More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0355 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0516  ATP-dependent protease La  45.93 
 
 
779 aa  654    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0355  ATP-dependent protease La  100 
 
 
791 aa  1597    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  44.22 
 
 
774 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  43.66 
 
 
775 aa  621  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl404  class III heat shock DNA-binding ATP dependent Lon protease  44.07 
 
 
787 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  44.12 
 
 
773 aa  598  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  44.32 
 
 
776 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.18 
 
 
776 aa  599  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.25 
 
 
776 aa  600  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  44.32 
 
 
773 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  44.25 
 
 
776 aa  601  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  44.25 
 
 
776 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  44.11 
 
 
776 aa  600  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  44.12 
 
 
776 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  44.12 
 
 
773 aa  598  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  44.08 
 
 
773 aa  596  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  41.68 
 
 
785 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  41.97 
 
 
785 aa  589  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  41.8 
 
 
785 aa  590  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  42.1 
 
 
785 aa  589  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  42.32 
 
 
786 aa  585  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  41.68 
 
 
785 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  41.93 
 
 
784 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  42.1 
 
 
785 aa  588  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  41.68 
 
 
785 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  41.93 
 
 
785 aa  588  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.18 
 
 
793 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  41.09 
 
 
781 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.35 
 
 
793 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  41.55 
 
 
785 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  41.58 
 
 
768 aa  585  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  41.19 
 
 
785 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  41.95 
 
 
783 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  42.23 
 
 
783 aa  580  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.23 
 
 
787 aa  581  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.35 
 
 
784 aa  581  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.35 
 
 
784 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.35 
 
 
784 aa  581  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  41.21 
 
 
785 aa  580  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  41.56 
 
 
788 aa  580  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  41.31 
 
 
785 aa  578  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.23 
 
 
786 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  41.99 
 
 
783 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.98 
 
 
784 aa  576  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  41.33 
 
 
783 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  40.08 
 
 
811 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  40.48 
 
 
797 aa  572  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  40.38 
 
 
812 aa  572  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  39.11 
 
 
880 aa  568  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.83 
 
 
784 aa  565  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  39.98 
 
 
813 aa  567  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  40.4 
 
 
810 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  41.29 
 
 
837 aa  567  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  41.64 
 
 
783 aa  567  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.83 
 
 
784 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  40.83 
 
 
784 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  40.05 
 
 
804 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.83 
 
 
784 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.83 
 
 
784 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.83 
 
 
784 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  40.83 
 
 
784 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.71 
 
 
799 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.71 
 
 
784 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.71 
 
 
784 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.83 
 
 
784 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.71 
 
 
784 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.71 
 
 
784 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  41.08 
 
 
803 aa  564  1.0000000000000001e-159  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.71 
 
 
784 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  40.61 
 
 
797 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0263  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.11 
 
 
784 aa  560  1e-158  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.88 
 
 
784 aa  561  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  41.34 
 
 
819 aa  555  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  40.35 
 
 
823 aa  558  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3494  Lon protease  41.06 
 
 
798 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935461  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  40.62 
 
 
800 aa  558  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  40.58 
 
 
816 aa  557  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02475  ATP-dependent protease La  40.52 
 
 
823 aa  556  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  41.18 
 
 
798 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0821  ATP-dependent protease LA  40.46 
 
 
787 aa  556  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0118017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  40.29 
 
 
835 aa  553  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  41.24 
 
 
808 aa  553  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  39.29 
 
 
801 aa  555  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0531  endopeptidase La  39.25 
 
 
823 aa  552  1e-156  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  40.73 
 
 
806 aa  552  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  41.6 
 
 
812 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  41.11 
 
 
778 aa  555  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  40.87 
 
 
836 aa  553  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  40.51 
 
 
810 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  40.46 
 
 
807 aa  554  1e-156  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  40.66 
 
 
792 aa  553  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  40 
 
 
812 aa  554  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4987  ATP-dependent protease La  40.73 
 
 
824 aa  553  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00166311  normal  0.674678 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  40.75 
 
 
821 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0469  ATP-dependent protease La  39.35 
 
 
823 aa  554  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  39.7 
 
 
809 aa  551  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  40.89 
 
 
810 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  39.07 
 
 
856 aa  551  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  39.4 
 
 
815 aa  550  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3640  Lon-A peptidase  40.28 
 
 
812 aa  552  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0005782  normal  0.311751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>