More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2560 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  64.15 
 
 		 556 aa  694    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  65.77 
 
 		 558 aa  729    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  69.14 
 
 		 560 aa  740    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  64.47 
 
 		 557 aa  699    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  63.52 
 
 		 557 aa  699    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  69.57 
 
 		 575 aa  822    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  63.52 
 
 		 557 aa  699    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 571 aa  1158    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0492  Sigma 54 interacting domain protein  65.01 
 
 		 557 aa  741    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.335445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  63.52 
 
 		 557 aa  699    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  63.94 
 
 		 556 aa  701    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  67.02 
 
 		 579 aa  785    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  68.44 
 
 		 563 aa  769    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  64.29 
 
 		 557 aa  698    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  69.47 
 
 		 556 aa  727    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  63.72 
 
 		 537 aa  734    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  63.52 
 
 		 557 aa  699    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  71.32 
 
 		 572 aa  761    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  63.94 
 
 		 556 aa  701    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  70.41 
 
 		 558 aa  777    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  63.75 
 
 		 556 aa  699    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  58.82 
 
 		 570 aa  677    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  59 
 
 		 570 aa  675    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  69.98 
 
 		 557 aa  723    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  61.16 
 
 		 566 aa  692    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  63.52 
 
 		 557 aa  699    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  66.17 
 
 		 558 aa  744    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  42.94 
 
 		 648 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  42.08 
 
 		 650 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  43.03 
 
 		 639 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  44.49 
 
 		 652 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  45.89 
 
 		 619 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  45.89 
 
 		 619 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  41.53 
 
 		 670 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  45.21 
 
 		 655 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  31.16 
 
 		 637 aa  169  9e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  30.95 
 
 		 698 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  30.84 
 
 		 631 aa  161  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  29.55 
 
 		 731 aa  159  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  32.5 
 
 		 645 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  31.4 
 
 		 765 aa  157  7e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  29.07 
 
 		 778 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  29.82 
 
 		 638 aa  150  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  29.39 
 
 		 662 aa  150  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  30.97 
 
 		 680 aa  148  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  31.76 
 
 		 635 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  30.18 
 
 		 711 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  30.15 
 
 		 693 aa  147  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  26.78 
 
 		 632 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  39.49 
 
 		 813 aa  110  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  31.62 
 
 		 804 aa  110  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  28.74 
 
 		 805 aa  110  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  38.07 
 
 		 806 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  40.2 
 
 		 805 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  37.61 
 
 		 808 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  39.71 
 
 		 805 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  28.86 
 
 		 812 aa  107  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  33.92 
 
 		 807 aa  107  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  33.92 
 
 		 806 aa  106  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  37.5 
 
 		 812 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  33.92 
 
 		 806 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  26.99 
 
 		 812 aa  105  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  36.97 
 
 		 819 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  37.86 
 
 		 812 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  26.49 
 
 		 817 aa  105  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  28.69 
 
 		 806 aa  105  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  27.73 
 
 		 774 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  28.63 
 
 		 806 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  39 
 
 		 867 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  27.34 
 
 		 808 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  35.34 
 
 		 808 aa  103  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  37.09 
 
 		 813 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  38.31 
 
 		 816 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1732  ATP-dependent protease La  35.48 
 
 		 821 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.594571  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0407  ATP-dependent protease La  27.66 
 
 		 810 aa  102  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  36.59 
 
 		 802 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  33.62 
 
 		 793 aa  101  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  36.45 
 
 		 807 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  32.63 
 
 		 812 aa  100  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  35.48 
 
 		 812 aa  100  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  38.1 
 
 		 802 aa  100  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  36.76 
 
 		 802 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  27.53 
 
 		 809 aa  100  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  36.74 
 
 		 810 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  26.98 
 
 		 791 aa  99.4  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  27.25 
 
 		 823 aa  99  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  37.13 
 
 		 805 aa  98.6  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  38.66 
 
 		 802 aa  99  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  36.51 
 
 		 783 aa  99.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2542  ATP-dependent protease La  27.34 
 
 		 805 aa  99  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142906 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  27.68 
 
 		 791 aa  98.6  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  37.13 
 
 		 804 aa  98.6  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  26.96 
 
 		 775 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2559  ATP-dependent protease La  37.63 
 
 		 794 aa  98.6  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0097  ATP-dependent protease La  27.92 
 
 		 793 aa  98.6  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411209  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  36.41 
 
 		 799 aa  98.6  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  34.98 
 
 		 807 aa  98.6  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  27.14 
 
 		 811 aa  98.2  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  27.68 
 
 		 791 aa  98.6  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  35.75 
 
 		 815 aa  97.4  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>