More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0516 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  47.35 
 
 		 776 aa  691    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  42.95 
 
 		 817 aa  635    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  44.44 
 
 		 785 aa  644    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.15 
 
 		 786 aa  644    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  44.32 
 
 		 785 aa  644    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  47.02 
 
 		 773 aa  689    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  44.44 
 
 		 785 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  45.41 
 
 		 840 aa  639    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  47.35 
 
 		 776 aa  692    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  47.35 
 
 		 776 aa  690    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl404  class III heat shock DNA-binding ATP dependent Lon protease  62.02 
 
 		 787 aa  929    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  47.28 
 
 		 776 aa  692    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.09 
 
 		 793 aa  639    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  48.06 
 
 		 775 aa  695    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  46.96 
 
 		 773 aa  685    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  44.7 
 
 		 784 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  45.13 
 
 		 785 aa  637    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  44.57 
 
 		 785 aa  643    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  44.73 
 
 		 785 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.02 
 
 		 787 aa  646    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  47.28 
 
 		 776 aa  692    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  44.32 
 
 		 781 aa  647    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  44.47 
 
 		 783 aa  640    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  47.35 
 
 		 773 aa  691    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  44.46 
 
 		 786 aa  641    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0516  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 779 aa  1568    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  48.12 
 
 		 774 aa  693    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.37 
 
 		 793 aa  640    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  47.35 
 
 		 776 aa  691    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0355  ATP-dependent protease La  46.28 
 
 		 791 aa  655    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  41.92 
 
 		 810 aa  635    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  42.95 
 
 		 816 aa  636    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  44.32 
 
 		 785 aa  644    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  44.11 
 
 		 783 aa  637    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  44.19 
 
 		 785 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  44.95 
 
 		 802 aa  645    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  47.22 
 
 		 776 aa  691    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  47.21 
 
 		 773 aa  681    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  45.42 
 
 		 815 aa  640    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  45.11 
 
 		 802 aa  637    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  44.32 
 
 		 785 aa  641    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  44.19 
 
 		 785 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  44.65 
 
 		 778 aa  639    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  44.96 
 
 		 783 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  43.69 
 
 		 812 aa  642    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  44.44 
 
 		 785 aa  645    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  44.19 
 
 		 785 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  44.59 
 
 		 811 aa  669    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  44.21 
 
 		 805 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  43.38 
 
 		 801 aa  632  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  42.77 
 
 		 768 aa  632  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.03 
 
 		 784 aa  632  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3494  Lon protease  43.32 
 
 		 798 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935461  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  43.15 
 
 		 798 aa  635  1e-180  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  43.69 
 
 		 783 aa  635  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  43.24 
 
 		 803 aa  633  1e-180  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.89 
 
 		 784 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  43.89 
 
 		 784 aa  629  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.89 
 
 		 784 aa  629  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.9 
 
 		 784 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.89 
 
 		 784 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.9 
 
 		 784 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  43.89 
 
 		 784 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  44.02 
 
 		 802 aa  631  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.9 
 
 		 784 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  44.2 
 
 		 792 aa  631  1e-179  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.13 
 
 		 784 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.89 
 
 		 784 aa  629  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  44.43 
 
 		 802 aa  632  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  42.51 
 
 		 804 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.13 
 
 		 784 aa  630  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.13 
 
 		 784 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.9 
 
 		 784 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.9 
 
 		 784 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  43.19 
 
 		 798 aa  632  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  42.64 
 
 		 797 aa  632  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.89 
 
 		 784 aa  629  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.89 
 
 		 799 aa  628  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  43.02 
 
 		 806 aa  628  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  41.63 
 
 		 823 aa  626  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  44.23 
 
 		 802 aa  628  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  43.42 
 
 		 867 aa  627  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.89 
 
 		 784 aa  628  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.38 
 
 		 784 aa  628  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0821  ATP-dependent protease LA  42.67 
 
 		 787 aa  627  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0118017  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  43.84 
 
 		 804 aa  627  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  44.13 
 
 		 837 aa  627  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  42.62 
 
 		 797 aa  626  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  44.33 
 
 		 812 aa  622  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  43.82 
 
 		 805 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  43.52 
 
 		 805 aa  624  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  43.82 
 
 		 805 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  43.15 
 
 		 805 aa  622  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  41.42 
 
 		 820 aa  623  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  44.46 
 
 		 812 aa  624  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  43.15 
 
 		 788 aa  624  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3783  ATP-dependent protease La  43.17 
 
 		 782 aa  622  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417007  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  42.13 
 
 		 802 aa  621  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  43.41 
 
 		 785 aa  621  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  42.51 
 
 		 823 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>