More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1589 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  43.98 
 
 		 819 aa  642    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  43 
 
 		 797 aa  640    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  65.71 
 
 		 791 aa  1074    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0549  ATP-dependent protease La  65.95 
 
 		 792 aa  1058    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.56565  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  65.67 
 
 		 791 aa  1077    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  43.72 
 
 		 817 aa  653    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  43.16 
 
 		 823 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0414  peptidase S16, ATP-dependent protease La  63.85 
 
 		 803 aa  1067    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  42.3 
 
 		 810 aa  635    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 803 aa  1620    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  44.24 
 
 		 816 aa  650    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  43.44 
 
 		 817 aa  656    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  65.71 
 
 		 791 aa  1074    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0860  ATP-dependent protease La  71.87 
 
 		 807 aa  1179    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  43.97 
 
 		 816 aa  656    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1060  ATP-dependent protease La  73.47 
 
 		 798 aa  1186    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  43.75 
 
 		 823 aa  656    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  92.02 
 
 		 805 aa  1513    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0961  DNA-binding, ATP-dependent protease La  65.29 
 
 		 792 aa  1075    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  44.62 
 
 		 800 aa  630  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  42.91 
 
 		 815 aa  628  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  41.21 
 
 		 825 aa  623  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  41.97 
 
 		 809 aa  619  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  41.51 
 
 		 880 aa  621  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  43.12 
 
 		 783 aa  621  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  42.77 
 
 		 813 aa  619  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  41.27 
 
 		 797 aa  621  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  43.36 
 
 		 785 aa  621  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  42.52 
 
 		 802 aa  618  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  42.16 
 
 		 792 aa  618  1e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  43.11 
 
 		 786 aa  617  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  42.21 
 
 		 781 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  42.44 
 
 		 778 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  42.12 
 
 		 810 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  42.07 
 
 		 796 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  42.64 
 
 		 802 aa  615  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  42.64 
 
 		 802 aa  615  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  42.39 
 
 		 810 aa  612  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  41.85 
 
 		 811 aa  613  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  41.6 
 
 		 811 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  42.95 
 
 		 807 aa  613  9.999999999999999e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  42.57 
 
 		 802 aa  615  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  42.07 
 
 		 811 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  42.75 
 
 		 783 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  42.14 
 
 		 775 aa  610  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  42.61 
 
 		 806 aa  609  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  42.09 
 
 		 785 aa  608  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  41.99 
 
 		 812 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  41.55 
 
 		 808 aa  610  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  41.99 
 
 		 812 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.41 
 
 		 793 aa  610  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  42.62 
 
 		 802 aa  605  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  41.71 
 
 		 785 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  41.83 
 
 		 785 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.44 
 
 		 784 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.86 
 
 		 786 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  40.45 
 
 		 780 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  41.7 
 
 		 773 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.44 
 
 		 784 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.44 
 
 		 793 aa  608  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  41.97 
 
 		 774 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  42.12 
 
 		 804 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  41.49 
 
 		 805 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  42.12 
 
 		 783 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.86 
 
 		 787 aa  608  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  41.96 
 
 		 785 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  41.57 
 
 		 816 aa  608  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  42.1 
 
 		 783 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  41.29 
 
 		 815 aa  606  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.44 
 
 		 784 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  41.61 
 
 		 810 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2302  ATP-dependent protease La  41.76 
 
 		 798 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235792  hitchhiker  0.000494744 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  40.95 
 
 		 773 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  41.04 
 
 		 776 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  41.07 
 
 		 776 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  40.92 
 
 		 776 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.29 
 
 		 784 aa  605  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  41.71 
 
 		 785 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  40.95 
 
 		 776 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  41.57 
 
 		 819 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  41.07 
 
 		 773 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1744  ATP-dependent protease La  41.76 
 
 		 798 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484284  hitchhiker  0.00114156 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  41.68 
 
 		 807 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2563  ATP-dependent protease La  41.68 
 
 		 807 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  41.65 
 
 		 804 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1904  ATP-dependent protease La  41.76 
 
 		 798 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798335  hitchhiker  0.000618765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  41.96 
 
 		 785 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  41.07 
 
 		 776 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  41.24 
 
 		 820 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  41.83 
 
 		 785 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  41.52 
 
 		 784 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  41.46 
 
 		 785 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  40.95 
 
 		 776 aa  600  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  41.24 
 
 		 785 aa  600  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  41.29 
 
 		 805 aa  601  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  40.95 
 
 		 776 aa  601  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  41.14 
 
 		 768 aa  600  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  41.44 
 
 		 804 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  41.17 
 
 		 806 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  39.77 
 
 		 818 aa  599  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>