More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1216 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0961  DNA-binding, ATP-dependent protease La  76.52 
 
 		 792 aa  1241    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0549  ATP-dependent protease La  62.68 
 
 		 792 aa  998    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.56565  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 791 aa  1585    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0860  ATP-dependent protease La  63.03 
 
 		 807 aa  1043    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  65.67 
 
 		 805 aa  1088    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  42.51 
 
 		 816 aa  637    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  98.99 
 
 		 791 aa  1571    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  42.86 
 
 		 817 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  43.84 
 
 		 823 aa  645    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0414  peptidase S16, ATP-dependent protease La  60.92 
 
 		 803 aa  996    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 791 aa  1585    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  65.88 
 
 		 803 aa  1088    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  42.51 
 
 		 817 aa  636    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1060  ATP-dependent protease La  66.96 
 
 		 798 aa  1072    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  43.26 
 
 		 823 aa  646    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  42.48 
 
 		 816 aa  629  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  42.71 
 
 		 819 aa  622  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  40.84 
 
 		 810 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  42.91 
 
 		 807 aa  617  1e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  40.32 
 
 		 846 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  43.2 
 
 		 800 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  41.52 
 
 		 880 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  40.18 
 
 		 812 aa  610  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  40.28 
 
 		 776 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  40.91 
 
 		 780 aa  608  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  40.79 
 
 		 808 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  40.28 
 
 		 811 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  40.86 
 
 		 820 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  40.54 
 
 		 776 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  40.54 
 
 		 776 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  40.28 
 
 		 773 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  40.28 
 
 		 776 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  40.28 
 
 		 776 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  40.54 
 
 		 776 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  40.92 
 
 		 825 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  40.28 
 
 		 773 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  40.15 
 
 		 773 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  39.95 
 
 		 807 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  40.46 
 
 		 797 aa  605  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  40.68 
 
 		 797 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  41.18 
 
 		 775 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  41.12 
 
 		 773 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  40.15 
 
 		 776 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  40.08 
 
 		 806 aa  599  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  40.68 
 
 		 802 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.76 
 
 		 784 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  40.69 
 
 		 774 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.76 
 
 		 784 aa  599  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  40.84 
 
 		 802 aa  601  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  40.08 
 
 		 806 aa  599  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.76 
 
 		 784 aa  599  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  39.97 
 
 		 806 aa  598  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.13 
 
 		 793 aa  595  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  40.72 
 
 		 786 aa  597  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0821  ATP-dependent protease LA  41.36 
 
 		 787 aa  597  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0118017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  40.71 
 
 		 804 aa  597  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.46 
 
 		 784 aa  598  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  41.22 
 
 		 778 aa  597  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  39.95 
 
 		 793 aa  597  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 806 aa  597  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  40.43 
 
 		 802 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  40.97 
 
 		 785 aa  598  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2310  ATP-dependent protease La  41.39 
 
 		 769 aa  595  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.03 
 
 		 799 aa  592  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  41.35 
 
 		 815 aa  592  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  39.72 
 
 		 796 aa  593  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  40.77 
 
 		 807 aa  594  1e-168  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  39 
 
 		 787 aa  592  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  39.72 
 
 		 811 aa  592  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  39.87 
 
 		 806 aa  594  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  39.9 
 
 		 784 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  39.9 
 
 		 784 aa  590  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.15 
 
 		 784 aa  591  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  39.9 
 
 		 784 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  39.56 
 
 		 867 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  39.9 
 
 		 784 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  39.9 
 
 		 784 aa  590  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.03 
 
 		 784 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  39.9 
 
 		 784 aa  588  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.03 
 
 		 784 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.03 
 
 		 784 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.03 
 
 		 784 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  40.23 
 
 		 805 aa  592  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  39.39 
 
 		 786 aa  590  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  39.69 
 
 		 837 aa  591  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  39.9 
 
 		 784 aa  590  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  39.36 
 
 		 811 aa  590  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  40.68 
 
 		 802 aa  591  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  39.8 
 
 		 803 aa  590  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  40.08 
 
 		 783 aa  590  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  39.24 
 
 		 818 aa  590  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  39.9 
 
 		 784 aa  590  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  39.56 
 
 		 804 aa  590  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  40.03 
 
 		 785 aa  588  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.03 
 
 		 784 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  39.64 
 
 		 785 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  39.67 
 
 		 805 aa  588  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  41.22 
 
 		 775 aa  586  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  40.03 
 
 		 785 aa  587  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  39.64 
 
 		 785 aa  587  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>