More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2742 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  60.33 
 
 		 557 aa  648    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  63.89 
 
 		 556 aa  676    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  60.15 
 
 		 557 aa  647    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  64.35 
 
 		 557 aa  667    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  60.15 
 
 		 557 aa  647    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  60.15 
 
 		 557 aa  647    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  60.15 
 
 		 557 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  59.96 
 
 		 556 aa  644    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  62.41 
 
 		 558 aa  714    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  100 
 
 		 558 aa  1130    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  65.42 
 
 		 571 aa  743    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  59.96 
 
 		 556 aa  646    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  64.53 
 
 		 558 aa  704    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  60.15 
 
 		 557 aa  647    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  64.04 
 
 		 572 aa  683    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  73.71 
 
 		 560 aa  853    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0492  Sigma 54 interacting domain protein  62.97 
 
 		 557 aa  685    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.335445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  61.05 
 
 		 579 aa  689    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  60.23 
 
 		 570 aa  649    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  60.23 
 
 		 570 aa  648    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  60.15 
 
 		 557 aa  645    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  59.96 
 
 		 556 aa  645    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  58.79 
 
 		 566 aa  658    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  60.33 
 
 		 556 aa  649    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  63.45 
 
 		 537 aa  709    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  60.87 
 
 		 563 aa  671    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  63.09 
 
 		 575 aa  704    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  46.85 
 
 		 648 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  44.49 
 
 		 650 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  43.1 
 
 		 639 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  45 
 
 		 652 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  46.88 
 
 		 619 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  46.88 
 
 		 619 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  41.73 
 
 		 670 aa  388  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  44.49 
 
 		 655 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  31.05 
 
 		 645 aa  158  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  32.57 
 
 		 680 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  30.56 
 
 		 638 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  31.35 
 
 		 698 aa  146  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  29.56 
 
 		 631 aa  143  8e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  30.43 
 
 		 637 aa  139  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  29.83 
 
 		 635 aa  137  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  28.74 
 
 		 632 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  30.3 
 
 		 662 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  28.76 
 
 		 711 aa  134  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  30.72 
 
 		 693 aa  133  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  29.72 
 
 		 778 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  29.95 
 
 		 731 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  29.57 
 
 		 765 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  28.83 
 
 		 816 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  27.37 
 
 		 823 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  27.49 
 
 		 823 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  26.88 
 
 		 812 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  31.44 
 
 		 815 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0549  ATP-dependent protease La  27.03 
 
 		 792 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.56565  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  26.87 
 
 		 778 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  28.52 
 
 		 774 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1060  ATP-dependent protease La  29.08 
 
 		 798 aa  110  7.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  27.84 
 
 		 798 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  35.29 
 
 		 819 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  26.86 
 
 		 806 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  26.37 
 
 		 806 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  27.91 
 
 		 805 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  26.97 
 
 		 813 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  35.68 
 
 		 812 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  26.07 
 
 		 812 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  39.8 
 
 		 810 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  35.68 
 
 		 812 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  26.86 
 
 		 806 aa  109  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  28.49 
 
 		 805 aa  108  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0516  ATP-dependent protease La  29.02 
 
 		 779 aa  108  3e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  35.24 
 
 		 805 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  27.55 
 
 		 806 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2563  ATP-dependent protease La  26.86 
 
 		 807 aa  108  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  27.88 
 
 		 793 aa  108  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  26.08 
 
 		 808 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  25.55 
 
 		 768 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0470  hypothetical protein  26.36 
 
 		 827 aa  107  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  26.28 
 
 		 807 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  26.75 
 
 		 817 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  27.41 
 
 		 786 aa  107  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  27.1 
 
 		 804 aa  107  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  26.71 
 
 		 817 aa  107  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  34.83 
 
 		 783 aa  107  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  26.71 
 
 		 791 aa  107  8e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  26.71 
 
 		 791 aa  107  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  36.41 
 
 		 810 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  26.56 
 
 		 816 aa  106  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0376  ATP-dependent protease La  27.51 
 
 		 776 aa  106  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  26.98 
 
 		 811 aa  106  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  28.88 
 
 		 813 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  27.33 
 
 		 806 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl404  class III heat shock DNA-binding ATP dependent Lon protease  27.17 
 
 		 787 aa  105  2e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  27.66 
 
 		 788 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  28.44 
 
 		 803 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0407  ATP-dependent protease La  29.03 
 
 		 810 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  27.61 
 
 		 837 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  41.36 
 
 		 783 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  33.98 
 
 		 807 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  26.93 
 
 		 773 aa  105  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>