More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0549 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  65.74 
 
 
805 aa  1059    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  43.02 
 
 
819 aa  641    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  41.42 
 
 
797 aa  642    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  62.04 
 
 
791 aa  985    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  65.95 
 
 
803 aa  1058    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  40.78 
 
 
797 aa  636    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  62.68 
 
 
791 aa  986    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  42.19 
 
 
817 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  42.57 
 
 
823 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0414  peptidase S16, ATP-dependent protease La  59.7 
 
 
803 aa  977    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  62.04 
 
 
791 aa  985    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0860  ATP-dependent protease La  62.09 
 
 
807 aa  1015    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  42.75 
 
 
810 aa  652    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0961  DNA-binding, ATP-dependent protease La  62.21 
 
 
792 aa  972    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0549  ATP-dependent protease La  100 
 
 
792 aa  1585    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.56565  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1060  ATP-dependent protease La  65.17 
 
 
798 aa  1041    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  41.64 
 
 
823 aa  643    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  41.75 
 
 
816 aa  633  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  41.88 
 
 
817 aa  632  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  42.53 
 
 
816 aa  629  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  42.97 
 
 
775 aa  629  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  41.35 
 
 
774 aa  632  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  41.6 
 
 
775 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  39.75 
 
 
811 aa  626  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  43.24 
 
 
807 aa  628  1e-178  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  40.25 
 
 
802 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  40.96 
 
 
825 aa  627  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  41.49 
 
 
815 aa  625  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  40.13 
 
 
802 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  39.75 
 
 
802 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  43.38 
 
 
800 aa  619  1e-176  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  41.48 
 
 
768 aa  621  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  41.32 
 
 
810 aa  621  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  42.09 
 
 
792 aa  621  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  40.83 
 
 
880 aa  622  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  39.52 
 
 
812 aa  620  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  40.71 
 
 
776 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  41.12 
 
 
804 aa  616  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  40.63 
 
 
776 aa  617  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  40.71 
 
 
776 aa  618  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  40.25 
 
 
815 aa  616  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  40.64 
 
 
802 aa  616  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  43.16 
 
 
776 aa  616  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  40.71 
 
 
776 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  40.73 
 
 
802 aa  618  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  40.18 
 
 
805 aa  617  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  40.59 
 
 
773 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  40.63 
 
 
776 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  39.95 
 
 
818 aa  614  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  40.91 
 
 
840 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  40.63 
 
 
773 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  40.3 
 
 
812 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  42.91 
 
 
776 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  40.68 
 
 
812 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  40.83 
 
 
778 aa  610  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  40.33 
 
 
773 aa  611  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  39.02 
 
 
780 aa  608  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  40.5 
 
 
813 aa  610  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  39.64 
 
 
815 aa  609  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  41.19 
 
 
810 aa  606  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  40.25 
 
 
776 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  40.33 
 
 
805 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  40.38 
 
 
776 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  40.86 
 
 
837 aa  608  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  40.66 
 
 
807 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  41.87 
 
 
807 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  40.48 
 
 
806 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  40.59 
 
 
773 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  39.68 
 
 
846 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  40.43 
 
 
785 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  39.62 
 
 
867 aa  602  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  40.33 
 
 
812 aa  602  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  40.1 
 
 
809 aa  600  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  40.03 
 
 
819 aa  602  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2052  ATP-dependent protease La  39.69 
 
 
798 aa  601  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155836  normal  0.0687597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  39.34 
 
 
806 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  40.56 
 
 
806 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  39.32 
 
 
805 aa  599  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  40.31 
 
 
808 aa  599  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0427  ATP-dependent protease La  40.25 
 
 
820 aa  601  1e-170  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.272294  normal  0.22143 
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  39.9 
 
 
812 aa  596  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  41.06 
 
 
804 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  40.1 
 
 
806 aa  596  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  41.06 
 
 
804 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  40.56 
 
 
806 aa  597  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  39.47 
 
 
804 aa  596  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  39.06 
 
 
798 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3494  Lon protease  39.19 
 
 
798 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1749  peptidase S16, ATP-dependent protease La  39.77 
 
 
798 aa  594  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0163826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  39.8 
 
 
810 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23590  Peptidase S16, ATP-dependent protease  39.69 
 
 
797 aa  593  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  38.78 
 
 
809 aa  592  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  39.36 
 
 
807 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02475  ATP-dependent protease La  39.08 
 
 
823 aa  594  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  39.8 
 
 
807 aa  593  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  39.32 
 
 
811 aa  595  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  39.02 
 
 
811 aa  594  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  39.24 
 
 
805 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  39.21 
 
 
805 aa  594  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1732  ATP-dependent protease La  38.36 
 
 
821 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.594571  normal  0.282215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>