More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_23310 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  100 
 
 
639 aa  1280    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  56.01 
 
 
648 aa  728    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  55.07 
 
 
655 aa  683    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  55.74 
 
 
650 aa  715    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  54.68 
 
 
670 aa  703    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  52.52 
 
 
652 aa  674    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  53.75 
 
 
619 aa  619  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  53.75 
 
 
619 aa  619  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  46.14 
 
 
570 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  45.74 
 
 
570 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  45.1 
 
 
558 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  44.27 
 
 
558 aa  412  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  44.66 
 
 
575 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  43.1 
 
 
558 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  42.83 
 
 
566 aa  412  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  43.03 
 
 
571 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  43.92 
 
 
579 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  44.03 
 
 
572 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0492  Sigma 54 interacting domain protein  44.66 
 
 
557 aa  391  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.335445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.69 
 
 
563 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  44.14 
 
 
557 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  43.94 
 
 
556 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  42.06 
 
 
560 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  41.9 
 
 
537 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  43.19 
 
 
556 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  41.62 
 
 
557 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  43.4 
 
 
557 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  43.4 
 
 
557 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  43.4 
 
 
557 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  43.4 
 
 
557 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  41.42 
 
 
556 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  43.4 
 
 
557 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  41.62 
 
 
557 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  43.19 
 
 
556 aa  369  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  43.19 
 
 
556 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  30.8 
 
 
631 aa  148  3e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  30.9 
 
 
662 aa  147  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  29.31 
 
 
645 aa  144  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  29.21 
 
 
638 aa  145  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  29.67 
 
 
680 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  29.16 
 
 
635 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.79 
 
 
787 aa  135  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  27.29 
 
 
637 aa  135  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0407  ATP-dependent protease La  26.69 
 
 
810 aa  134  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  27.23 
 
 
632 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.17 
 
 
786 aa  134  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  28.88 
 
 
698 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  27.51 
 
 
778 aa  127  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  27.68 
 
 
731 aa  127  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  25.86 
 
 
816 aa  127  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.17 
 
 
793 aa  126  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.66 
 
 
784 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  27.27 
 
 
693 aa  125  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.26 
 
 
793 aa  125  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.12 
 
 
784 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  26.76 
 
 
783 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.26 
 
 
799 aa  124  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.28 
 
 
784 aa  124  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  26.28 
 
 
784 aa  124  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  26.28 
 
 
784 aa  124  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.28 
 
 
784 aa  124  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.28 
 
 
784 aa  124  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1899  ATP-dependent protease La  26.16 
 
 
874 aa  124  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67239  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.28 
 
 
784 aa  124  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.28 
 
 
784 aa  124  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.28 
 
 
784 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.28 
 
 
784 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.28 
 
 
784 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.28 
 
 
784 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.26 
 
 
784 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  28.24 
 
 
765 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1659  Lon-A peptidase  26.01 
 
 
875 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.241054  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.28 
 
 
784 aa  123  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  27.18 
 
 
813 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  25.63 
 
 
797 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2310  ATP-dependent protease La  26.71 
 
 
769 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  25.04 
 
 
785 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  35.79 
 
 
802 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  25.04 
 
 
785 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  23.64 
 
 
785 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  27.27 
 
 
711 aa  121  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1904  ATP-dependent protease La  24.8 
 
 
798 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798335  hitchhiker  0.000618765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  23.8 
 
 
785 aa  120  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  23.64 
 
 
785 aa  120  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2302  ATP-dependent protease La  24.8 
 
 
798 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235792  hitchhiker  0.000494744 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1749  peptidase S16, ATP-dependent protease La  25.16 
 
 
798 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0163826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1744  ATP-dependent protease La  24.8 
 
 
798 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484284  hitchhiker  0.00114156 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.63 
 
 
784 aa  120  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.63 
 
 
784 aa  120  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  23.49 
 
 
785 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.63 
 
 
784 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3467  ATP-dependent protease La  24.8 
 
 
798 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.895403  hitchhiker  0.000510926 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1610  Lon-A peptidase  26.25 
 
 
805 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000614629  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3724  ATP-dependent protease La  25.38 
 
 
798 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.639562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  24.89 
 
 
784 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  24.89 
 
 
785 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0516  ATP-dependent protease La  27.72 
 
 
779 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  25.4 
 
 
811 aa  118  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2052  ATP-dependent protease La  25.47 
 
 
798 aa  117  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155836  normal  0.0687597 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  25.44 
 
 
786 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>