More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2391 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  61.08 
 
 
731 aa  754    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  63.62 
 
 
765 aa  772    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  60.59 
 
 
778 aa  736    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  61.06 
 
 
631 aa  730    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  67 
 
 
698 aa  837    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  80.17 
 
 
638 aa  1012    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  63.79 
 
 
693 aa  753    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  61.94 
 
 
711 aa  771    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  78.78 
 
 
680 aa  970    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  79.54 
 
 
645 aa  993    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  67.22 
 
 
637 aa  838    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  100 
 
 
662 aa  1347    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  74.07 
 
 
632 aa  927    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  69.06 
 
 
635 aa  844    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0502  peptidase S16, Lon-like protease  30.06 
 
 
685 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.85369  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1394  AAA ATPase central domain protein  47.21 
 
 
496 aa  204  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1487  peptidase S16, Lon-like protease  32.64 
 
 
693 aa  197  6e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0433  peptidase S16, Lon-like protease  33.07 
 
 
692 aa  197  6e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.317598  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0404  Lon-B peptidase  30.06 
 
 
692 aa  195  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.175581  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1350  peptidase S16, Lon-like protease  31.62 
 
 
703 aa  194  4e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.966121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  30.56 
 
 
648 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  29.39 
 
 
571 aa  150  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  30.9 
 
 
639 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  29.44 
 
 
575 aa  142  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  29.88 
 
 
652 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.47 
 
 
807 aa  140  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  28.06 
 
 
670 aa  137  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0950  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.7 
 
 
794 aa  137  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0928  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.7 
 
 
794 aa  137  8e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  30.3 
 
 
558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  26.73 
 
 
819 aa  135  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  29.86 
 
 
579 aa  134  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  29.37 
 
 
558 aa  133  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.15 
 
 
802 aa  133  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  29.44 
 
 
818 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  26.5 
 
 
819 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  27.2 
 
 
810 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  27.37 
 
 
831 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000165888  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  28.18 
 
 
798 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  33.44 
 
 
810 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2793  ATP-dependent protease, putative  28.88 
 
 
814 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281078  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  29.22 
 
 
566 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  25.04 
 
 
660 aa  127  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1543  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.61 
 
 
865 aa  127  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  29.77 
 
 
650 aa  127  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
819 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  26.46 
 
 
786 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  40.5 
 
 
812 aa  126  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  40 
 
 
812 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  27.17 
 
 
786 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0220  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.69 
 
 
790 aa  124  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.229141  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  26.1 
 
 
787 aa  124  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  28.47 
 
 
803 aa  124  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  25.74 
 
 
810 aa  123  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.66 
 
 
805 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  26.91 
 
 
821 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.62 
 
 
810 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2746  peptidase S16, lon-like  26.71 
 
 
811 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000135674  normal  0.815417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  26.11 
 
 
791 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  29.61 
 
 
560 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  25.37 
 
 
777 aa  121  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  28.64 
 
 
537 aa  121  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.11 
 
 
563 aa  120  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.55 
 
 
805 aa  120  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  28.86 
 
 
558 aa  120  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  25.77 
 
 
806 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  25.55 
 
 
805 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  25.55 
 
 
805 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4987  ATP-dependent protease La  42.56 
 
 
824 aa  120  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00166311  normal  0.674678 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  30.94 
 
 
655 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.61 
 
 
816 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  24.73 
 
 
823 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  40.93 
 
 
811 aa  118  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  29.41 
 
 
803 aa  118  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  42.25 
 
 
816 aa  117  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  28.21 
 
 
572 aa  117  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2449  peptidase S16 lon domain protein  26.87 
 
 
809 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849825  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2563  ATP-dependent protease La  31.72 
 
 
807 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  26.73 
 
 
825 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  38.21 
 
 
805 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0319  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.67 
 
 
783 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  28.7 
 
 
803 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1297  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.23 
 
 
786 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000625582  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  24.68 
 
 
807 aa  115  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1288  peptidase S16 lon domain protein  28.37 
 
 
811 aa  115  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.75 
 
 
788 aa  114  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2542  ATP-dependent protease La  33.75 
 
 
805 aa  114  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.23 
 
 
843 aa  114  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.05 
 
 
805 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  25.42 
 
 
800 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000551631  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  25 
 
 
805 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  36.27 
 
 
816 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.05 
 
 
805 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  38.74 
 
 
810 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  32.87 
 
 
802 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  26.82 
 
 
570 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0925  ATP-dependent protease  24.36 
 
 
786 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.819231  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0802  peptidase S16, lon-like protein  23.66 
 
 
801 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  24.65 
 
 
814 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  32.76 
 
 
802 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>