More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1060 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  42.79 
 
 		 819 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  42.97 
 
 		 806 aa  637    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0860  ATP-dependent protease La  68.53 
 
 		 807 aa  1119    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  66.96 
 
 		 791 aa  1073    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  66.83 
 
 		 791 aa  1074    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  43.12 
 
 		 816 aa  642    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  43 
 
 		 802 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  73.93 
 
 		 805 aa  1218    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  43 
 
 		 802 aa  652    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  73.47 
 
 		 803 aa  1209    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  43.76 
 
 		 823 aa  651    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0414  peptidase S16, ATP-dependent protease La  63.3 
 
 		 803 aa  1054    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  66.96 
 
 		 791 aa  1073    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  42.82 
 
 		 802 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0549  ATP-dependent protease La  65.17 
 
 		 792 aa  1057    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.56565  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  42.41 
 
 		 802 aa  636    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  42.97 
 
 		 806 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  42.19 
 
 		 802 aa  637    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0961  DNA-binding, ATP-dependent protease La  65.41 
 
 		 792 aa  1072    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  42.29 
 
 		 817 aa  643    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1060  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 798 aa  1603    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  42.28 
 
 		 823 aa  643    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  42.84 
 
 		 806 aa  633  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  41.69 
 
 		 816 aa  634  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  42.84 
 
 		 808 aa  630  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  42.84 
 
 		 806 aa  631  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  42.44 
 
 		 807 aa  631  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  42.41 
 
 		 797 aa  629  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  41.69 
 
 		 817 aa  632  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  41.23 
 
 		 825 aa  625  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  41.67 
 
 		 805 aa  627  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  43.11 
 
 		 800 aa  624  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  41.17 
 
 		 810 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  40.75 
 
 		 880 aa  621  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  42.53 
 
 		 815 aa  621  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  42.98 
 
 		 820 aa  619  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  41.04 
 
 		 812 aa  618  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  41.85 
 
 		 810 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  41.47 
 
 		 797 aa  615  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  41.98 
 
 		 808 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  41.29 
 
 		 809 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  41.83 
 
 		 806 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  41.32 
 
 		 813 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  41.86 
 
 		 807 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  40.48 
 
 		 898 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  41.43 
 
 		 802 aa  614  9.999999999999999e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  40.84 
 
 		 812 aa  612  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  40.68 
 
 		 815 aa  611  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  41.54 
 
 		 812 aa  609  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  42.04 
 
 		 768 aa  610  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  41.13 
 
 		 856 aa  609  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  40.43 
 
 		 819 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  40.6 
 
 		 804 aa  606  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  41.2 
 
 		 837 aa  608  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  41.77 
 
 		 778 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  40.46 
 
 		 810 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  41.86 
 
 		 807 aa  606  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  42.13 
 
 		 823 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  41.24 
 
 		 811 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  41.14 
 
 		 806 aa  606  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  40.03 
 
 		 812 aa  606  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.57 
 
 		 793 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  41.66 
 
 		 807 aa  603  1.0000000000000001e-171  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  41.28 
 
 		 812 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  41.72 
 
 		 774 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  41.15 
 
 		 805 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  41.02 
 
 		 805 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  39.4 
 
 		 780 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  41.48 
 
 		 805 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  41.66 
 
 		 812 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  42.01 
 
 		 776 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  41.37 
 
 		 785 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  41.68 
 
 		 792 aa  600  1e-170  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  41.12 
 
 		 785 aa  599  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  40.59 
 
 		 805 aa  599  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  40.43 
 
 		 783 aa  600  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  40.81 
 
 		 804 aa  600  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  41.45 
 
 		 812 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  41.17 
 
 		 804 aa  599  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  41.09 
 
 		 815 aa  598  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  39.47 
 
 		 799 aa  598  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  41.48 
 
 		 783 aa  600  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  40.61 
 
 		 785 aa  601  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  39.38 
 
 		 846 aa  599  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.7 
 
 		 786 aa  599  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  40.69 
 
 		 805 aa  601  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.2 
 
 		 784 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  40.36 
 
 		 796 aa  598  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1732  ATP-dependent protease La  40.56 
 
 		 821 aa  596  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.594571  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  40.05 
 
 		 811 aa  597  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  40.36 
 
 		 811 aa  598  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0798  ATP-dependent protease La  41.42 
 
 		 798 aa  598  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.595986  normal  0.028237 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  40.3 
 
 		 788 aa  595  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  41.5 
 
 		 776 aa  596  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  40.03 
 
 		 867 aa  596  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  41.24 
 
 		 785 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  41.12 
 
 		 785 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  41.16 
 
 		 783 aa  597  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  40.55 
 
 		 786 aa  598  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  41.12 
 
 		 785 aa  595  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>