More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl404 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  43.68 
 
 
807 aa  646    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  42.95 
 
 
806 aa  637    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  46.28 
 
 
773 aa  702    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  46.39 
 
 
776 aa  702    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  46.78 
 
 
776 aa  701    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl404  class III heat shock DNA-binding ATP dependent Lon protease  100 
 
 
787 aa  1585    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  46.91 
 
 
776 aa  702    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  46.78 
 
 
773 aa  700    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  45.85 
 
 
775 aa  692    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  42.89 
 
 
786 aa  637    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  46.13 
 
 
773 aa  689    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  42.88 
 
 
811 aa  650    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  46.52 
 
 
773 aa  702    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0516  ATP-dependent protease La  62.53 
 
 
779 aa  943    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  47.04 
 
 
776 aa  703    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  46.78 
 
 
776 aa  699    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  43.38 
 
 
792 aa  638    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  44.7 
 
 
779 aa  638    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  42.44 
 
 
806 aa  635    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  44.61 
 
 
815 aa  645    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  47.04 
 
 
776 aa  705    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  43.11 
 
 
806 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  46.78 
 
 
776 aa  701    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  42.98 
 
 
797 aa  646    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  43.26 
 
 
812 aa  641    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  45.52 
 
 
774 aa  687    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3783  ATP-dependent protease La  42.33 
 
 
782 aa  634  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  42.98 
 
 
806 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  41.63 
 
 
797 aa  633  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  42.03 
 
 
810 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.23 
 
 
787 aa  630  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  42.77 
 
 
785 aa  629  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  42.11 
 
 
768 aa  629  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  41.89 
 
 
837 aa  629  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  41.44 
 
 
815 aa  630  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  41.77 
 
 
804 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  43.73 
 
 
778 aa  631  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  43.17 
 
 
803 aa  629  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.59 
 
 
784 aa  628  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  42.59 
 
 
784 aa  628  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.33 
 
 
784 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0821  ATP-dependent protease LA  42.31 
 
 
787 aa  627  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0118017  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.59 
 
 
784 aa  628  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  43.28 
 
 
802 aa  627  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.15 
 
 
784 aa  626  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.33 
 
 
784 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.59 
 
 
784 aa  627  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  42.8 
 
 
784 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  43 
 
 
785 aa  627  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.46 
 
 
799 aa  627  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.59 
 
 
784 aa  628  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.59 
 
 
784 aa  628  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.1 
 
 
786 aa  628  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  42.59 
 
 
784 aa  628  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  43 
 
 
785 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.1 
 
 
793 aa  628  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.33 
 
 
784 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.33 
 
 
784 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  43 
 
 
785 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.33 
 
 
784 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.15 
 
 
793 aa  628  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  42.62 
 
 
783 aa  627  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.59 
 
 
784 aa  628  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.15 
 
 
784 aa  626  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  42.75 
 
 
867 aa  627  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  43 
 
 
785 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.26 
 
 
784 aa  624  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  43.44 
 
 
810 aa  625  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.03 
 
 
784 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  42.66 
 
 
821 aa  623  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  42.37 
 
 
783 aa  624  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  42.75 
 
 
785 aa  624  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  42.08 
 
 
818 aa  623  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  43.02 
 
 
781 aa  624  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  42.88 
 
 
775 aa  620  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  42.35 
 
 
809 aa  620  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  42.49 
 
 
812 aa  621  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.5 
 
 
784 aa  619  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  41.87 
 
 
805 aa  621  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  42.25 
 
 
805 aa  620  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  41.43 
 
 
810 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  42.34 
 
 
813 aa  620  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  42.44 
 
 
785 aa  619  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  42.52 
 
 
785 aa  619  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  40.15 
 
 
815 aa  617  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  41.96 
 
 
785 aa  617  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2052  ATP-dependent protease La  42.31 
 
 
798 aa  617  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155836  normal  0.0687597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  41.74 
 
 
805 aa  618  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  41.57 
 
 
808 aa  617  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  42.49 
 
 
812 aa  618  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  41.52 
 
 
801 aa  617  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  42.58 
 
 
840 aa  616  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  42.42 
 
 
783 aa  616  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1899  ATP-dependent protease La  41.1 
 
 
874 aa  617  1e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67239  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  40.99 
 
 
798 aa  617  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  41.91 
 
 
785 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  41.91 
 
 
785 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  42.4 
 
 
802 aa  618  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  41.93 
 
 
798 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  41.91 
 
 
785 aa  615  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>