More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0961 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0549  ATP-dependent protease La  62.21 
 
 		 792 aa  972    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.56565  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  76.52 
 
 		 791 aa  1232    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  76.01 
 
 		 791 aa  1225    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0414  peptidase S16, ATP-dependent protease La  61.25 
 
 		 803 aa  1009    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  65.29 
 
 		 805 aa  1074    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  76.52 
 
 		 791 aa  1232    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  43.55 
 
 		 817 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  43.05 
 
 		 817 aa  649    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0860  ATP-dependent protease La  61.61 
 
 		 807 aa  1005    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  65.29 
 
 		 803 aa  1075    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1060  ATP-dependent protease La  65.41 
 
 		 798 aa  1057    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  44.92 
 
 		 823 aa  663    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  42.93 
 
 		 816 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0961  DNA-binding, ATP-dependent protease La  100 
 
 		 792 aa  1585    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  43.26 
 
 		 816 aa  632  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  42.86 
 
 		 823 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  44.46 
 
 		 800 aa  623  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  42.73 
 
 		 819 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  41.73 
 
 		 825 aa  619  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  42.03 
 
 		 785 aa  619  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  41.77 
 
 		 785 aa  618  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  41.43 
 
 		 810 aa  616  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  42.57 
 
 		 815 aa  617  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  42.53 
 
 		 804 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  42.15 
 
 		 783 aa  617  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  41.69 
 
 		 797 aa  617  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  42.27 
 
 		 785 aa  618  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  42.53 
 
 		 804 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0821  ATP-dependent protease LA  42.14 
 
 		 787 aa  617  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0118017  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  41.51 
 
 		 785 aa  616  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  41.65 
 
 		 785 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  41.71 
 
 		 785 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  41.46 
 
 		 786 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  41.63 
 
 		 781 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  41.71 
 
 		 783 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  41.65 
 
 		 785 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  40.61 
 
 		 880 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  41.65 
 
 		 785 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  41.52 
 
 		 785 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  41.52 
 
 		 785 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  41.78 
 
 		 785 aa  615  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  41.77 
 
 		 784 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  42.21 
 
 		 806 aa  610  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  41.52 
 
 		 785 aa  612  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  39.75 
 
 		 802 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  41.2 
 
 		 797 aa  611  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  41.77 
 
 		 783 aa  612  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  40.02 
 
 		 846 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2513  ATP-dependent protease La  41.91 
 
 		 813 aa  608  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  41.21 
 
 		 783 aa  608  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  41.45 
 
 		 785 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.69 
 
 		 784 aa  606  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  42.27 
 
 		 776 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  42.4 
 
 		 776 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  42.66 
 
 		 776 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.56 
 
 		 799 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.41 
 
 		 793 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  41.29 
 
 		 809 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.2 
 
 		 793 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1883  Lon-A peptidase  41.53 
 
 		 803 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  39.24 
 
 		 802 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  40.43 
 
 		 812 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.33 
 
 		 784 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  39.62 
 
 		 802 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.43 
 
 		 784 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  40.43 
 
 		 784 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  42.4 
 
 		 773 aa  601  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3783  ATP-dependent protease La  40.71 
 
 		 782 aa  600  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.31 
 
 		 784 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  42.27 
 
 		 776 aa  601  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.33 
 
 		 784 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.31 
 
 		 784 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  40.43 
 
 		 784 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.43 
 
 		 784 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  42.27 
 
 		 776 aa  602  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  39.67 
 
 		 787 aa  600  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  40.56 
 
 		 811 aa  600  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2563  ATP-dependent protease La  41.44 
 
 		 807 aa  602  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  40.56 
 
 		 796 aa  599  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  40.08 
 
 		 809 aa  600  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  42.27 
 
 		 773 aa  601  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  39.69 
 
 		 806 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.43 
 
 		 784 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  42.15 
 
 		 773 aa  599  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  42.27 
 
 		 776 aa  599  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  39.97 
 
 		 786 aa  600  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  42.27 
 
 		 776 aa  600  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.33 
 
 		 784 aa  601  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.43 
 
 		 784 aa  600  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.31 
 
 		 784 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1294  endopeptidase La  42.42 
 
 		 805 aa  601  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  40.23 
 
 		 802 aa  600  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.43 
 
 		 784 aa  600  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.33 
 
 		 784 aa  602  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.43 
 
 		 784 aa  599  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.31 
 
 		 784 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  42.24 
 
 		 778 aa  600  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.31 
 
 		 784 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  40.1 
 
 		 809 aa  596  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  40.18 
 
 		 805 aa  597  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>