More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0880 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  61.16 
 
 
631 aa  741    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  62.11 
 
 
731 aa  777    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  66.83 
 
 
638 aa  844    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  81.35 
 
 
698 aa  1054    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  67.22 
 
 
662 aa  823    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  67.59 
 
 
645 aa  847    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  64.51 
 
 
680 aa  809    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  63.27 
 
 
693 aa  765    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  62.81 
 
 
765 aa  785    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  100 
 
 
637 aa  1296    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  60.36 
 
 
778 aa  752    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  67.82 
 
 
632 aa  852    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  62.01 
 
 
711 aa  790    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  70.87 
 
 
635 aa  903    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0502  peptidase S16, Lon-like protease  33.91 
 
 
685 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.85369  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0433  peptidase S16, Lon-like protease  33.42 
 
 
692 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.317598  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1487  peptidase S16, Lon-like protease  33.25 
 
 
693 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1350  peptidase S16, Lon-like protease  31.17 
 
 
703 aa  217  7e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.966121  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0404  Lon-B peptidase  32.33 
 
 
692 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.175581  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1394  AAA ATPase central domain protein  46.38 
 
 
496 aa  201  3e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  31.16 
 
 
571 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  30 
 
 
575 aa  154  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  30.87 
 
 
579 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  31.04 
 
 
648 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  29.18 
 
 
558 aa  144  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  29.23 
 
 
566 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  30.94 
 
 
652 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  30.66 
 
 
558 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.43 
 
 
563 aa  137  7.000000000000001e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  27.29 
 
 
639 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0928  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.61 
 
 
794 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182033  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  28.38 
 
 
537 aa  131  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0950  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.4 
 
 
794 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  29.45 
 
 
570 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  31.22 
 
 
558 aa  128  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  28.6 
 
 
560 aa  127  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  27.35 
 
 
650 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  29.22 
 
 
570 aa  126  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  28.08 
 
 
810 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  27.31 
 
 
670 aa  125  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  26.16 
 
 
819 aa  124  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  26.16 
 
 
819 aa  124  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0319  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.98 
 
 
783 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  30.55 
 
 
655 aa  120  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  31.49 
 
 
556 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  30.07 
 
 
556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.79 
 
 
788 aa  115  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  30.43 
 
 
557 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  28.3 
 
 
821 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  39.9 
 
 
810 aa  114  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  28.6 
 
 
798 aa  113  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  39.7 
 
 
806 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  27.46 
 
 
572 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  34.77 
 
 
816 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  39.39 
 
 
810 aa  111  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  25 
 
 
787 aa  112  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  33.09 
 
 
816 aa  111  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  29.6 
 
 
557 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  26.65 
 
 
803 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.19 
 
 
807 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  27.61 
 
 
814 aa  111  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  27.06 
 
 
786 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  35.98 
 
 
805 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 
797 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  35.98 
 
 
774 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1297  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.9 
 
 
786 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000625582  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  27.97 
 
 
831 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000165888  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  39.2 
 
 
804 aa  110  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  29.25 
 
 
812 aa  110  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1908  ATP-dependent protease La  40.69 
 
 
807 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261934  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  39.2 
 
 
804 aa  110  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1955  ATP-dependent protease La  40.2 
 
 
805 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  29.37 
 
 
557 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  29.37 
 
 
557 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  29.37 
 
 
557 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1463  ATP-dependent protease La  40.2 
 
 
805 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.39 
 
 
805 aa  109  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2479  ATP-dependent protease La  40.2 
 
 
805 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.71727  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  29.37 
 
 
556 aa  109  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2321  ATP-dependent protease La  40.2 
 
 
805 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00784653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  29.37 
 
 
557 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2122  ATP-dependent protease La  40.2 
 
 
806 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  35.98 
 
 
806 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  36.65 
 
 
810 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  27 
 
 
810 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  29.6 
 
 
556 aa  109  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1230  ATP-dependent protease La  40.2 
 
 
805 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  35.45 
 
 
804 aa  109  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  27.03 
 
 
619 aa  109  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  27.03 
 
 
619 aa  109  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3350  ATP-dependent protease La  40.2 
 
 
805 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464678  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  35.02 
 
 
812 aa  109  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  26.09 
 
 
823 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2363  ATP-dependent protease La  40.2 
 
 
805 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  29.37 
 
 
557 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  26.65 
 
 
825 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  29.15 
 
 
557 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  29.37 
 
 
556 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2518  Lon-A peptidase  30.97 
 
 
799 aa  108  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571942  normal  0.381839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2293  Lon-A peptidase  39.71 
 
 
807 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.441771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>