More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1477 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  66.85 
 
 		 579 aa  758    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  63 
 
 		 558 aa  717    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  61.99 
 
 		 558 aa  677    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  62.17 
 
 		 557 aa  671    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  62.76 
 
 		 557 aa  674    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  62.76 
 
 		 557 aa  674    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  62.76 
 
 		 557 aa  674    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  62.76 
 
 		 557 aa  674    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  67.1 
 
 		 575 aa  767    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0492  Sigma 54 interacting domain protein  70.04 
 
 		 557 aa  761    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.335445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  68.44 
 
 		 571 aa  790    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  62.76 
 
 		 556 aa  674    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  63.96 
 
 		 537 aa  717    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  62.76 
 
 		 557 aa  674    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  65.93 
 
 		 572 aa  724    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  64.53 
 
 		 557 aa  688    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  62.55 
 
 		 556 aa  678    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  64.62 
 
 		 558 aa  714    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  100 
 
 		 563 aa  1129    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  62.95 
 
 		 556 aa  676    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  58.19 
 
 		 570 aa  649    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  58.19 
 
 		 570 aa  645    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  62.17 
 
 		 557 aa  670    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  58.95 
 
 		 560 aa  686    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  59.89 
 
 		 566 aa  674    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  63.28 
 
 		 556 aa  686    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  62.76 
 
 		 556 aa  674    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  43.69 
 
 		 639 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  45.16 
 
 		 648 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  43.66 
 
 		 650 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  44.26 
 
 		 619 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  44.26 
 
 		 619 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  43.71 
 
 		 652 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  47.5 
 
 		 655 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  39.45 
 
 		 670 aa  372  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  30.75 
 
 		 645 aa  157  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  31.08 
 
 		 631 aa  155  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  31.35 
 
 		 698 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  30.43 
 
 		 637 aa  152  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  30.71 
 
 		 693 aa  151  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  30.18 
 
 		 731 aa  150  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  30.28 
 
 		 778 aa  147  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  30.74 
 
 		 765 aa  147  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  30.32 
 
 		 711 aa  145  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  29.67 
 
 		 638 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  31.49 
 
 		 680 aa  141  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  31.59 
 
 		 635 aa  141  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  29.86 
 
 		 662 aa  137  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  29.29 
 
 		 632 aa  137  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  27.13 
 
 		 817 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  30.28 
 
 		 816 aa  114  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  29.78 
 
 		 816 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  38.97 
 
 		 867 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  34.4 
 
 		 793 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  39.58 
 
 		 806 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  28.36 
 
 		 815 aa  110  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  30.16 
 
 		 817 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  36.82 
 
 		 812 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  27.82 
 
 		 823 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  31.96 
 
 		 812 aa  110  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  36.82 
 
 		 812 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  27.18 
 
 		 807 aa  110  9.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  28.04 
 
 		 819 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  39.06 
 
 		 805 aa  110  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  30.46 
 
 		 805 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  38.16 
 
 		 805 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  31.64 
 
 		 804 aa  110  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  38.16 
 
 		 805 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  36.08 
 
 		 819 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  38.31 
 
 		 806 aa  109  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  27.14 
 
 		 806 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  28.13 
 
 		 774 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  38.31 
 
 		 806 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  26.72 
 
 		 815 aa  108  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  37 
 
 		 807 aa  108  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4987  ATP-dependent protease La  38.02 
 
 		 824 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00166311  normal  0.674678 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  38.54 
 
 		 808 aa  108  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  27.91 
 
 		 823 aa  108  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  36.6 
 
 		 835 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  36.6 
 
 		 835 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  37.88 
 
 		 807 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  37.57 
 
 		 810 aa  107  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  28.97 
 
 		 811 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  27.89 
 
 		 776 aa  107  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  32.07 
 
 		 812 aa  107  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  27.72 
 
 		 776 aa  107  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  27.72 
 
 		 776 aa  106  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  27.89 
 
 		 776 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1725  ATP-dependent protease La  38.78 
 
 		 814 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000125978  decreased coverage  0.00323118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 		 804 aa  106  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 843 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  35.56 
 
 		 802 aa  106  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  28.31 
 
 		 807 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  38.1 
 
 		 806 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  38.38 
 
 		 821 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  27.69 
 
 		 776 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3467  ATP-dependent protease La  30.75 
 
 		 798 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.895403  hitchhiker  0.000510926 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2518  Lon-A peptidase  35.5 
 
 		 799 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571942  normal  0.381839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  38.58 
 
 		 811 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1904  ATP-dependent protease La  30.75 
 
 		 798 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798335  hitchhiker  0.000618765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>