More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0404 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1350  peptidase S16, Lon-like protease  64.41 
 
 		 703 aa  899    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.966121  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0404  Lon-B peptidase  100 
 
 		 692 aa  1394    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.175581  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0433  peptidase S16, Lon-like protease  93.64 
 
 		 692 aa  1289    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.317598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0502  peptidase S16, Lon-like protease  84.7 
 
 		 685 aa  1177    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.85369  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1487  peptidase S16, Lon-like protease  95.67 
 
 		 693 aa  1295    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  32.52 
 
 		 632 aa  298  2e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  29.63 
 
 		 631 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  28.78 
 
 		 680 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  28.78 
 
 		 693 aa  243  9e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  35.18 
 
 		 635 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  32.33 
 
 		 637 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1394  AAA ATPase central domain protein  33.04 
 
 		 496 aa  211  3e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  33.58 
 
 		 731 aa  209  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  32.39 
 
 		 698 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  31.38 
 
 		 638 aa  205  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  32.09 
 
 		 765 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  31.76 
 
 		 778 aa  198  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  33.07 
 
 		 645 aa  198  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  32.57 
 
 		 711 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  30.66 
 
 		 662 aa  187  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0220  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.97 
 
 		 790 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.229141  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  25.37 
 
 		 806 aa  101  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  23.67 
 
 		 798 aa  94  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  25.7 
 
 		 787 aa  92.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  24.28 
 
 		 810 aa  90.5  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  21.44 
 
 		 803 aa  88.2  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  31.41 
 
 		 650 aa  87.4  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  30.61 
 
 		 648 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3407  peptidase S16 lon domain protein  22.8 
 
 		 806 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025789  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  29.13 
 
 		 804 aa  82.4  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  32.99 
 
 		 808 aa  82  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  29.27 
 
 		 799 aa  81.3  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  32.34 
 
 		 815 aa  80.5  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  30.56 
 
 		 807 aa  80.5  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  29.06 
 
 		 619 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  29.06 
 
 		 619 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0925  ATP-dependent protease  29.3 
 
 		 786 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.819231  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23590  Peptidase S16, ATP-dependent protease  30.46 
 
 		 797 aa  79.7  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.05 
 
 		 807 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  37.19 
 
 		 791 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  43.93 
 
 		 805 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  23.74 
 
 		 813 aa  79  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  29.31 
 
 		 808 aa  79  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  23.33 
 
 		 832 aa  79  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  30.27 
 
 		 652 aa  79  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  19.73 
 
 		 813 aa  78.6  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  27.32 
 
 		 670 aa  79  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  43.93 
 
 		 805 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.81 
 
 		 805 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2302  ATP-dependent protease La  28.99 
 
 		 798 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235792  hitchhiker  0.000494744 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1904  ATP-dependent protease La  28.99 
 
 		 798 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798335  hitchhiker  0.000618765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1749  peptidase S16, ATP-dependent protease La  29.84 
 
 		 798 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0163826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3467  ATP-dependent protease La  28.99 
 
 		 798 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.895403  hitchhiker  0.000510926 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.22 
 
 		 793 aa  77.8  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1744  ATP-dependent protease La  28.65 
 
 		 798 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484284  hitchhiker  0.00114156 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2264  putative ATP-dependent protease  51.22 
 
 		 827 aa  77.8  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.412132 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1607  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.55 
 
 		 815 aa  77.8  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  29.49 
 
 		 810 aa  77.8  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1838  ATP-dependent protease La  27.45 
 
 		 805 aa  77.4  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203387  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  27.11 
 
 		 805 aa  77  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0312  peptidase S16 lon domain protein  26.59 
 
 		 873 aa  77  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345035 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  28.21 
 
 		 783 aa  77  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  36.61 
 
 		 805 aa  76.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2007  ATP-dependent protease, putative  31.18 
 
 		 829 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.303021  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  29.17 
 
 		 823 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  26.29 
 
 		 806 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  27.75 
 
 		 802 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.36 
 
 		 793 aa  77  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  27.44 
 
 		 816 aa  77  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3724  ATP-dependent protease La  29.32 
 
 		 798 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.639562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.4 
 
 		 810 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  34.82 
 
 		 815 aa  76.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  27.7 
 
 		 803 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  30.51 
 
 		 660 aa  76.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  28.57 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  34.92 
 
 		 785 aa  76.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  28.71 
 
 		 806 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  28.71 
 
 		 806 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2052  ATP-dependent protease La  30.5 
 
 		 798 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155836  normal  0.0687597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  29.21 
 
 		 808 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  28.11 
 
 		 810 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2518  Lon-A peptidase  30.58 
 
 		 799 aa  75.5  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571942  normal  0.381839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  36.61 
 
 		 811 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  28.22 
 
 		 807 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  30.51 
 
 		 831 aa  75.5  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000165888  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1725  ATP-dependent protease La  31.74 
 
 		 814 aa  75.1  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000125978  decreased coverage  0.00323118 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  28.19 
 
 		 802 aa  75.1  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0350  peptidase S16 lon domain-containing protein  20.63 
 
 		 722 aa  74.7  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3494  Lon protease  28.95 
 
 		 798 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935461  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  35.83 
 
 		 861 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  30.57 
 
 		 809 aa  74.7  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  26.92 
 
 		 783 aa  75.1  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  29.58 
 
 		 805 aa  74.7  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.37 
 
 		 786 aa  74.7  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1543  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.86 
 
 		 865 aa  74.7  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  28.11 
 
 		 821 aa  74.7  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  28.95 
 
 		 798 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3695  Lon-A peptidase  28.27 
 
 		 798 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.36 
 
 		 843 aa  74.3  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  28.97 
 
 		 812 aa  74.3  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>