa  669    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000135674  normal  0.815417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3006  ATP-dependent protease-like protein  45.32 
 
 		 815 aa  711    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  52.66 
 
 		 861 aa  825    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2107  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.84 
 
 		 806 aa  704    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.801534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1447  ATP-dependent protease, putative  45.92 
 
 		 806 aa  696    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  65.67 
 
 		 809 aa  1105    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 		 803 aa  1649    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0831  ATP-dependent protease, putative  52.09 
 
 		 811 aa  852    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.726223  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  41.56 
 
 		 786 aa  640    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  43.84 
 
 		 819 aa  672    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.69 
 
 		 805 aa  683    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  43.84 
 
 		 819 aa  676    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2793  ATP-dependent protease, putative  45.36 
 
 		 814 aa  713    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2449  peptidase S16 lon domain protein  46.26 
 
 		 809 aa  689    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849825  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  54.08 
 
 		 803 aa  886    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1417  peptidase S16 lon domain protein  45.48 
 
 		 819 aa  681    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185581  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  49.25 
 
 		 813 aa  774    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1717  peptidase S16, lon domain-containing protein  47.38 
 
 		 801 aa  765    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  48.12 
 
 		 818 aa  712    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2347  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.85 
 
 		 805 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  41.05 
 
 		 786 aa  635  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  42.12 
 
 		 787 aa  635  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  40.96 
 
 		 823 aa  627  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  41.67 
 
 		 800 aa  623  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000551631  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0802  peptidase S16, lon-like protein  39.64 
 
 		 801 aa  619  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3069  ATP-dependent protease, putative  40.97 
 
 		 813 aa  621  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  39.97 
 
 		 810 aa  617  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  41.01 
 
 		 807 aa  617  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1297  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.31 
 
 		 786 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000625582  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  39.3 
 
 		 831 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000165888  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.9 
 
 		 810 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1200  ATP-dependent protease-like protein  39.59 
 
 		 829 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000280038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5216  putative ATP-dependent protease  39.8 
 
 		 817 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0128241  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  40.46 
 
 		 805 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3407  peptidase S16 lon domain protein  40.59 
 
 		 806 aa  602  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.58 
 
 		 805 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.75 
 
 		 816 aa  601  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1250  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.33 
 
 		 805 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.33 
 
 		 805 aa  598  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0312  peptidase S16 lon domain protein  40.54 
 
 		 873 aa  598  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60550  putative ATP-dependent protease  39.8 
 
 		 817 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190138  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40850  ATP-dependent protease  39.26 
 
 		 806 aa  592  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.887392  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  40.49 
 
 		 795 aa  594  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  40.75 
 
 		 805 aa  591  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.75 
 
 		 805 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2309  peptidase S16 lon domain protein  40.33 
 
 		 817 aa  590  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  40.63 
 
 		 805 aa  591  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  40.87 
 
 		 810 aa  588  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  40.96 
 
 		 791 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  38.99 
 
 		 777 aa  584  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0925  ATP-dependent protease  38.98 
 
 		 786 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.819231  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  39.42 
 
 		 806 aa  580  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4259  ATP-dependent protease, putative  37.98 
 
 		 811 aa  582  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2264  putative ATP-dependent protease  38.31 
 
 		 827 aa  580  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.412132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4585  ATP-dependent protease, putative  37.72 
 
 		 811 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4869  ATP-dependent protease, putative  38.38 
 
 		 812 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0680  ATP-dependent protease, putative  38.13 
 
 		 812 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0697551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0711  ATP-dependent protease-like protein  38.13 
 
 		 812 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.807483  normal  0.0469717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0712  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.13 
 
 		 812 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.89 
 
 		 788 aa  568  1e-160  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4505  ATP-dependent protease  37.88 
 
 		 812 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01670  putative ATP-dependent protease  37.09 
 
 		 798 aa  560  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0928  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.31 
 
 		 794 aa  555  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0950  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.05 
 
 		 794 aa  550  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2007  ATP-dependent protease, putative  38.98 
 
 		 829 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.303021  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1567  peptidase S16, lon-like  37.25 
 
 		 795 aa  545  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617903  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1322  hypothetical protein  37.64 
 
 		 951 aa  533  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1607  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.79 
 
 		 815 aa  532  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1056  peptidase S16, lon-like  37.59 
 
 		 975 aa  531  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1724  putative ATP-dependent protease LA  36.61 
 
 		 802 aa  529  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0319  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.86 
 
 		 783 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2600  ATP-dependent protease, putative  39.12 
 
 		 784 aa  514  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2626  ATP-dependent protease, putative  37.61 
 
 		 803 aa  510  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000239913  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0676  putative ATP-dependent protease LA, putative  38.02 
 
 		 810 aa  502  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.94 
 
 		 806 aa  502  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.347497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0590  ATP-dependent protease, putative  34.25 
 
 		 811 aa  485  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0118699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  50.92 
 
 		 660 aa  480  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3315  putative ATP-dependent protease La, putative  37.29 
 
 		 806 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2798  peptidase S16 lon domain protein  35.56 
 
 		 811 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00224654  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1037  peptidase S16 lon domain protein  32.88 
 
 		 774 aa  458  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.350098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0220  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.46 
 
 		 790 aa  457  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.229141  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1288  peptidase S16 lon domain protein  36.97 
 
 		 811 aa  452  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0955  ATP-dependent protease, putative  33.25 
 
 		 797 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.099615  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2053  putative ATP-dependent protease La, putative  35.11 
 
 		 817 aa  412  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0284052  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1399  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.44 
 
 		 810 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000669789  hitchhiker  0.00375305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>