More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4350 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  56.01 
 
 		 639 aa  713    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  61.03 
 
 		 652 aa  777    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  62.11 
 
 		 655 aa  784    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  69.73 
 
 		 648 aa  948    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  55.81 
 
 		 619 aa  667    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  55.81 
 
 		 619 aa  667    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  59 
 
 		 670 aa  764    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 		 650 aa  1314    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  45.36 
 
 		 570 aa  422  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  45.36 
 
 		 558 aa  419  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  44.95 
 
 		 558 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  44.96 
 
 		 570 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  45.33 
 
 		 575 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  42.08 
 
 		 571 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  44.93 
 
 		 579 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  44.95 
 
 		 572 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  44.71 
 
 		 560 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  42.66 
 
 		 566 aa  396  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  44.82 
 
 		 558 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  44.97 
 
 		 557 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  44.77 
 
 		 557 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  44.97 
 
 		 557 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  44.97 
 
 		 557 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  44.97 
 
 		 557 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  44.97 
 
 		 557 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.66 
 
 		 563 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  44.97 
 
 		 557 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  44.58 
 
 		 556 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  45.17 
 
 		 556 aa  392  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0492  Sigma 54 interacting domain protein  45.08 
 
 		 557 aa  391  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.335445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  43.79 
 
 		 557 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  44.77 
 
 		 556 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  43.92 
 
 		 556 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  44.77 
 
 		 556 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  41.63 
 
 		 537 aa  382  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  31.07 
 
 		 635 aa  147  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  30.3 
 
 		 638 aa  134  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  29.11 
 
 		 631 aa  134  6.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  29.06 
 
 		 680 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  29.32 
 
 		 645 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  30.34 
 
 		 698 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  29.77 
 
 		 662 aa  127  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  27.35 
 
 		 637 aa  126  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  28.43 
 
 		 807 aa  124  4e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0516  ATP-dependent protease La  25 
 
 		 779 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  27.59 
 
 		 802 aa  122  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  28.16 
 
 		 802 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  28.16 
 
 		 802 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  27.89 
 
 		 806 aa  120  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  27.89 
 
 		 806 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  27.25 
 
 		 802 aa  120  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  27.09 
 
 		 808 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2542  ATP-dependent protease La  26.68 
 
 		 805 aa  118  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  26.67 
 
 		 809 aa  118  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  27.93 
 
 		 812 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  28.34 
 
 		 632 aa  118  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.25 
 
 		 787 aa  118  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  26.23 
 
 		 802 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02475  ATP-dependent protease La  35.11 
 
 		 823 aa  118  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  35.16 
 
 		 805 aa  117  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1979  ATP-dependent protease La  28.83 
 
 		 859 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205373 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  28.66 
 
 		 826 aa  116  1.0000000000000001e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl404  class III heat shock DNA-binding ATP dependent Lon protease  26.68 
 
 		 787 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  34.05 
 
 		 816 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.69 
 
 		 784 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  36.67 
 
 		 799 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  26.9 
 
 		 804 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  25.21 
 
 		 778 aa  115  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  26.56 
 
 		 816 aa  115  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  26.85 
 
 		 803 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  25.9 
 
 		 756 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  36.41 
 
 		 806 aa  114  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  25.9 
 
 		 787 aa  114  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3724  ATP-dependent protease La  26.52 
 
 		 798 aa  114  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.639562  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  27.29 
 
 		 805 aa  114  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.16 
 
 		 786 aa  114  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.67 
 
 		 793 aa  114  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.4 
 
 		 784 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.14 
 
 		 793 aa  114  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  28.28 
 
 		 804 aa  114  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  28.28 
 
 		 804 aa  114  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  26.79 
 
 		 806 aa  114  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1749  peptidase S16, ATP-dependent protease La  26.52 
 
 		 798 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0163826 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  25.86 
 
 		 837 aa  113  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  26.34 
 
 		 812 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.35 
 
 		 784 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  27.87 
 
 		 805 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  26.76 
 
 		 867 aa  113  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  25.05 
 
 		 823 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1883  Lon-A peptidase  27.42 
 
 		 803 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.35 
 
 		 784 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.35 
 
 		 784 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.35 
 
 		 784 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2513  ATP-dependent protease La  26.97 
 
 		 813 aa  113  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1294  endopeptidase La  28.34 
 
 		 805 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346664 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1659  Lon-A peptidase  28.36 
 
 		 875 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.241054  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  26.73 
 
 		 812 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  27.66 
 
 		 693 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1013  ATP-dependent protease La  27.08 
 
 		 805 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952108  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  36.41 
 
 		 816 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>